| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,903,692 | 0 | C | A | 48.6% | 65.2 / 58.6 | 70 | intergenic (+318/+1055) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/34); new base A (33/1); total (35/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.83e-16 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.98e-01 | |||||||||||
GAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT > NC_000913/2903553‑2903827 | gAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGc < 1:483604/151‑1 (MQ=255) atatTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAA‑CAC‑CC‑ATTATcc > 2:267950/1‑150 (MQ=255) tatTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAA‑AAC‑GC‑ATTattt > 1:527797/1‑146 (MQ=255) atTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTc < 2:425392/150‑1 (MQ=255) atTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCa < 2:864925/151‑1 (MQ=255) aaCTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCaaaa < 1:381388/151‑1 (MQ=255) tACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTAAAAA‑CAC‑TC‑ATTTACCTCaaaaaa > 2:966505/1‑148 (MQ=255) cacTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAg < 2:342948/151‑1 (MQ=255) acTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAg < 2:765794/150‑1 (MQ=255) cTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTAAAAA‑CAC‑AC‑CTTTACCTCCAaaaaaaaa > 2:129677/1‑148 (MQ=255) cGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTTAAAA‑CAA‑CC‑ATTAACCTCaaaaaaaaaaaa > 2:701821/1‑146 (MQ=255) cGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTAAAAA‑CAC‑CC‑ATTAACCTCAAAACaaaaa > 2:1008803/1‑146 (MQ=255) gATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTTAAAA‑AAC‑TC‑AATAACCCCaaaaaaaaaaaaa > 1:651453/1‑145 (MQ=255) gATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTAAAAA‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCCAaaaaaaaaaaa > 2:152364/1‑145 (MQ=255) gATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑aaa < 1:966026/151‑1 (MQ=255) aTGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTTAAAA‑CAC‑TC‑ATTAACCTCAAAACAaaaaa‑aaa > 2:60256/1‑150 (MQ=255) cTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGGTTTTTATAAA‑AAA‑TC‑ATTAATCTCAAAAAAAAAAA‑AAA‑cattc > 1:1058679/1‑147 (MQ=255) tAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAg < 2:365313/150‑1 (MQ=255) aGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑At < 1:265037/151‑1 (MQ=255) aTAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGGAAAAA‑CAC‑TC‑CTTAACCTCAAAACAAAAAC‑AAA‑AATCCCG‑Attt > 2:1032753/1‑150 (MQ=255) aCAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTTAAAA‑CAA‑TC‑ATTTTACTCAAAAAAAAAAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATttatt > 1:516802/1‑146 (MQ=255) aCAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTTAAAA‑AAA‑CC‑ATTAAACTCAAAACAAAAAA‑AAA‑ATTCCAG‑ATTTATTAAtt > 1:1013158/1‑150 (MQ=255) aCAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTa < 2:447626/151‑1 (MQ=255) cAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTaa < 2:217042/151‑1 (MQ=255) tACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAA‑AAA‑TC‑ATTAGCCCCCAAAAAAAAAA‑AAA‑CATCCCG‑Atttttttttt > 2:718262/1‑142 (MQ=255) aaTCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGa < 2:641685/151‑1 (MQ=255) cGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAAt < 1:251844/150‑1 (MQ=255) aCTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTTAAAA‑CAC‑CCAATTACCCCAAAAAAAAAAAA‑AAA‑CTT‑CAA‑ATTTATTACTTTACC‑AAAGAaaaa > 2:41827/1‑149 (MQ=255) aCTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACa < 2:1019180/151‑1 (MQ=255) ttATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAA‑AAC‑TC‑CTTATACTCAAAAAAAAAAA‑AAA‑CATTCAG‑ATTTTTTACTTAACa‑aaaacaaaaaaa > 1:409095/1‑139 (MQ=255) ttATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAg < 2:884640/150‑1 (MQ=255) tATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGc < 2:74472/150‑1 (MQ=255) aTCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCtt < 2:458259/151‑1 (MQ=255) tCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAA‑CAC‑CC‑ATTAACCTCAAAAAAAAAAA‑AAA‑AATCCCA‑AATTATTATTTAAAC‑aaaaaaaaaaaaaaat > 2:285143/1‑136 (MQ=255) cAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTaa < 2:517095/151‑1 (MQ=255) ttttCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTTAAAA‑AAC‑TC‑ATTACCATCAAAAAAAAAAA‑AAACCTTCTTA‑CTTAATTACTTCAAC‑AAT‑AATAAAAAACTTaaa > 1:205380/1‑149 (MQ=255) tttCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTaaaaa < 2:1135686/150‑1 (MQ=255) cACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAata < 2:174172/150‑1 (MQ=255) aCTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAAtata < 2:51274/151‑1 (MQ=255) tAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAA‑CAC‑TC‑ATTTACCTCCAAAAAAAAAA‑AAA‑CATCCCG‑ATTTTTTATTTAAAC‑AAATAAAAAAAAAATTaaaaaaaa > 2:252929/1‑144 (MQ=255) aaaGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAA‑AAA‑TC‑ATTAGTCTCAAAAAAAAAAA‑AAA‑ATTCCAA‑ATTTATTATTTTACC‑AATGAATAACAAGATTAAAAAAaataat > 1:428552/1‑147 (MQ=255) aaGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGtt < 1:930409/151‑1 (MQ=255) aaGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTGCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑Tg < 2:870134/149‑1 (MQ=255) gTATGAACTGGATATCTTTATCCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTAt < 1:756091/151‑1 (MQ=255) aCTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTAAAAA‑CAC‑TC‑ATTATCCTCAAAAAAAAAAC‑AAA‑AATTCAG‑AATTATTACTTTACC‑AAAAAATAAAAAACTTAAAAAAAAAAA‑TTTTAtttt > 2:951642/1‑146 (MQ=255) tGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAA‑CAC‑CC‑ATTTTCCTCCAAAAAAAAAA‑AAA‑ATTCCAA‑ATTTATTTATTAAAC‑CAAAAAAAAAAAACTTTAAAAAAAAAA‑TGTTTTTTTaaa > 2:750605/1‑149 (MQ=255) tCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAA‑CAC‑CC‑ATTAGCCCCAAAACAAAGAG‑AAA‑CTTCACG‑GTTTTTTTATTAACCAAATAAAAAACAA‑ATTAAAAAAAAAAC‑TTTTATTTTTCaaaaaaaa > 2:328399/1‑150 (MQ=255) tttATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAA‑AAC‑AA‑ATTATCACAAAAAAAAAAAA‑AAA‑ATTCCCG‑ATTTATTTTTTTAAC‑AAATAAAAACAAAATTAAAAAATAAAA‑TTTTATTTTTAAGaaaaaa > 1:562897/1‑148 (MQ=255) ttATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTAAAAA‑CAC‑TC‑ATCCACCTCAAAAAAAAAAA‑AAA‑AATTCCG‑AATTATTTATTAAAC‑AAAGAATAAAAAAATTTAAAAAAATAA‑TTTTATTTTaaaaaaaaaaat > 2:59346/1‑147 (MQ=255) ttATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGaaaaaa < 2:514613/147‑1 (MQ=255) ttATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGaaaaaa < 2:554646/147‑1 (MQ=255) tATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGAAAAAATTaa < 1:206392/150‑1 (MQ=255) aTTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGAAAAAATTAAc < 1:397406/150‑1 (MQ=255) tCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAA‑CAC‑CC‑ATTAAACTCCAAAAAAAAAA‑AAA‑ATTCCCGAATTTTTTTTTTACCA‑AATAAAAAAAAAACTTAAAAAA‑ATACTTCTTTTTTTAAAAAAAAAATaaaa > 2:211720/1‑148 (MQ=255) cATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAA‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCCAAAAAAAAAA‑AAA‑ATTCCAG‑ATTTTTTTCTTTAAC‑AAAGAAAAAAAAACTTAAAAAAAATAA‑TTTTATTTTTAAAAAAAAAATaa > 2:965115/1‑146 (MQ=255) gAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTaa < 2:454204/151‑1 (MQ=255) gAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGATATGTAAAAA‑AACACC‑ATAAACCCCAAAA‑AAAAAA‑AAA‑CTTTCCG‑AGTTATTAATTAACC‑AAATTATAACAAAATTAAAAAAAATAA‑TGTTATTTTTAAGAAAAAAATAACaaagaata > 2:972184/1‑143 (MQ=255) aaCTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGATAT‑TAAAACACAC‑CC‑CTTAAACCCAAAATAAAAACAAAA‑CTACCAA‑CTTTTATCTTTACCC‑AAAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAATAC‑TTTTTTTTTAAA‑AAAACAATAACAAGCAttta > 1:492002/1‑148 (MQ=255) aCTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAA‑CAC‑TC‑ATTAACCCCAAAAAAAAAAA‑AAA‑AATCCAG‑ATTTTTTTATTAAAC‑AAAAAAAAAAAAACTTAAAAAAAATAC‑TGTTATTTTTAAAAAAAAAATAAAAAGCATTAAtt > 2:669575/1‑151 (MQ=255) aTTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAA‑CAC‑CC‑ATTAACCTCAAAAAAAAAAA‑AAA‑AATCCAA‑AATTTTTTTTTTAAC‑AAAGAAAAAAAAACTTAAAAAAAATAC‑TTTTTTTTTTAAAAAAAAAATAAAAAGCAATAAtt > 2:462706/1‑148 (MQ=255) aTTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCa < 2:503374/150‑1 (MQ=255) ttCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAA‑CAC‑CC‑ACTAAACTCAAAAAAAAAAA‑AAA‑AATCCAA‑AATTTTTTTTTAAAC‑CATAAAAAAAAAACTTAAAAAAAAAAA‑TTTTTTTTTTAAAAAAAAAATAAAAGGGAATaa > 2:188083/1‑145 (MQ=255) ttCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAA‑CAC‑AC‑CCTTGACCCAAAAAAAAAAA‑AAA‑ATTCCAG‑ATTTTTTTATTAAAC‑AAAAAATAAAAAACATTAAAAAAATAA‑TATTTTTTTTAAAAAAAAAATAAAAAGCAATAATTTaa > 2:743731/1‑150 (MQ=255) tcatcaACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAat < 2:510356/150‑1 (MQ=255) catcaACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAatat < 1:152316/151‑1 (MQ=255) tcaACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAA‑AAC‑CC‑ATTAGCCTCAAAAAAAAAAA‑AAA‑ATTCCAG‑GTTTTTTACTTTAAC‑AAAGAATAACAAACTTAAAAAAAATAA‑TGTTATTTTATAGAAAAAAATAAAAAGAATTaaataaa > 1:1133293/1‑141 (MQ=255) caACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTa < 2:697448/150‑1 (MQ=255) aGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaaaaaa < 1:615648/151‑1 (MQ=255) gCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGAtt > 1:963047/1‑150 (MQ=255) ttATGTAAAAA‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAA‑AAA‑CATCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGAtt < 1:325805/146‑1 (MQ=255) | GAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAC‑CAC‑TC‑ATTAGCCTCAAAACAAAGAC‑AAA‑CTTCCAG‑ATTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATAC‑TGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT > NC_000913/2903553‑2903827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |