| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,001,918 | 0 | A | C | 49.1% | 91.5 / 11.9 | 59 | intergenic (‑129/+192) | fliA/fliC | RNA polymerase, sigma 28 (sigma F) factor/flagellar filament structural protein (flagellin) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (25/5); new base C (1/28); total (26/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGC > NC_000913/2001768‑2002066 | cAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGaaaaaaa < 2:513116/151‑1 (MQ=255) cGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAAccc < 1:22372/151‑1 (MQ=255) gTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCccg < 1:767603/151‑1 (MQ=255) agagTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCgg > 1:559566/1‑151 (MQ=255) gTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTgg > 1:646207/1‑151 (MQ=255) tGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAAGGAGGGGTTATTTGGGGTTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTgg < 2:108696/150‑1 (MQ=255) atttCACGATAAACAGCCCTGCTTTATATGAGTTAGCGGCATGATTATCCGTTTCTGCGGGTTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAAGGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGATAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTgg < 2:554090/146‑1 (MQ=255) aaTTCACGATAAACAGCCCTGGTTTATATGAGTTTTCGGTATGATTTCCCGTTTCTGCAGGTTTTTTAACCGGACGATTAGGGGGTAAAAGGAGGGGTTTTTTGGGGGTTAAGGGTAAATCCCAGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGc < 2:478183/149‑1 (MQ=255) aaTTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCgg > 1:691342/1‑151 (MQ=255) ttCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGTTTTTTAAGCGGACGATTAGTGGGTAAAATGGGGGGTTATTTGGGGTTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAACCCCCGCCGGTGGCggg < 2:512306/150‑1 (MQ=255) ctAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTCTCGGCATGATTATCCGTTTCTCCCGGGCTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGCGGCGGGGAAGCAc > 2:128743/2‑151 (MQ=255) aTAAACAGCCCTGCTTTATATGATTTATCGGAATGTTTATCCTTTTCTGCGGGTTTTTAAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGGGGGTTTATTGGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCa < 1:788759/150‑1 (MQ=255) ctttGCTTTATAGGAGTTATGGGTATGTTTTCCCGTTTCTGCGGTTTTTTTATTCTCACGTTTAGGGGATAAAAGGGGGGGTTTTTTGGGGGTTACAGTTAAATCCCGGGA‑AAAAAAACCCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGtt < 2:606274/143‑1 (MQ=255) ccggctttATAGGGGTTAGCGGCAGGATTATCCGTTGCTGGGGGGTTTTTAAGCGGACGAGTAGGGGGTGAAAGGGGGGGTTTTTTGGGGGTGACGGGAAAATGCCGGGC‑AGAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGAc < 2:289250/145‑1 (MQ=255) ccTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCt > 1:606565/1‑148 (MQ=255) cTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTGGGGGTTTACAGGTAATTTCAAGGC‑GGAAAAAACCCCCGCGGGTGGCGGGGAAGccgg > 2:232764/1‑139 (MQ=255) gctttATATGAGTTACCGGCATGATTATCCGTTTCGGCGGGGTTTTTAACGGGACGATTAGGGGGGAAAAGGAGGGTTTATTTGGGGTTTACAGGTAAATTCCAGCA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACaaa < 1:498259/148‑1 (MQ=255) ttATATGGTTTACCGGCATGTTTATCCTTTTCGGCGGGTTTTTTAATCGGACGTTTAGGGGGTAAAAGGGGGGTTTATTGGGGGGTTAAAGGAAAATCCCAGGA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAAt < 1:390525/149‑1 (MQ=255) atatGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTgcg > 1:808265/1‑151 (MQ=255) atatGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTgcg > 1:719236/1‑151 (MQ=255) aGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCttt > 2:39816/1‑150 (MQ=255) ttATCGGCATGATTATCCGTTTCTGGAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGGGAAATGAGGGGTTTTTTGGGGGTTACAGGAAAATTCCAGGA‑AAAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTAt < 2:671080/150‑1 (MQ=255) ggCATGATTATCCGTTTCTGGAGGTTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGTTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGc < 1:128781/150‑1 (MQ=255) gccATGATTTTCCTTTTGCGCGGGGTTTTAAGTCGGAAGATTGGTGGGGGAAAGGAGGGTTTATTTGGGGGTGAAAGTAAAATTCCAGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTa < 2:431523/142‑1 (MQ=255) gATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATg > 1:852400/1‑151 (MQ=255) ccGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGt > 1:470746/1‑151 (MQ=255) cGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGt > 1:185166/1‑150 (MQ=255) cAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGACATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCtt > 2:531740/1‑151 (MQ=255) aGGTTTTTTAATCGGCCGATTAGTGGGTGAAATGAGGGTTTTTTTGGGGGTTAAAGTTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACg < 2:32764/146‑1 (MQ=255) aGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCtt > 1:468347/1‑150 (MQ=255) ggttttttAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGAAAATTCCAGGA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTAt < 1:636923/148‑1 (MQ=255) tttttAATCGGACGATTAGGGGGTAAAATGGGGGGTTATTTGGGGTTTACGGGTAAATCCCAGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTAt < 1:842837/148‑1 (MQ=255) aagcGGAGGTTTGGTGGGTGAAATGAGGGTTTTTTGGGGGTTTACAGGTAAATCCCAGGA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCt < 1:556595/147‑1 (MQ=37) aaTCGGACGTTTAGGGGGTGAAATGAGGGTTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGA‑AGAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTa < 1:208728/151‑1 (MQ=255) tCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTAc > 2:263115/1‑150 (MQ=255) ggACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACaa > 2:560293/1‑150 (MQ=255) gACGATTGGTGGGTAAAATGGGGGTTTTTTTGGGGGTTACGGGTAATTTCCAGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACaaaa < 1:519591/151‑1 (MQ=37) aCGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACaaaa > 2:882384/1‑150 (MQ=255) ttggggggaaaaaTGGGGGTTTATTTGGGGGTTACAGGAAAATTCCAGGA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAtgt < 1:576517/140‑1 (MQ=37) tAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGc > 1:28059/1‑151 (MQ=255) aGTGGGTGAAATGAGGCGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGc > 2:499460/1‑150 (MQ=255) tGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCaa > 1:361027/1‑150 (MQ=255) gggTGAAATGAGGGGTTTTTTGGGGGTTACAGAAAAATCCCGGGA‑AGAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCaa < 2:895755/149‑1 (MQ=38) gggTAAAATGAGGGTTTTTTTGGGGGTTACAGGTAAATCCCAGCA‑AGAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAtgtg < 2:358715/146‑1 (MQ=38) aaagggggggTTTTTTGGGGGTTACAGGAAAATTCCAGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTc < 1:437760/142‑1 (MQ=37) aaaTGGGGGGTTTTTGGGGGTTTACAGGTAAATCCCAGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTc < 1:812663/148‑1 (MQ=37) aaTGAGGGTTTATTGGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATa < 1:17320/151‑1 (MQ=255) aGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAAtt > 1:421139/1‑151 (MQ=255) ggggTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTg > 2:511711/1‑151 (MQ=255) gggTTTTTTTGGGGGTAAGGGTAAATTCCAAGCAAAAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTg < 2:276533/151‑1 (MQ=25) gggTTATTTGGGGGTTACAGGAAAATTCCAGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGc < 1:183240/151‑1 (MQ=255) gttttttggggggTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCa < 1:851399/143‑1 (MQ=255) tttGGGGGTTAAAGTAAAATCCAAGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGTCAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAAtt < 2:630610/149‑1 (MQ=25) ttGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAAtt < 2:40964/148‑1 (MQ=255) tGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAAc > 1:359632/1‑151 (MQ=255) ggTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGt > 1:455542/1‑151 (MQ=255) tACAGGTAAATCCCAGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAg < 2:321659/150‑1 (MQ=255) aaaTCCCAGGA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAgg < 1:321267/144‑1 (MQ=255) aaTTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATa > 2:265638/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAagc > 1:357322/1‑151 (MQ=255) aaaaCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAgg > 1:454686/1‑151 (MQ=255) aaaCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGc > 2:115441/1‑151 (MQ=255) | CAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGC > NC_000913/2001768‑2002066 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |