| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,471,319 | (T)5→4 | coding (11/1185 nt) | tufA ← | translation elongation factor EF‑Tu 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,471,315 | 0 | T | . | 98.4% | 280.7 / ‑1.3 | 62 | coding (15/1185 nt) | tufA | translation elongation factor EF‑Tu 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base . (38/22); total (39/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCAACGTTACTCGGCGCTTCATCATACTTC > NC_000913/3471169‑3471460 | ggggcggtttCGATATGGGGGAATGGACATGCACCGCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTAAGAGTAGTTTTTCCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAGCGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTGAAAtttt < 2:334613/141‑1 (MQ=14) gcgcGTTCTCGTTCGGGTCGATTGCCCGAGCACCCCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAAttttct < 2:78429/151‑3 (MQ=14) gTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAAttttcttt > 1:520463/1‑145 (MQ=255) tCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCt > 1:134956/1‑151 (MQ=255) ggTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCtata < 1:1066015/151‑1 (MQ=255) gTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTatat > 1:57006/1‑151 (MQ=255) gAATGCACGAGCAGCACCGCCGAAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTcc > 2:908601/1‑151 (MQ=255) aTGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCtt > 1:1105087/1‑151 (MQ=255) agcaCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGc > 2:955263/1‑151 (MQ=255) agcaCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGGGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGc > 2:223147/1‑151 (MQ=255) gcaCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGc < 1:40219/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGctct > 1:97503/1‑151 (MQ=255) cgccgTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTcc > 2:327296/1‑151 (MQ=255) cgccgTAAGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTcc < 1:982386/151‑1 (MQ=255) gTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCtt > 2:341518/1‑151 (MQ=255) aGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTc > 2:241562/1‑150 (MQ=255) aGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGGCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTGACTATAGTTCTCTCCGCTTCa < 2:819046/151‑1 (MQ=18) ggTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTc > 1:508086/1‑149 (MQ=255) gTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAgg < 1:332554/151‑1 (MQ=255) tAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGgag > 2:502527/1‑149 (MQ=255) aGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGgag > 1:538258/1‑148 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGc < 2:129646/151‑1 (MQ=255) cAGTACGGTGGAGATTGCAGCGGTCCGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGCACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGgagag > 2:528863/1‑147 (MQ=255) aGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCAc > 1:883993/1‑151 (MQ=255) ggttgtGATGGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCACCGTTACCGTGCGGTTTTGTGCGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTGTATTCCTTTCTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGTGa < 2:313210/150‑1 (MQ=21) gtgATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTg > 2:370892/1‑151 (MQ=255) tgATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTgg > 2:223819/1‑151 (MQ=255) aTTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGt > 1:1035951/1‑150 (MQ=255) ttGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTAt > 1:1014528/1‑151 (MQ=255) tGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTAtt > 2:518408/1‑151 (MQ=255) tGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTAtt > 2:604008/1‑151 (MQ=255) gCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAAcc < 2:774088/151‑1 (MQ=255) gCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAAcc > 1:344247/1‑151 (MQ=255) ggTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCt < 2:333238/151‑1 (MQ=255) agagTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAgg > 1:841930/1‑151 (MQ=255) agagTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAgg < 1:1097814/151‑1 (MQ=255) gagTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGc > 1:898379/1‑151 (MQ=255) gtTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTAtt < 1:857618/151‑1 (MQ=255) ttACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTa > 2:588228/1‑150 (MQ=255) tACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTAc < 2:1048523/150‑1 (MQ=255) gTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACgg < 2:430709/151‑1 (MQ=255) gTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTC‑AACTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACg > 2:640984/1‑150 (MQ=255) ggTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACgg < 2:350725/150‑1 (MQ=255) gTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCt < 2:219922/151‑1 (MQ=255) aaCGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTc > 2:239669/1‑150 (MQ=255) aaCGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCa < 1:502706/151‑1 (MQ=255) aCGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCa > 2:263996/1‑150 (MQ=255) ccGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTAc > 2:384493/1‑149 (MQ=255) ccGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACgg > 2:81836/1‑151 (MQ=255) cGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGc > 2:1097760/1‑151 (MQ=255) aTAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCt > 1:160014/1‑151 (MQ=255) aTAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCt > 1:683645/1‑151 (MQ=255) aCCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCa < 1:1055999/151‑1 (MQ=255) ccAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCa > 1:56841/1‑150 (MQ=255) aCGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCAACGt < 1:480867/151‑1 (MQ=255) cGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCAACGtt < 2:54695/151‑1 (MQ=255) gTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCAACGtt > 1:1027442/1‑150 (MQ=255) gTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCAACGtt > 1:689608/1‑150 (MQ=255) ggTTTTGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCAACGTTACTCGGCGCtt < 2:416061/151‑1 (MQ=255) ttGTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCAACGTTACTCGGCGCTtcat < 2:492599/150‑1 (MQ=255) gTACGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCAACGTTACTCGGCGCTTcatcat < 2:56826/151‑1 (MQ=255) cGTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCAACGTTACTCGGCGCTTCATCATACt > 2:645117/1‑151 (MQ=255) gTTCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGTGCAACGTTACTCGGCGCTTCATCATACtt > 2:828376/1‑151 (MQ=255) ttCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTACTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCAACGTTACTCGGCGCTTCATCATACTTc > 1:787357/1‑151 (MQ=255) tCAAA‑TTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCAACGTTACTCGGCGCTTCATCATACTTc < 2:380870/150‑1 (MQ=255) | GGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAATTACGGCCTGAGCAACGTTACTCGGCGCTTCATCATACTTC > NC_000913/3471169‑3471460 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |