| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 712,946 | C→T | intergenic (‑144/‑41) | ybfF ← / → seqA | acyl‑CoA esterase/negative modulator of initiation of replication |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 712,946 | 0 | C | T | 98.3% | 217.5 / ‑4.1 | 59 | intergenic (‑144/‑41) | ybfF/seqA | acyl‑CoA esterase/negative modulator of initiation of replication |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (35/22); total (35/24) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.97e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
CATGGCAAAGTTCTTTTTTTCGCGTTGTCGGGTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCGAGAGCGCATCCGACATTTTACGGCGTATG > NC_000913/712800‑713082 | cATGGCAAAGTTCTTTTTTTCGCGTTGTCGGGTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGc < 1:867826/151‑1 (MQ=255)cATGGCAAAGTTCTTTTTTTCGCGTTGTCGGGTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGc > 1:431173/1‑151 (MQ=255) aGTTCTTTTTTTCGCGTTGTCGGGTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGt > 2:26292/1‑150 (MQ=255) aGTTCTTTTTTTCGCGTTGTCGGGTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGt > 1:601164/1‑150 (MQ=255) ttttCGCGTTGTCGGGTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCt > 2:869508/1‑150 (MQ=255) tttCGCGTTGTCGGGTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTa > 1:57004/1‑150 (MQ=255) ttCGCGTTGTCGGGTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTa > 1:187029/1‑149 (MQ=255) ttCGCGTTGTCGGGTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTa > 1:119483/1‑149 (MQ=255) cgTTGTCGGGTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGacac > 2:858596/1‑151 (MQ=255) cGGGTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGATTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcact < 2:208156/151‑1 (MQ=255) gggTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:526655/1‑151 (MQ=255) tAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAAAAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:416560/1‑151 (MQ=255) aGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:425387/1‑150 (MQ=255) aGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTCTCTGCAAGCCAGGCTTGTCGCTATCCGCTGCCGGGATTTACTCAGATACTCGTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTgggt < 2:233323/149‑3 (MQ=255) attatGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATg > 2:80457/1‑151 (MQ=255) attatGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATg > 2:407562/1‑151 (MQ=255) attatGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATg > 1:128268/1‑151 (MQ=255) tatGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGa > 1:322321/1‑150 (MQ=255) atGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaa < 1:506660/151‑1 (MQ=255) gACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa < 2:652744/150‑1 (MQ=255) tgCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg > 2:138655/1‑151 (MQ=255) ccACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:815688/151‑1 (MQ=255) gCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActct > 1:572517/1‑151 (MQ=255) caacaaATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa < 1:13979/151‑1 (MQ=255) aTAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:191089/151‑1 (MQ=255) aaGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtat < 2:614877/150‑1 (MQ=255) aaGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtat > 2:902610/1‑150 (MQ=255) aGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTatat < 2:225722/151‑1 (MQ=255) gcttATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTg > 2:194092/3‑151 (MQ=255) tttATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTgc > 2:71164/1‑151 (MQ=255) tttATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTgc > 2:591909/1‑151 (MQ=255) ttATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTgcc > 1:677852/1‑151 (MQ=255) ttATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTGGATGATGAACTCTACAGCTATATTgc < 1:754400/150‑1 (MQ=255) tCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTgccagcc > 1:464692/1‑151 (MQ=255) ccGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTgccagcc > 2:503701/1‑150 (MQ=255) ccGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTgccagcc > 2:256250/1‑150 (MQ=255) gAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCcac > 1:227873/1‑150 (MQ=255) gAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCcac > 2:857750/1‑150 (MQ=255) gTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACt < 1:579752/151‑1 (MQ=255) tttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTaa < 2:864808/150‑1 (MQ=255) tttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTaa < 2:772399/150‑1 (MQ=255) tCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGc > 1:596684/1‑150 (MQ=255) tCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGc > 1:519074/1‑150 (MQ=255) tGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCat > 1:422165/1‑150 (MQ=255) gCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCatat < 2:281750/151‑1 (MQ=255) gCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCat < 2:163254/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGc < 1:22644/151‑1 (MQ=255) aGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCg > 2:776876/1‑149 (MQ=255) ggCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCgaga < 1:857817/151‑1 (MQ=255) cTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCGAGAgc > 1:309645/1‑151 (MQ=255) aCGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCGAGAGCGCAt > 1:613050/1‑151 (MQ=255) cGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCGAGAGCGCATc < 1:455202/151‑1 (MQ=255) gCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCGAGAGCGCATcc < 1:510381/151‑1 (MQ=255) aTCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCGAGAGCGCATCCGAc < 2:499470/151‑1 (MQ=255) ccGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCGAGAGCGCATCCGACAt < 2:828493/151‑1 (MQ=255) gCCGGGATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCGAGAGCGCATCCGACATTTTAc > 1:881312/1‑151 (MQ=255) ggATTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCGAGAGCGCATCCGACATTTTACGGCg > 2:908879/1‑151 (MQ=255) aTTTATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCGAGAGCGCATCCGACATTTTACGGCGTa < 2:309619/151‑1 (MQ=255) tATTCATATACTCTTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCGAGAGCGCATCCGACATTTTACGGCGTATg < 1:571135/150‑1 (MQ=255) | CATGGCAAAGTTCTTTTTTTCGCGTTGTCGGGTTAGGGTATTATGTTGACCATTGTGCCACAGGGCTGCAACAAATAAGGTTTATTCCGAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATTGCCAGCCACACTAAGCATATCGGCGAGAGCGCATCCGACATTTTACGGCGTATG > NC_000913/712800‑713082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |