Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,243,790 | T→C | intergenic (‑138/‑120) | folE ← / → yeiG | GTP cyclohydrolase I/S‑formylglutathione hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,243,790 | 0 | T | C | 98.2% | 192.8 / NA | 56 | intergenic (‑138/‑120) | folE/yeiG | GTP cyclohydrolase I/S‑formylglutathione hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (25/30); minor base A (1/0); total (26/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.64e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATGGCATTTATGATTTCTCCTGCAGGTGTGACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCTGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCACGCATGGAAATGCTCGAAGAGCACCGCTG > NC_000913/2243646‑2243935 | aTGGCATTTATGATTTCTCCTGCAGGTGTGACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCttt > 2:44884/1‑151 (MQ=255) aTGGCATTTATGATTTCTCCTGCAGGTGTGACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCttt < 1:410055/151‑1 (MQ=255) ggCATTTATGATTTCTCCTGCAGGTGTGACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTtc < 1:704351/150‑1 (MQ=255) gATTTCTCCTGCAGGTGTGACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATcagc > 2:667363/1‑147 (MQ=255) ttCTCCTGCAGGTGTGACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGtt > 1:568912/1‑151 (MQ=255) ccTGCAGGTGTGACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTaaaa < 1:203243/151‑1 (MQ=255) ccTGCAGGTGTGACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTaaa > 1:11156/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGGTGTGACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTaaa > 2:574812/1‑150 (MQ=255) aGGTGTGACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCg > 2:854866/1‑151 (MQ=255) aGGTGTGACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCg > 1:594847/1‑151 (MQ=255) gtgACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTa < 1:633762/150‑1 (MQ=255) gACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGc > 1:535836/1‑151 (MQ=255) gCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCaaa < 1:338829/151‑1 (MQ=255) ccTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAAt < 2:288379/151‑1 (MQ=255) ccTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAAt < 2:62961/151‑1 (MQ=255) ccGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATa < 1:215344/149‑1 (MQ=255) ccGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATAc < 1:785674/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGa < 1:557048/151‑1 (MQ=255) cGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGaa < 1:423221/151‑1 (MQ=255) tGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGaa > 2:4753/1‑149 (MQ=255) ggggCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGtt > 1:726797/1‑151 (MQ=255) ggggCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGtt < 2:153866/151‑1 (MQ=255) gggCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGtt > 1:263039/1‑150 (MQ=255) gggCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTa < 2:871880/151‑1 (MQ=255) cAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACt > 1:451102/1‑150 (MQ=255) aaaGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTca < 2:781317/151‑1 (MQ=255) tattaAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGc < 1:840678/150‑1 (MQ=255) taAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGcaca < 2:263362/150‑1 (MQ=255) taAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACAt > 2:822188/1‑151 (MQ=255) aaGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACAtt < 1:301568/151‑1 (MQ=255) aaGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACAtt < 1:584935/151‑1 (MQ=255) aaGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACAt < 2:188302/150‑1 (MQ=255) tGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAAt > 1:861938/1‑151 (MQ=255) tttACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATaa > 2:631972/1‑150 (MQ=255) tattGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTAtgatga > 2:768165/1‑149 (MQ=255) tattGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATgaa < 2:339635/150‑1 (MQ=255) attGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTAtgatga > 1:760498/1‑148 (MQ=255) attGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCAGCCTTTCATCAGCAAATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGACGTGACAGTTACTAACAGCACATTGAATAAAAGGTatgatg > 2:822180/1‑147 (MQ=255) tgtgCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATgaagaa > 2:901357/1‑150 (MQ=255) gCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTg < 1:649832/151‑1 (MQ=255) tGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATTAAGAAATTGc < 2:868562/149‑1 (MQ=255) ggcgCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAacaaca < 1:652207/151‑1 (MQ=255) caTAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACAcaacaa < 2:352189/151‑1 (MQ=255) aaTCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGCTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGa < 2:342899/151‑1 (MQ=255) cAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGcc > 1:644440/1‑150 (MQ=255) cAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCa < 1:851768/151‑1 (MQ=255) cAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCa < 2:594798/151‑1 (MQ=255) gTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCACg < 1:204501/151‑1 (MQ=255) ttCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCACGCAt > 1:174157/1‑151 (MQ=255) aTAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCACGCATGGAAATGCt > 2:103684/1‑151 (MQ=255) tAATTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCACGCATGGAAATGCTc > 1:196074/1‑151 (MQ=255) aaTTATTGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCACGCATGGAAATGCTCg > 1:782330/1‑151 (MQ=255) attGTAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCACGCATGGAAATGCTCGAaga < 2:177427/151‑1 (MQ=255) tAATTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCACGCATGGAAATGCTCGAAGAGCAc > 2:118937/1‑151 (MQ=255) aaTTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCACGCATGGAAATGCTCGAAGAGCAcc > 1:67109/1‑151 (MQ=255) aaTTGCCGCCGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCACGCATGGAAATGCTCGAAGAGCAc < 1:596945/150‑1 (MQ=255) gccgccgccTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCACGCATGGAAATGCTCGAAGAGCACCGCTg > 1:516873/1‑151 (MQ=255) | ATGGCATTTATGATTTCTCCTGCAGGTGTGACGCCTCCGCCCTGCGTGGGGGCAAAGTTATTAAGCTGATTTACAGCCTGATTATTGTGCGTGAGGCGGCGCACATAATCCAGTATTCACAGCGATAATTATTGTAATTGCCGCTGCCTTTCATCAGCAGATGTTAAAACATCGTTATGCAAATACGGAAGTGAAAGTTACTCACAGCACATTGAATAAACGGTATGATGAAGAAATTGCAAACAACACAACAAGGAGCCACGCATGGAAATGCTCGAAGAGCACCGCTG > NC_000913/2243646‑2243935 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |