| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,810,080 | Δ1,165 bp | [ygaZ]–[mprA] | [ygaZ], ygaH, [mprA] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2810080 | 2811244 | 1165 | 71 [1] | [0] 70 | [ygaZ]–[mprA] | [ygaZ], ygaH, [mprA] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2810079 | 1 (0.010) | 70 (0.930) | 57/298 | 0.5 | 99.3% | coding (463/738 nt) | ygaZ | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
| ? | NC_000913 | 2811245 = | 0 (0.000) | coding (476/531 nt) | mprA | transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux | |||||
GCCGCTGCCTGCATCTGCAATTAACGGAAAAAGGTCACGAGTTTTTGCGCGAGGTTTTACCACCGCAGCATAACTGCCTGCATCAACTCTGGTCCGCGCTCAGCACAACAGAAAAAGATCAGCTCGAGCAAATCACCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGCAGGTCGGCTC > NC_000913/2811098‑2811393 | aaaaatcgaaacccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgtctc < 2:314146‑M2/4‑1 (MQ=255) atcgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGt > 1:201632‑M2/144‑151 (MQ=255) cgaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGtct > 2:1089120‑M2/142‑151 (MQ=255) gaaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGtctc < 1:105842‑M2/11‑1 (MQ=255) aaaaccgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGtctc < 2:417709‑M2/11‑1 (MQ=255) accgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGAcc > 1:709414‑M2/137‑151 (MQ=255) accgccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGAcc > 2:106162‑M2/137‑151 (MQ=255) ccctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGAcc > 1:849942‑M2/133‑147 (MQ=255) cctgtgggcgtttggcctgacggctgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcctggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGa > 2:736185‑M2/132‑149 (MQ=255) cctgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATg > 1:745353‑M2/132‑151 (MQ=255) tgtgggcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATgg > 1:178096‑M2/130‑150 (MQ=255) gcgtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAg < 1:593433‑M2/27‑1 (MQ=255) gtttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGAc < 1:1010154‑M2/29‑1 (MQ=255) tttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGAc < 1:609679‑M2/29‑1 (MQ=255) tttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACg > 1:722421‑M2/122‑151 (MQ=255) ttggcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACgg > 1:673017‑M2/121‑151 (MQ=255) gcctgacggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGgtgt > 1:1158100‑M2/118‑151 (MQ=255) acggatgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTtc > 2:665497‑M2/113‑151 (MQ=255) tgaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGa < 2:78243‑M2/43‑1 (MQ=255) gaggtttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGaa < 2:636013‑M2/44‑1 (MQ=255) tttttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGa < 1:946487‑M2/48‑1 (MQ=255) tttgccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATg < 2:35028‑M2/50‑1 (MQ=255) gccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCt > 1:366451‑M2/98‑151 (MQ=255) ccgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCt > 1:1013358‑M2/97‑150 (MQ=255) cgccgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTa > 1:318343‑M2/96‑150 (MQ=255) cgcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAcgc < 2:831293‑M2/59‑1 (MQ=255) gcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAcgcg > 1:64940‑M2/92‑151 (MQ=255) gcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAcgcg > 2:851884‑M2/92‑151 (MQ=255) gcaaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAcgcg > 2:876474‑M2/92‑151 (MQ=255) aaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTc > 1:386090‑M2/90‑151 (MQ=255) aaccgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTc > 1:902620‑M2/90‑151 (MQ=255) accgcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCa < 1:135677‑M2/63‑1 (MQ=255) gcaaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCAtct > 2:517133‑M2/86‑151 (MQ=255) caaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCAtctc > 2:136550‑M2/85‑151 (MQ=255) aaaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCg > 1:871536‑M2/84‑151 (MQ=255) aaactggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGc < 1:221729‑M2/69‑1 (MQ=255) ctggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTc > 1:1040877‑M2/80‑150 (MQ=255) ggtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCaa < 1:719553‑M2/73‑1 (MQ=255) gtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCaaaa < 1:640652‑M2/75‑1 (MQ=255) gtacgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCaaaa < 2:45569‑M2/75‑1 (MQ=255) cgcaataatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATc < 2:1040593‑M2/78‑1 (MQ=255) taatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATcc > 1:843168‑M2/69‑147 (MQ=255) aatcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGAtt < 2:703811‑M2/84‑1 (MQ=255) atcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGAttt < 1:82666‑M2/85‑1 (MQ=255) atcgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCATCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGAttt > 2:872800‑M2/67‑151 (MQ=255) cgccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTta < 1:1122320‑M2/86‑1 (MQ=255) gccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTtat > 2:120681‑M2/64‑150 (MQ=255) gccgctggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTtat > 1:407252‑M2/64‑150 (MQ=255) 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ggagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGaa < 2:941636‑M2/94‑1 (MQ=255) gagcgagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGaaa < 2:593487‑M2/95‑1 (MQ=255) agcgtgacatggatgatcgccattgccttcagtccatggtcctcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAACACGGAGCGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAACTCCAGATTTATAAAAGaa > 2:544313‑M2/56‑149 (MQ=255) gagaactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAAt > 2:99050‑M2/53‑151 (MQ=255) aactggatgatcggcattgccttcagttcatggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGAc > 1:39725‑M2/50‑151 (MQ=255) 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atggtcatcgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCtttt > 1:397621‑M2/21‑151 (MQ=255) cgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGc > 1:604579‑M2/13‑151 (MQ=255) cgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGc > 1:495736‑M2/13‑151 (MQ=255) cgtgggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGc < 2:47223‑M2/139‑1 (MQ=255) gggtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGCAg < 2:233322‑M2/141‑1 (MQ=255) gtatttgTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGCAGGTc < 2:814463‑M2/144‑1 (MQ=255) gTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGCAGGTCggcac > 2:1176269‑M2/2‑148 (MQ=255) | GCCGCTGCCTGCATCTGCAATTAACGGAAAAAGGTCACGAGTTTTTGCGCGAGGTTTTACCACCGCAGCATAACTGCCTGCATCAACTCTGGTCCGCGCTCAGCACAACAGAAAAAGATCAGCTCGAGCAAATCACCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATGCTGGCCTTTTTGGCAAGCAGGTCGGCTC > NC_000913/2811098‑2811393 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |