| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 213,341 | 0 | A | G | 46.7% | 68.5 / 22.2 | 61 | G337G (GGA→GGG) | tilS | tRNA(Ile)‑lysidine synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/28); new base G (28/0); total (33/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.55e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGTGC > NC_000913/213193‑213489 | aTGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAg < 1:597739/151‑1 (MQ=255) cACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTAc < 1:480128/150‑1 (MQ=255) ccTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCt < 2:169846/151‑1 (MQ=255) tGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGCGGGGGCGGGGAAggggga > 1:764375/1‑141 (MQ=255) gTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCtt < 2:93066/149‑1 (MQ=255) tACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCGTGGCAGTGGAAACCTTAAtt > 2:755470/1‑149 (MQ=255) aCGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGCCGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCCGGGGAgggggcaagtcta > 1:39058/1‑135 (MQ=255) cGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCGGGGGAGGGGTAAGCTTAATGCgg > 2:740633/1‑151 (MQ=255) gTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGTGGGGAGGGGAAAGCTTAAAGCggg > 2:877563/1‑151 (MQ=255) gTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGGGGGGGACAGCTTaaatcgcg > 1:229823/1‑145 (MQ=255) gTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCggg < 1:185736/151‑1 (MQ=255) tttGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGGAGTGTACAGCTTAATGCggg > 2:950323/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGa < 2:973261/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGTGGGGAGTGGACAGCTTTAACCGGGAgg > 1:110986/1‑151 (MQ=255) gggCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAgg < 1:588815/150‑1 (MQ=255) cgcgTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGat < 2:432080/151‑1 (MQ=255) gcgTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGGAGGGGACAGCTTAATGCgggggggg > 1:234374/1‑146 (MQ=255) gTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGCGGGGGGGGTACAGCCTAATTGGGGGGGGGATAtt > 1:167208/1‑151 (MQ=255) tttGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGGAGTGTACAGCTTAATGCGGGGGGCGGTAtt > 1:366285/1‑150 (MQ=255) aTCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGTGGGGAGGGTACAGATTAATACGGGGGGCGAGATTTGccccc > 1:249992/1‑149 (MQ=255) cTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGTGGGGAGGGGTAAGCCTAAATCGGGGGGCGATAtttcgcctcccgctg > 1:34271/1‑136 (MQ=255) tATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCGGGGGAGGGGACAGCTTAATTCGGGAGGCGATATTTGCCCCCCGC‑Gt > 2:300885/1‑147 (MQ=255) cAGTCGCTACTGAGGTGGATTCAAACCGTCGCCGGGCAAAGAGAAATCATTGTGGCGTGGCAGTCGTGGCGTCCAGCGCAGTAATTACCTGG‑GGGGCTGGGAAGTGTACAACTTAATGCGGGGGGCGATATTCGCCCTCCGC‑Gtacggcg < 1:516300/150‑7 (MQ=255) cAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGAACAAAGCGAAAACAATGTGCCGTGGCAGACATGGCTTCAACCGCTGGAATTGCCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGAc < 1:226423/150‑1 (MQ=255) aGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGTGGGGAGGGGAAAGCTCAATTCGGGGGGCGACATTCGccccc > 1:528825/1‑136 (MQ=255) gTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑aa < 2:568387/151‑1 (MQ=255) cAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGTGGGGAGGGGACAGCTTAATGCGGGGGGGGATATTCGCCCTCCGC‑GGGCAGACG‑AAGCgg > 2:944402/1‑151 (MQ=255) aCTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGTGGGAAGTGTACAGCTTAATTCGGGAGGGGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCgg > 2:828652/1‑149 (MQ=255) gtggtgGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAgc < 1:656877/151‑1 (MQ=255) tAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGGAAGGTACAGCTTAATTCGGGGGGGGATATTCGCCCCCCCC‑GTGGAGACG‑AAACGGGGAGC‑GGGCGgttt > 1:318427/1‑150 (MQ=255) cGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAgcg < 2:511130/151‑1 (MQ=255) gTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGGAGGGTACAGCTTAATGCGGGGGGGGGTATTTGCCCCCCCC‑GTGCAGACG‑AAGGGGGCCGC‑GGGCGGTTTAAAgcgc > 2:647152/1‑151 (MQ=255) cGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGGAGGGGACAGCTTAATGCGGGGGGGGGTATTTGCCCTCCGC‑GGGCAGACG‑GAGCGGTCAGC‑GGGCGGTTCAAAACGCCAgg > 2:281599/1‑150 (MQ=255) gggCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGTGGGGAGTGGAAAGCTTAATGCGGGGGGCGGTATTTTCCCTTCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGGCCGC‑GTGCGGTTCAAAGCGCCAgg > 1:820843/1‑149 (MQ=255) gggCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGAt < 2:556676/151‑1 (MQ=255) aaGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATtgctg < 2:928749/151‑1 (MQ=255) cGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTTGGGAGAGTACAGCGTAATGAGGGGGGGGGTATTCGCCCCCCGC‑CTGCCGACG‑AAGCGGGCAGC‑GGGGGGTTCTAAACGCCCgggat > 1:323768/1‑141 (MQ=255) aaaaCATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGAGGGGAGGGGGCAGCTTAATATGGGGGGCGGTATTTCTCCCCCCC‑GGGTAGGCG‑CAGGGGGACGC‑GTGCGGTTTAAAACCCCCGGActgctg > 1:66743/1‑146 (MQ=255) aaaaCATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCatat < 2:688621/151‑1 (MQ=255) aaaCATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATAtt < 2:633046/151‑1 (MQ=255) gtgCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGCCGGGAGCGGAAAACGTAAAGTGGGGGGGGGCATTTTCCCCCCCC‑GCGGA‑ACGCAAGGGGTCAGC‑GGGCCCTTCAAAACGCCAGGGCTGCTTCACATTGtttggg > 2:922086/1‑146 (MQ=255) gtgCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCggg < 2:181939/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCg < 2:593700/150‑1 (MQ=255) ccGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGGAGTGGACAGCTTAATGCGGGGGGGGATATTTGCCCTCCCC‑GGGCAGACG‑AAACGGGCAGC‑GGGCGGTTTAAAACGCCAGGGTTGCTGCATATTTTTggggg > 2:65403/1‑147 (MQ=255) tGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGTGGGGAGGGGACAGCTTAATGCGGGAGGGGATATTTCCCCCCCCC‑GGGCAGACG‑AAGCGGGCAGC‑GGGCGTTTTCAAACGCCCGGATTGCTGCCAATTTTCGGGCGGAAcg > 1:462270/1‑151 (MQ=255) gACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGGAGGGTACAGCTTAATGCGGGGGGCGGTATTTGCCCCCCCC‑GTGGAGACG‑AAGCGGTCCGC‑GGGCGGTTCAAAAAGCCCGGGATGCTGCCAATTTTCGGGGGGAAcggcg > 1:541470/1‑149 (MQ=255) gACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGa < 2:449794/151‑1 (MQ=255) gTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGt < 1:195670/151‑1 (MQ=255) tGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGCCG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGt < 2:637978/150‑1 (MQ=255) cTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGCGGGGAGTGGAAAGCTTAATTCGGGGGGCGCTATTTGCCCCCCCC‑CGGCAGACG‑AAAGGGGCAGCGGGGGGTTTCAAAAGCCCAGG‑TTGCTGCAATTTGTTGGGGGTTAaggcg > 1:600367/1‑142 (MQ=255) tCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGGAGTGGTCAGCCTTATGAGGGGGGGGTTATTCGCCCTCCCCGGTGC‑GAGG‑AAACGGGTAGC‑GGGGGGTTCAAAGCGCCCGGAATGCTGTATTTTTTCGGGGGGAAAggcgggcg > 1:921379/1‑144 (MQ=255) cAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTaa < 1:496497/151‑1 (MQ=255) aaCCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGTGGGGAGGGTACAGATTAATCGGGGAGGGGATAATCGCCCTCCGC‑GGGGGGACG‑AAGCGGGCAGG‑GGGGGGTTCAAAACGCCCGGATTGTTGCATATTTTCGGGGGGAACGGGGGGCgcg > 2:204807/1‑142 (MQ=255) gCTGGAATTACCGGC‑GGGGGTGGGGAGGGTTAAGCCTAATTCGGGGGGGGATATTTGGCCCCCCC‑GGGGAGACG‑AAGCGGGCAGG‑GTGCGGTTCTAAAAGCCAGGATTGGTGGATATTTTTGGGGGGGACGGGGGACGCTAGCTaaaaaa > 1:498455/1‑150 (MQ=255) gCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGaaa < 2:658593/151‑1 (MQ=255) gc‑ggGGCTGGGAAGTGCACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGc < 2:777163/151‑1 (MQ=255) ggggCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTg < 1:243241/151‑1 (MQ=255) gggAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGTg > 2:564363/1‑151 (MQ=255) gggAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCAAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGca < 1:820536/149‑2 (MQ=255) ggAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGt > 1:675984/1‑149 (MQ=255) ggAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGTgc < 1:279564/151‑1 (MQ=255) | ATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGC‑GTGCAGACG‑AAGCGGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCAGGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGTGC > NC_000913/213193‑213489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |