| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,067,745 | 0 | A | G | 39.7% | 99.8 / 11.5 | 58 | L511P (CTG→CCG) | yihQ | putative sulpholipid alpha‑glucosidase; alpha‑glucosyl fluoride glucosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/8); new base G (0/23); total (27/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.18e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATT > NC_000913/4067597‑4067889 | aCGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAgg < 1:941838/151‑1 (MQ=255) cGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAggg < 2:935015/151‑1 (MQ=255) ggCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGggtg < 2:305135/151‑1 (MQ=255) ggCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGggtg < 2:136249/151‑1 (MQ=255) gCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGggtgg > 2:90343/1‑151 (MQ=255) gAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGgtggtg < 2:137692/151‑1 (MQ=255) gggCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAcc < 2:929143/151‑1 (MQ=255) aTGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCaa < 1:304755/151‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTc > 2:824848/1‑150 (MQ=255) ccccGTAAACCCGCCAGTTGCCGCAGGGACGGTTACCGTCGTGGGTGCGCATCGGCGGCGTGAAGGCGATAAAATCGCACCAGCGCACCGGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTAAAACAGGGGGGTTTAACCGCCAATGTCGCtgt < 2:637695/145‑1 (MQ=255) cGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTgtggtg > 1:840907/1‑151 (MQ=255) ccgcaaaaCTGCCAGTTGTCGCCGGGAGGGTTCCCTTTGTGGGGGGGCTCCGGCGGCGTAAGGGCGCGGAAAGCGCCCGAGCGCAGCAGCAGCTCTTGG‑GTGCGTTTCATCCAAAACGGGGTGGTTAAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCa < 2:224040/146‑1 (MQ=255) cGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGc > 1:65144/1‑149 (MQ=255) aaccTGCCGGTTGTCGCGGGGAGGGTTCCCTGGGGGGGGGCGCATCTTCGGCGTGAAGGCGTTAAAACCCCCCCGGCGACGCAGCAGCTTTTTG‑CTGCGTTTCATCAAAAACGGGGTGGTTTAACCGCCAATGTCGCTgtggt < 2:182330/140‑1 (MQ=255) gCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTcc > 2:383221/1‑151 (MQ=255) cctgTTGCCGCCGGGAGGGTCCCCTTCGGGGGTGCTCATCAGCGGGGTGAGGGCTCTGAAACCGCCCCGGCGCAGCAGCAGC‑CTTGGTCTGCGTTTCACCAAAAGCGGGGGGGGGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTcc < 2:919205/147‑1 (MQ=255) ccggTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTGGGGGGTGGGCTTCATCGGCGTGAGGGCTCTGAAATCGCCCCGGCGCAGCACCAGCTTTTGG‑CTGGGTTCCATCGCAAGCGGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCg < 2:246426/148‑1 (MQ=255) ccAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCg > 1:822124/1‑151 (MQ=255) gTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTc > 2:26639/1‑151 (MQ=255) ttGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTc > 2:63320/1‑150 (MQ=255) tGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCa > 1:816691/1‑150 (MQ=255) tGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCAt > 1:104324/1‑151 (MQ=255) tCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTg > 1:730678/1‑151 (MQ=255) gTGGGTGCGCATCATGGGCGTGAGGGCGTTAAAATCGCCCCAGCGAACCAGCAGTTCTTGG‑CGGCGTTTCATCTCAAACGGGGTGGTGAAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGccgccg < 2:461599/149‑1 (MQ=255) tGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCggg > 2:677106/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCCCCGGCGCAGCAGCAGCTTTTTG‑CTGCGCTTCATCACAAACGGGGGGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACa < 1:117364/151‑1 (MQ=255) ggTGCGCATCATCGGCGGGAAGGCGCTGAAACCGCCCCGGCGCAGCAGCAGCTTTTTG‑CTGCGCTTCACCCAAAACGGGGGGGTGAAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACa < 1:223087/151‑1 (MQ=255) gcATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCg > 2:814214/1‑150 (MQ=255) catgGGCGTGAAGGCGCTGAAACCGCACCAGGGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTAAAACGGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGa < 2:350691/147‑1 (MQ=255) catcGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGcc > 2:915232/1‑151 (MQ=255) atgggggggagggCGCTAAAACCGCCCCGGCGCGGCGGCAGCTTTTGG‑CGGCGTTTCATCAAAAACGGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCa < 1:301376/140‑1 (MQ=255) cGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAgg > 2:546619/1‑151 (MQ=255) cGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAgg > 2:237921/1‑151 (MQ=255) ggggTGAAGGCGCTAAAACCGCCCCAGCGCACCAGCAGCTTTTTG‑CTGCTCTTCATCTAAAACGGGGTGGTTTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCg < 1:716128/139‑1 (MQ=255) ggCGGGAAGGCGCTAAAATCCCCCCAGCGCAGCAACAGCTCTTGG‑CGGCGCTTCATCTCAAACGGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCa < 1:146167/148‑1 (MQ=255) cgggAAGGCGCTGAAACCGCACCGGCGCAGCGGCCGCTCTTTG‑CTGCTCTTCATCTCAAACGGGGGGGTGAACCCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGcc < 2:11528/147‑1 (MQ=255) ggagggCGCGAAAATCGCCCGAGCGCAGCGGCGGCTCTGTG‑CGGCGCTTCTCCAAAAAGGGGGTGTTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCAt < 2:858945/146‑1 (MQ=255) gcgcTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCAtcgtcg > 2:462197/1‑150 (MQ=255) gcTAAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTTTTTG‑CTGCGCTTCACCTAAAACGGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCgaga < 1:265527/151‑1 (MQ=255) ctaaaaCCGCACCGGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGTTTCATCTCAAACGGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCga < 1:648047/145‑1 (MQ=255) cACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCg > 1:169224/1‑150 (MQ=255) aCCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGAc > 1:353643/1‑151 (MQ=255) ccggcgcAGCAGCAGCTTTTTG‑CTGCGTTTCACCACAAACGGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGAc < 1:6694/147‑1 (MQ=255) cAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGt > 2:189944/1‑151 (MQ=255) cAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGCGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGt > 2:572800/1‑151 (MQ=255) cagccgcTCTTTG‑CTGCGTTTCATCTAAAACGGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTg < 1:168689/147‑1 (MQ=255) caccagcTTTTGG‑CTGCTCTTCATCTAAAACGGGGGGGTGTACCCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTc < 2:104289/147‑1 (MQ=255) agcagcTCTTTG‑CTGCGCTTCATCACAAAGGGGGGGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTc < 1:794487/149‑1 (MQ=255) cgcTGTTGG‑CTGCGCTTCATCTCAAAGGGGGGGGTGTACCCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTcgcccg < 2:302900/150‑1 (MQ=255) agcTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTcgcccg > 1:854613/1‑151 (MQ=255) ctctTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTcgcccgcc > 2:748568/1‑151 (MQ=255) ctgcGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCAcatc > 2:677213/1‑150 (MQ=255) gcTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCAtgg > 2:717347/1‑150 (MQ=255) ttaaTCCCAAACGGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCAcatcat < 1:26133/143‑1 (MQ=255) ttCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCAtggtgg > 1:418777/1‑151 (MQ=255) ttCATCTCAAAAGGGGTGGTGAAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCAcatcat < 1:913555/146‑1 (MQ=255) aTCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGt > 1:835893/1‑151 (MQ=255) aaaCGGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTAtt < 1:600230/149‑1 (MQ=255) aggaGGGTGGGGAAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTAtt < 2:897139/145‑1 (MQ=255) | ACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTG‑CTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATT > NC_000913/4067597‑4067889 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |