| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 17,050 | 0 | A | C | 45.8% | 110.6 / 13.8 | 75 | intergenic (‑90/‑439) | mokC/nhaA | regulatory protein for HokC, overlaps CDS of hokC/sodium‑proton antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/10); new base C (0/33); total (29/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.63e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAG > NC_000913/16906‑17196 | ctctctTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACccgcc > 2:993887/1‑151 (MQ=255) tctctTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACccgcc > 2:115758/1‑150 (MQ=255) tcttctCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCt > 2:396364/1‑151 (MQ=255) ccTTGCCCTTAGGGTCAGAAAGGGGCCCTCTAAATGTTTCCAGAATATGGGGGGCCTGGGGTTGATGATAAAATAT‑CACGCGGGGTTTTTCTCTCTCCGCCT‑TTCAAATATGGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCCCCCGCCGCtatta < 1:512992/149‑1 (MQ=255) cTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTatat > 2:189376/1‑151 (MQ=255) ttGACCTTACGGTCAGTAAGAGCCACTCTACATGTGTTCAGCATATGGGGGGCCTGGGTTTGATGTAAAAATAT‑CCCTCGGGTTTTTTCTCTACCGCCCT‑TTAAGTAAATGCCTAAGACAGCCACCCTCAAGCCCCCGCCGCtattat < 1:332168/148‑1 (MQ=255) ttACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGctctc > 2:640064/1‑151 (MQ=255) cGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCttt > 1:920027/1‑151 (MQ=255) ggTCAGTAAGAGGCCCTCTACATGTTTTCAGCTTATAGGAGCCCTGGGGTTGATGTAAAAATAC‑CCCTGGGGTCTTTTCTCTACCTCCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACACCCACAACCCCCCGCCGCTATTATATCGctct < 2:992615/146‑1 (MQ=255) ggTCAGTAAGAGGCCCTCTACATGTTTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTGGATGAAAAAATAT‑CCCGCGGGTTTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCtt < 2:491421/149‑1 (MQ=255) ggTAAGTAAGAGGCCCTCTACATGTTTTCAGCATATAGGAGGCCGGGGGTTGATGGAAAAATAT‑CCCTCGGGGTTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACACCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTa < 2:920077/151‑1 (MQ=255) cAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAAcc > 1:844172/1‑151 (MQ=255) aGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAAccc > 1:402708/1‑151 (MQ=255) aaGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCAtt > 1:481294/1‑151 (MQ=255) aaGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCAtt > 2:607828/1‑151 (MQ=255) agGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTg > 1:315195/1‑151 (MQ=255) agGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTg > 1:556065/1‑151 (MQ=255) ggCCCTCTACTTGTTTTCAGAAAATAGGGGGCCTGGGTTTGATGAAAAAATAT‑CCCTGGGGTTTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCGGAGAAAGACAGCCTAAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTg < 2:4221/150‑1 (MQ=255) ccctctACATTTGTTCAGCATATGGGAGCCCTGGGGTTGATGTAAAAATAT‑CCCGGGGGTTTTTTCTCTATCTGCCT‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACACCCTAAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGttt < 2:312530/149‑1 (MQ=255) aCATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTGTTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCg > 2:471086/1‑150 (MQ=255) tgttTTAAGCATATAGGAGGCCTGGGTTTGATGAAAAAATAC‑CCCTCGGGTTTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACACCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGAt < 2:732704/149‑1 (MQ=255) tgtTCAGAATATGGGGGGCCTGGGGTTGATGAAAAAATAT‑CCCGGGGGTTTTTTCTCTTCCTCCCT‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACACCCTAAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGAtt < 1:195578/148‑1 (MQ=255) tgtTCACCATAGAGGGGCCCTCGGTTTGATGAAAAAATCT‑CCCTCGGGTTTTTTCTCTATCTGCCT‑TTCATCTAATCCCGGAGACAGACACCCTAAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGtt < 1:557064/139‑1 (MQ=255) tgtTAAGCATATGGGAGGCCTGGGTTTGATGAAAAAATAT‑CCCTGGGGTTTTTTCTCTATCTCCCT‑TTCAGTAAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCt < 1:262493/150‑1 (MQ=255) ttCAGCATATAGGAGGCCTGGGGTTGATGAAAAAATAC‑CCCGGGGGTTTTTTCTCTATCTGCCT‑TTCAGCTAATGCCTGAGAAAGACACCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTa < 2:556099/149‑1 (MQ=255) ttCAGAATATAGGAGGCCGGGGTTTGATGAAAAAATTT‑CACGGGGGTTTTTTCTCTTTCTCCCG‑TTCAACTAATCCCTAAAAAAGCCAGCTTCAATCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCg < 1:985249/143‑1 (MQ=255) caacATAAAGGAGGCCTGGGGTTGATGGTAAAATTC‑CCCGCGGGTTTTTTCTCTATCGGCCT‑TTCAGTTAATCCGTGAGAAAAACCGCCTCAACCGCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATc < 2:1054411/147‑1 (MQ=255) atataggggaggCCGCGGGTTTTTAGAAAAATAT‑CCCGCGGGTCTTTTCTCTTCCTCCGG‑GTCATTTAGGGCCAGAACAAGAGACCCGAAATCGCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTg < 2:901647/144‑1 (MQ=255) tatgggtggccttggTTGTAGGGAAAATATACACGCGGTGTTTTTCTCTATCTGCTT‑TTCATCAACTGCCGGAAACACACCTTCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTGAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCt < 1:594484/134‑1 (MQ=255) aggCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCt > 2:342695/1‑151 (MQ=255) ggCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTc > 1:782111/1‑151 (MQ=255) cccggggTTGATGAAAAAATAT‑CCCCCGGGGTTTTTTTCTTTCTCCTT‑TCCAGCTAAGGCCTGAGACAGCCACCCTAAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGAc < 1:490789/140‑1 (MQ=255) ccTGGGGTTGATGTAAAAATAC‑CCCCCGGGTTTTTTCTTTATCTCCCT‑TTCAGCTAATCCCTGAAACAGACACCCTAAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCg < 1:640023/150‑1 (MQ=255) ctggggTTGATGAAAAAATAC‑CACTCGGGTTTTTTTCCCCTCTGCTT‑TACAATTAATCCCGGAGACAAACACCCCCACCCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCt < 2:280989/144‑1 (MQ=255) cGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCAtt > 1:815464/1‑151 (MQ=255) ggtttGATGGAAAAATAC‑CCCGGGGGGCTTTTCTTTATC‑GCCGTTTCAGCTACTCCCCAAGACGGCCACCCTCACCCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCAt < 2:215593/146‑1 (MQ=255) gggTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCAttt > 2:492348/1‑151 (MQ=255) gggTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCAttt > 2:998308/1‑151 (MQ=255) gggTGGATGTAAAAATAT‑CACCCGGGTTTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACACCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCAttt < 2:434366/151‑1 (MQ=255) gtttaaggaaaaaaTAC‑CACGCGGGGTTTTTCTCTTTCTCCCG‑TTCAGAAAATGCCGGAAACAGCCCCCCAAAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACACCt < 2:121776/133‑1 (MQ=255) gTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCAttttt > 2:407416/1‑151 (MQ=255) tggaggaaaaaaTAT‑CCCGGGGGGTTTTTCTCTACCTGCCG‑TTCAGCTATTGCCTGAGAAAGCCACCCACAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCAtttt < 2:445828/141‑1 (MQ=255) tGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTtgt > 1:163476/1‑151 (MQ=255) tGGAAAAAAAT‑CCCCGGGGGCTTTTCTCTTTCTGCCT‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTtgtg < 2:518334/149‑1 (MQ=255) tAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGt > 1:585146/1‑150 (MQ=255) aaaaTAT‑CCCCGGGGTTTTTTCTCTTTCTGCCT‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACACCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGt < 2:809488/149‑1 (MQ=255) aaaaTAA‑CCCGCGGGTTTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTATTGCCGGAGACAGACGCCCTAAGGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGt < 2:829125/149‑1 (MQ=255) ccctggggttttttCTCTTTCTGCCT‑TTCAGCTAATGCCGGAGAAAAACACCTTAAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAAttt < 1:189357/137‑1 (MQ=255) cACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAAtttttt > 2:1041360/1‑150 (MQ=255) gggttttttCTCTACCTCCCG‑TTCAGCTATGGCCTGAAACAGACATCTTAAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAAtttttt < 1:251449/140‑1 (MQ=255) ggggTTTTTCTCTTTCTCCCT‑TTCAGCTAAGCCCTGAGACAACCAGCCACAACCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATg < 1:656163/149‑1 (MQ=255) ttttctACCTGCCG‑TTCAGCAAATGCCTGAGACAGAAACCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAatt < 2:450052/147‑1 (MQ=255) ttCTCTATCTGCGT‑TTCACTAAATCCCTGAGACAAACGCCCCCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAatt < 1:378141/150‑1 (MQ=255) tctATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTAttt > 2:182382/1‑151 (MQ=255) tATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTa > 1:350399/1‑150 (MQ=255) aTCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAAc > 1:1044569/1‑151 (MQ=255) ccG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTa > 1:356403/1‑150 (MQ=255) ccG‑TTCAGCTAAGCCCGGAGACAGCCACCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAattatt < 2:481314/142‑1 (MQ=255) 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cTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTAtctc > 1:1072575/1‑151 (MQ=255) ccTGATACACACCCCCTAAACCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATc < 1:165626/151‑1 (MQ=255) gagaCAGACACCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCa < 1:308394/151‑1 (MQ=255) agaaagccAGCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTc < 2:596410/144‑1 (MQ=255) acaaacaccctacaccACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAatt < 2:252658/136‑1 (MQ=255) agccacccccAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAatt < 2:148047/140‑1 (MQ=255) cgCCCCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTga < 1:41990/149‑1 (MQ=255) agCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTgac > 2:931989/1‑151 (MQ=255) cTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTgacgac > 2:147070/1‑151 (MQ=255) actcACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCTCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTgacga < 1:231326/144‑1 (MQ=255) aaccACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAg < 2:239858/148‑1 (MQ=255) aaGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAg < 1:454553/151‑1 (MQ=255) | CTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATAT‑CACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCG‑TTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAG > NC_000913/16906‑17196 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |