| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,810,080 | Δ1,165 bp | [ygaZ]–[mprA] | [ygaZ], ygaH, [mprA] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2810080 | 2811244 | 1165 | 69 [1] | [1] 68 | [ygaZ]–[mprA] | [ygaZ], ygaH, [mprA] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2810079 | 1 (0.020) | 66 (1.080) | 61/298 | 0.1 | 98.5% | coding (463/738 nt) | ygaZ | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
| ? | NC_000913 | 2811245 = | 1 (0.020) | coding (476/531 nt) | mprA | transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux | |||||
ATCGCCGCTGCCTGCATCTGCAATTAACGGAAAAAGGTCACGAGTTTTTGCGCGAGGTTTTACCACCGCAGCATAACTGCCTGCATCAACTCTGGTCCGCGCTCAGCACAACAGAAAAAGATCAGCTCGAGCAAATCACCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGCAGGTCGGCTC > NC_000913/2811095‑2811393 | tgcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgt > 1:374686‑M2/151‑151 (MQ=255) gcaaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgt < 2:1492‑M2/1‑1 (MQ=255) caaaaatcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgtct > 2:811951‑M2/149‑151 (MQ=255) aaaaatcgaaaaccgcccggtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgtctc < 2:658367‑M2/4‑1 (MQ=255) aatcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCg < 2:339012‑M2/7‑1 (MQ=255) atcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGt > 2:130817‑M2/144‑151 (MQ=255) aaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCg > 1:617154‑M2/139‑150 (MQ=255) aaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGa < 2:342624‑M2/13‑1 (MQ=255) ccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCa < 1:672258‑M2/16‑1 (MQ=255) cctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATg > 1:748657‑M2/132‑151 (MQ=255) gtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATgg < 2:174545‑M2/21‑1 (MQ=255) ggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACa > 2:341505‑M2/126‑150 (MQ=255) ggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGgtg < 2:430748‑M2/33‑1 (MQ=255) ggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGgt < 2:695305‑M2/32‑1 (MQ=255) ctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTgg > 2:686078‑M2/116‑151 (MQ=255) gaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGa < 2:377514‑M2/43‑1 (MQ=255) gaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAg < 1:534360‑M2/45‑1 (MQ=255) ttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATg > 1:540774‑M2/102‑151 (MQ=255) ttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATg > 1:895478‑M2/100‑149 (MQ=255) cgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTa > 1:256072‑M2/96‑150 (MQ=255) gcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAcgc > 1:498614‑M2/92‑150 (MQ=255) caaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGt > 2:174570‑M2/91‑151 (MQ=255) caaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGt > 1:282235‑M2/91‑151 (MQ=255) 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aataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAg < 2:600609‑M2/81‑1 (MQ=255) aatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGAtt < 1:2847‑M2/84‑1 (MQ=255) tcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGAttt > 1:505439‑M2/66‑150 (MQ=255) cgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTtat < 1:28776‑M2/87‑1 (MQ=255) cccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTtat > 2:26254‑M2/64‑150 (MQ=255) 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ggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGCAGGt > 1:560117‑M2/9‑151 (MQ=255) gtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGCAGGTc < 2:282149‑M2/144‑1 (MQ=255) tttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGCAGGTCGGc > 1:663100‑M2/5‑151 (MQ=255) ttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGCAGGTCGGc > 2:455931‑M2/4‑150 (MQ=255) tctcCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGCAGGTCGGCTc > 2:558742/1‑149 (MQ=255) | ATCGCCGCTGCCTGCATCTGCAATTAACGGAAAAAGGTCACGAGTTTTTGCGCGAGGTTTTACCACCGCAGCATAACTGCCTGCATCAACTCTGGTCCGCGCTCAGCACAACAGAAAAAGATCAGCTCGAGCAAATCACCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGCAGGTCGGCTC > NC_000913/2811095‑2811393 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |