Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,009,257 | T→C | G327G (GGT→GGC) | yedE → | UPF0394 family sulphur transport domain‑containing inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,009,257 | 0 | T | C | 97.2% | 117.8 / NA | 37 | G327G (GGT→GGC) | yedE | UPF0394 family sulphur transport domain‑containing inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (18/17); minor base A (0/1); total (18/19) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
GTTGAACCCAAAATCATGTGGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTGACATATTTGCTGT > NC_000913/2009114‑2009396 | gTTGAACCCAAAATCATGTGGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCa < 1:103573/151‑1 (MQ=255) gAACCCAAAATCATGTGGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAAt < 1:90650/150‑1 (MQ=255) aCCCAAAATCATGTGGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAAtgtg > 2:171297/1‑151 (MQ=255) ccAAAATCATGTGGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGAt > 1:158066/1‑151 (MQ=255) gtgGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACg < 2:234225/151‑1 (MQ=255) tgGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACg > 2:451531/1‑150 (MQ=255) gggCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGAt < 1:523892/151‑1 (MQ=255) ggACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTg > 2:328990/1‑150 (MQ=255) ggACCAAACGCGGCAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTg > 1:210830/1‑150 (MQ=255) gACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGc > 1:423952/1‑151 (MQ=255) gACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGc < 2:178507/151‑1 (MQ=255) aCCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCg < 1:93080/151‑1 (MQ=255) aCTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGACTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCg < 1:517826/151‑1 (MQ=255) gTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGgc > 2:311957/1‑150 (MQ=255) gTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGgc < 1:311924/150‑1 (MQ=255) tGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCt < 2:490495/150‑1 (MQ=255) gTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGc > 1:671713/1‑151 (MQ=255) gTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGc > 2:337498/1‑151 (MQ=255) gCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCTcc < 1:488996/149‑1 (MQ=255) aTCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACt < 1:10046/151‑1 (MQ=255) ggctggcGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACaa > 1:318759/1‑150 (MQ=255) gctggcGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAATGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACaaa > 2:613769/1‑150 (MQ=255) cTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACctg > 2:342609/1‑151 (MQ=255) aCCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGaaaa < 2:424003/151‑1 (MQ=255) ccGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAAc < 2:708582/151‑1 (MQ=255) ggCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCt > 2:692903/1‑151 (MQ=255) cTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCttt > 1:661205/1‑151 (MQ=255) gTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTcc < 1:266654/150‑1 (MQ=255) aCCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGAt > 1:93695/1‑151 (MQ=255) cgcgcgGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGGCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCATCCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATgg < 1:465674/151‑1 (MQ=255) cgGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTgg > 2:735445/1‑151 (MQ=255) aGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCctg > 2:728226/1‑151 (MQ=255) ccAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTg < 2:10772/151‑1 (MQ=255) actactGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTGACATAttt < 2:523623/151‑1 (MQ=255) actGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTGACATATTTGCt > 2:369204/1‑151 (MQ=255) actGGTGGGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTGACATATTTGCt < 1:375502/151‑1 (MQ=255) ggtggGTCGGCCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTGACATATTTGCtgt < 1:620610/150‑1 (MQ=255) | GTTGAACCCAAAATCATGTGGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTGACATATTTGCTGT > NC_000913/2009114‑2009396 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |