| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 753,125 | 0 | T | A | 45.3% | 76.1 / 49.5 | 75 | intergenic (‑330/+60) | ybgD/gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/11); new base A (0/34); total (30/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.47e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATACCGTCACTGTGCA > NC_000913/752977‑753273 | aTTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCAtata > 2:213164/1‑150 (MQ=255)aTTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATaa < 1:781794/151‑1 (MQ=255) ttttCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATaa > 2:758834/1‑150 (MQ=255) cATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAAt < 1:669735/150‑1 (MQ=255) aTAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATc > 2:313451/1‑150 (MQ=255) aTAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATc > 1:456756/1‑150 (MQ=255) aTAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCa < 2:267467/151‑1 (MQ=255) tAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCa > 2:774988/1‑150 (MQ=255) gggTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 1:327806/1‑151 (MQ=255) cGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAAc > 2:831332/1‑151 (MQ=255) tACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGATGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAAcggcg > 2:1035623/1‑151 (MQ=255) gAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTa > 2:1025848/1‑150 (MQ=255) aattttttAATTGAAA‑GTTTTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTTTTCTTTTTTTTTTAAATATCTATATAGGTCTTTTAATGGTTTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TTTTAAGGAATATAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTaaa < 2:771079/148‑1 (MQ=255) aaGTTTTAAATTGAAA‑GAATGGGTTGGCTAATTGTTTGGGTTGTTCTTTTTTTTTAAAATATCTAAATAGGTCTTTAAATGGATTTTATTTTGA‑AAATTTTTGG‑TGTTTAGGCAAAAAAAAAACAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTaag < 1:402045/151‑2 (MQ=255) tttttAATTAAAA‑GTATTGGGTTGCTGATATTTTGAGCTGTTCTATTTTTTTTAAATATCTATATAGGTCTTTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTaaaa < 2:84850/149‑1 (MQ=255) ttttAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTaaaa > 1:1033388/1‑148 (MQ=255) tttaaatttaaatGTATTGGTTTAGTTATAGTTTGCGTTGTTTTATTCTTTTAAAAAATTTATATGGGTAT‑TTAAAGGTTTTTTTTTTTACCATTTTTTTT‑TTTTTGGGCTTATAAAAAACACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAat < 2:357760/150‑1 (MQ=255) tAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATAttt > 1:131730/1‑150 (MQ=255) aTTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTTAAAATTAga > 1:186001/1‑148 (MQ=255) tggtttcttGATAATTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTAAAATATTTTTATAGTTCTGTTAATGGTTTTTTTTTTTA‑CAATTTTTTG‑TTTTTGGGCATATAAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAAt < 2:427646/142‑1 (MQ=255) tGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAAt > 1:118117/1‑150 (MQ=255) gggTTGTTGATATTTTGAGCTTTTCTTTTTTTTTAAAATATCTATATAGGTTTTTAAATGGTTTTTTTTTTTA‑CATTTTTTTG‑TTTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAAt < 2:971857/149‑1 (MQ=255) gggTTGCTAATAATTGGGGTTTTTTTATTTTTTTTAAATATAAAAATAGGTCTTTTATTGATTTTTTTTTTTA‑CATTTTTTTG‑TTTTTAGACAAAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATc < 1:403730/150‑1 (MQ=255) ttGCTGATAATTTGAGCTTTTCTTTTTTTTTTAAATATCTATATAGGTTTTTTAATGGATTTTTTTTTTA‑CATTTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCaa < 2:739375/149‑1 (MQ=255) aTAATTTGAGCTTTTTTATTTTTTTAAAATACTTATATGGTTTTTTAAATGATTTTTATTTTAA‑TATTTTTTTT‑TGTTAAGGCAAATAAAAATAACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTa < 2:930654/149‑1 (MQ=255) tAATTTGAGCTTTTCTTTTTTTTTAAAATATTTTTATGGGTCTGTTAAGGTATTTTATTTTTA‑AAATTTTTTG‑TTTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTaa < 2:301790/149‑1 (MQ=255) attttGAGCTTTTTTATTTTTTTAAAATATCTAAATAGGTCTGTTAATGAATTTTTTTTTTA‑CATTTTTTTG‑TTTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTaa < 2:649721/146‑1 (MQ=255) aaTTTGAGTTGTTCTTTTTTTTTAAAATATCTATATAGTTCTGTTAATGTATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TTTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACg < 2:198460/150‑1 (MQ=255) tttGTGCTTTTTTTTTTTTTTTAAATATTTAAATGGTTTTGTTAATGAATTTTATTTTTA‑AATTTTTTTG‑TTTTAAGAAATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCAt < 1:28513/143‑1 (MQ=255) tttGAGTTTTTTTTTTTTTTTAAAATTTTTATATAGTTTTTTTAATGGATTTTATTTTTA‑CATTTTTTTG‑TTTATAGGAAAAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAAc < 1:930371/147‑1 (MQ=255) ttggtttttttttttCTTTTAAAATTTTTATATATTTCTTTTAATGTTTTTTTTTTTTA‑CAATTTTTTG‑TTTGTAGGAATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACg < 1:680405/134‑1 (MQ=255) gagtttttCTATTTTTTTTAAATATTTATATAGTTTTTTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGAATATAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCtt < 2:906777/142‑1 (MQ=255) ttttttttttttttaAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTTTTTTTA‑AAATTTTTTG‑TGTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGata < 2:862263/138‑1 (MQ=255) tGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAAATTTGCAAACAACAATTAACACTTGATCTCg > 1:280681/1‑151 (MQ=255) tttttttttttttAAATATCTATATAGTTTTTTTAATGGATTTTATTTTTA‑AAATTTTTTG‑TGTTTAGGAAAAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCg < 1:911044/141‑1 (MQ=255) ttttttttttttaAAATATTTATATGGGTTTTTTAATGGATTTTTTTTTTA‑CAATTTTTTG‑TTTTTAGGAATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGc < 2:665742/142‑1 (MQ=255) ttCTATTTTTTTTAAATATCTATATAGGTCTTTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCg < 2:43424/149‑1 (MQ=255) tCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCtt > 2:1025076/1‑151 (MQ=255) ttCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGTTTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAGTCAACCCGCCATATGAACGGCGGGGTTAAATTTTTTCAACTTAAAAATAAAACAATAACGCTTGAAATCTCttt > 1:605357/1‑148 (MQ=255) tttttttAAATATTTATATAGTTTTTTAAATGTTTTTTTTTTTTA‑CATTTTTTTT‑TTTTTAGAAAAAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTaa < 1:831288/148‑1 (MQ=255) tCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGGTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTaa > 2:1306/1‑150 (MQ=255) tttttAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTTAAATATTTACAACTTAACAATCAACCATTAACGCTTGATATCTCTTTTaaa > 1:66696/1‑149 (MQ=255) taaaaTATTTATATAGGTCTTTTAATGTATTTTTTTTTTA‑AATTTTTTTG‑TTTTTAGGCATAAAAAAATAAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTc < 1:807044/147‑1 (MQ=255) attatCTATATAGGTTTGTTAATGTATTTTTTTTTTA‑CAATTTTTTG‑TTTTTAGATATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTcg < 1:831546/145‑1 (MQ=255) tatCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTTAAATATTTACAACTTAGCAATCAAACATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGtttt > 2:83319/1‑151 (MQ=255) atataGGTTTTTTAATGTTTTTTTTTTTTA‑CATTTTTTTG‑TTTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGtttt < 1:427330/146‑1 (MQ=255) ataGGTTTGTTAATGTTTTTTATTTTTA‑AATTTTTTTG‑TTTTTAGACTAAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCata < 1:112593/149‑1 (MQ=255) taGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTATAAATTAACAATCAACCATTAAAGCCTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGtttttta > 1:118125/1‑144 (MQ=255) aGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTTCAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATcc > 1:925556/1‑150 (MQ=255) ggTTTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑AATTTTTTTT‑TGTTTAGGCAAATAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGttttt < 2:27957/142‑1 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTTAAATATTTACAAATTAGCAATCAACCATTAACGCTTGGTATCGCTTTTTAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGt > 1:908381/1‑151 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTCAAATTTTTTCAACTTAGCCATCAACCATTAACGCTTGGTATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCt > 2:873310/1‑149 (MQ=255) tttGTTAATGGTTTTTTTTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCAAAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGt < 2:626371/148‑1 (MQ=255) ttttAATGGTTTTTATTTTTA‑CAATTTTTTT‑TTTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGtat < 2:78944/148‑1 (MQ=255) tGTTAAGGGTTTTTTTTTTTA‑AATTTTTTTG‑TGTTTAGGAAAAAAAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGta < 1:1073724/149‑1 (MQ=255) aaTGGTTTTTATTTTTA‑AAATTTTTTG‑TGTTTAGGAATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAg < 1:774945/150‑1 (MQ=255) aaTGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TTTTTAGGAATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAg < 2:999155/150‑1 (MQ=255) aaTGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAAATTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTTATATCCTGt > 1:861523/1‑144 (MQ=255) aTGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTTAAATATTTACAAATTAGCAATCAACCCTTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGc > 1:404023/1‑150 (MQ=255) ggATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCt > 2:1010333/1‑149 (MQ=255) ttttttttttA‑AATTTTTTTG‑TTTTTAGGTATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGAcg < 2:728427/150‑1 (MQ=255) tttttttttt‑TAATTTTTTGTTTTTTAGAAAAAAAAAAACAAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGa < 1:742773/148‑1 (MQ=255) ttattttTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCgg > 2:521783/1‑151 (MQ=255) tttaA‑CATTTTTTTG‑TTTTTGGGCAAAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACg < 2:517147/150‑1 (MQ=255) aaaaTTTTTTT‑TGTTTAGGAATAAAAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCa < 1:518194/148‑1 (MQ=255) atttttttt‑tttttAGTAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCaa < 2:544624/147‑1 (MQ=255) ttttttt‑tGTTAAGGAATAAAAAAAACAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATc < 1:25563/149‑1 (MQ=255) ttttG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTTAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCtt > 1:189343/1‑149 (MQ=255) tttG‑TGTTTAGTAATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCa < 1:520171/150‑1 (MQ=255) ttG‑TGTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCAt < 2:458414/150‑1 (MQ=255) tttttAGAAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATa < 1:368246/146‑1 (MQ=255) tgtTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAACAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTTAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATAcc > 1:47265/1‑150 (MQ=255) tttAGGAATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATACCGt < 1:758790/150‑1 (MQ=255) tttAGGAAAAAAAAAAACACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATACCg < 1:313905/149‑1 (MQ=255) gCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGGTTTTCATATCCTGTATACAGCTGa > 2:344056/1‑120 (MQ=255) cATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATACCGTCACtgt > 2:520810/1‑150 (MQ=255) ataAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGAcgc < 1:344036/119‑1 (MQ=255) ataAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATACCGTCACTGTGCa < 1:724996/150‑1 (MQ=255) | ATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAA‑GTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTA‑CAATTTTTTG‑TGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATACCGTCACTGTGCA > NC_000913/752977‑753273 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |