| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,187,816 | Δ15 bp | coding (2467‑2481/4224 nt) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4187816 | 4187830 | 15 | 67 [0] | [0] 66 | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4187815 | 0 (0.000) | 66 (1.400) | 59/296 | 0.0 | 100% | coding (2466/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | NC_000913 | 4187831 = | 0 (0.000) | coding (2482/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
GTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGACTCCGGTTATCGAGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAGAACTCTGT > NC_000913/4187682‑4187979 | tcatctccacccacggtgctcgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatggg > 1:209794‑M2/150‑151 (MQ=255) catctccacccacggtgctcgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatggg < 1:342310‑M2/2‑1 (MQ=255) atctccacccacggtgctcgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgggt < 1:604049‑M2/3‑1 (MQ=255) ccacccacggtgctcgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGa < 2:260417‑M2/8‑1 (MQ=255) acccacggtgctcgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACg < 2:452067‑M2/10‑1 (MQ=255) cccacggtgctcgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGt < 1:490460‑M2/11‑1 (MQ=255) cacggtgctcgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGtt > 1:150612‑M2/139‑150 (MQ=255) cacggtgctcgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTa < 1:231957‑M2/13‑1 (MQ=255) cgtaaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGc < 1:728492‑M2/22‑1 (MQ=255) aaaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTg < 1:51651‑M2/24‑1 (MQ=255) aaggtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTgcg < 2:575802‑M2/26‑1 (MQ=255) gtctggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGa < 1:408965‑M2/29‑1 (MQ=255) tggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATc > 1:636450‑M2/120‑150 (MQ=255) ggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGAt < 1:129948‑M2/30‑1 (MQ=255) ggcggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATcgc > 1:273015‑M2/119‑151 (MQ=255) ggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTa < 2:599197‑M2/36‑1 (MQ=255) ggataccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTa < 1:99519‑M2/36‑1 (MQ=255) taccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTg > 2:207459‑M2/113‑151 (MQ=255) taccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTg > 2:504251‑M2/113‑151 (MQ=255) taccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTg > 1:221418‑M2/113‑151 (MQ=255) ccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggttcccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTg < 2:223522‑M2/39‑1 (MQ=255) gcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTc < 1:448981‑M2/43‑1 (MQ=255) cactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgatgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCg > 2:608567‑M2/108‑151 (MQ=255) ctgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCgtg > 2:263534‑M2/106‑151 (MQ=255) gaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCgtgt < 2:214387‑M2/47‑1 (MQ=255) gaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCgtgt < 2:615766‑M2/47‑1 (MQ=255) aactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAAct < 1:519755‑M2/51‑1 (MQ=255) ctgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAActgc > 2:298624‑M2/99‑151 (MQ=255) 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gacgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATcc < 2:174127‑M2/88‑1 (MQ=255) cgtggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCt < 1:287198‑M2/89‑1 (MQ=255) ggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGtt < 2:221410‑M2/93‑1 (MQ=255) ggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGtt < 1:92458‑M2/93‑1 (MQ=255) ggcgcaggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGt < 2:319655‑M2/92‑1 (MQ=255) caggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCcgc > 2:503155‑M2/55‑151 (MQ=255) aggacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCcgcg > 1:421997‑M2/54‑151 (MQ=255) gacctggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCgcgc > 2:265685‑M2/52‑150 (MQ=255) ggtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACg > 2:60839‑M2/47‑151 (MQ=255) gtggttaccgaagacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACgc > 2:86337‑M2/46‑151 (MQ=255) 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agacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGa > 1:590614‑M2/35‑150 (MQ=255) gacgattgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAAc < 1:712335‑M2/118‑1 (MQ=255) tgtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAgtgg > 2:91022‑M2/28‑150 (MQ=255) gtggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAgtggtg < 1:377542‑M2/125‑1 (MQ=255) tggtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGgtgt > 2:122606‑M2/26‑151 (MQ=255) gtacccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGa < 1:196011‑M2/128‑1 (MQ=255) cccatgaaggtatcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACct < 2:570531‑M2/131‑1 (MQ=255) ggtatcatgatgGGTGGGGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACctgct > 2:417073‑M2/13‑146 (MQ=255) atcatgatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAagag < 2:384356‑M2/141‑1 (MQ=255) gatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAGAactcg < 2:461282‑M2/147‑2 (MQ=255) gatgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAGAActc < 2:238469‑M2/146‑1 (MQ=255) atgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAGAACTCTg < 1:122614‑M2/148‑1 (MQ=255) tgGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAGAACTCTGt > 1:179734‑M2/3‑151 (MQ=255) | GTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGACTCCGGTTATCGAGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAGAACTCTGT > NC_000913/4187682‑4187979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |