Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,768,309 | A→T | V126E (GTG→GAG) | ydiJ ← | putative FAD‑linked oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,768,309 | 0 | A | T | 98.5% | 258.0 / ‑3.9 | 70 | V126E (GTG→GAG) | ydiJ | putative FAD‑linked oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (34/33); total (35/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.18e-01 |
CTGACGTTTTGCCATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCACCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGCCGCCGCCGCGGGGGGTAAAGATCAGCGAT > NC_000913/1768163‑1768455 | cTGACGTTTTGCCATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGGCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTcccc > 2:500415/1‑151 (MQ=255) cTGACGTTTTGCCATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTcccc > 1:676770/1‑151 (MQ=255) gACGTTTTGCCATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTcccc < 1:58772/149‑1 (MQ=255) gACGTTTTGCCATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTccc < 1:212996/148‑1 (MQ=255) gACGTTTTGCCATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTcc < 1:222399/147‑1 (MQ=255) gACGTTTTGCCATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCgg > 1:596361/1‑151 (MQ=255) aCGTTTTGCCATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGc > 1:924457/1‑151 (MQ=255) tttGCCATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTc < 2:976774/150‑1 (MQ=255) tGCCATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCaa < 1:115744/150‑1 (MQ=255) gCCATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAAcg < 1:48033/151‑1 (MQ=255) ccATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAAcg > 2:484695/1‑150 (MQ=255) cATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAAcgcg < 2:197345/151‑1 (MQ=255) ccAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCa < 1:1032355/151‑1 (MQ=255) cAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCAccc > 1:252970/1‑149 (MQ=255) cGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGccc < 1:729565/151‑1 (MQ=255) gATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCct > 2:916198/1‑151 (MQ=255) gACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTGGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGGTGATCTTTTATCTCCCCTGCCTCAACGCGCACCCAGCCCGCCTCAg < 2:260746/150‑1 (MQ=255) ccGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGt < 2:1022896/151‑1 (MQ=255) ccGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGt < 1:195492/151‑1 (MQ=255) aTGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAAt > 1:572517/1‑151 (MQ=255) tGCAACGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGGTCCGGCGCAAAAAAGGAGCCGAACGGTTGCAGGTACTGATTGAGTTGATGTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAAt < 2:1080415/150‑1 (MQ=255) gCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAAttt < 1:2986/151‑1 (MQ=255) cATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTc > 2:125639/1‑151 (MQ=255) aTTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGatgatg < 1:432711/151‑1 (MQ=255) gATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCg < 1:430983/150‑1 (MQ=255) atcatcCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGt < 1:265291/151‑1 (MQ=255) atcatcCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGt > 1:21101/1‑151 (MQ=255) catcCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTc < 2:621445/151‑1 (MQ=255) cccACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCACCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCata < 1:1051191/151‑1 (MQ=255) cccACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGACGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCa < 2:315913/149‑1 (MQ=255) cACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATg > 2:356765/1‑151 (MQ=255) cACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATg > 2:616779/1‑151 (MQ=255) ccGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGc < 2:87521/151‑1 (MQ=255) aGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCggg > 2:215084/1‑151 (MQ=255) gTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGAc > 2:892606/1‑150 (MQ=255) gCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACatat > 1:979304/1‑151 (MQ=255) tGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCATCTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCACTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATcaacaa < 2:391459/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACaata > 1:160721/1‑150 (MQ=255) gTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATcc < 1:4739/151‑1 (MQ=255) cGAAAGGTGCGGCGCAAAAAAGCAGCCGAATGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCGGGGCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGGTAAATTCGAGGATGCGGTTCATTTGGCGGGAAATATCAACCATAATccc > 2:311520/1‑150 (MQ=255) aaGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTgg > 2:895157/1‑151 (MQ=255) aaGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTgg > 1:822751/1‑151 (MQ=255) gTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGtt > 1:871913/1‑151 (MQ=255) gTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGtt > 1:554102/1‑151 (MQ=255) gTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCGCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGtt < 2:647437/151‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTgggt > 2:663136/1‑147 (MQ=255) tCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGtt > 2:766772/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGa < 1:439902/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAg < 1:5185/151‑1 (MQ=255) cAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCt > 1:222379/1‑150 (MQ=255) aaaaaGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTTAGCGCCTGAc > 2:635100/1‑151 (MQ=255) aaaaGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGAcc < 1:649348/151‑1 (MQ=255) aGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATC‑TCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAgtg > 1:115469/1‑151 (MQ=255) cGGTTTCAGGCACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGACGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAtggccgggg > 2:1017907/1‑149 (MQ=255) tCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTgccgcc > 1:226150/1‑151 (MQ=255) cAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTgccgcc < 1:136219/150‑1 (MQ=255) cAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTgccgcc > 2:1071101/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGGGCCGGCgccgcc > 2:255132/1‑149 (MQ=255) gTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGccgccgccg < 1:17128/151‑1 (MQ=255) tACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGCcgccgccgc > 1:86507/1‑151 (MQ=255) tACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGCcgccgccgc > 1:569323/1‑151 (MQ=255) tACTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGCGGcgccgccgc > 2:10593/1‑151 (MQ=255) aCTGATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGCcgccgccgc < 1:999534/150‑1 (MQ=255) gATTGAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCCCCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGCCGCCGCcgcg < 2:324731/148‑1 (MQ=255) gAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGCCGCCGCCGCGGGGGGt > 1:540441/1‑150 (MQ=255) gAGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCGGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGCCGCCGCCGCGGGGGGt < 2:234441/150‑1 (MQ=255) aGTTGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGCCGCCGCCGCGGGGGGTaa < 2:487314/151‑1 (MQ=255) ttGATCTTTTATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGCCGCCGCCGCGGGGGGTaa > 2:360445/1‑149 (MQ=255) tttATCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGCCGCCGCCGCGGGGGGTAAAGATc < 1:161661/147‑1 (MQ=255) aTCTCCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGCCGCCGCCGCGGGGGGTAAAGATCAGCGAt < 1:477374/150‑1 (MQ=255) | CTGACGTTTTGCCATAGACCAGCGATCCCTGACCGGATGCATCGGTATTGATCATCCCACCGAGCGTTGCCCGGTTGCTGGTCGAAAGTTCCGGCGCAAAAAAGTAGCCGAACGGTTTCAGGTACTGATTGAGTTGATCTTTTATCACCCCGGCCTCAACGCGCACCCAGCCCTCTTCAGGGTTAATTTCGATGATGCGGTTCATATGGCGGGACATATCAACAATAATCCCCTGGTTGAGCGCCTGACCGTTAGTGCCGGTGCCGCCGCCGCGGGGGGTAAAGATCAGCGAT > NC_000913/1768163‑1768455 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |