| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 752,861 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (‑66/+321) | ybgD ← / ← gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 273955 = | NA (NA) | 86 (1.490) | 65/298 | 0.0 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 752861 = | 0 (0.000) | intergenic (‑66/+324) | ybgD/gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 689045 | NA (NA) | 71 (1.230) | 63/298 | 0.0 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 752864 | 0 (0.000) | intergenic (‑69/+321) | ybgD/gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
AACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTT > NC_000913/752714‑753014 | aaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCtag < 2:817428‑M2/4‑1 (MQ=255)aaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCtag < 1:232038‑M2/4‑1 (MQ=255) tcatcaGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGgga > 2:785476‑M2/1‑146 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |