| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,001,911 | 0 | G | A | 36.5% | 102.8 / 34.9 | 74 | intergenic (‑122/+199) | fliA/fliC | RNA polymerase, sigma 28 (sigma F) factor/flagellar filament structural protein (flagellin) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/11); new base A (0/27); total (36/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.10e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCG > NC_000913/2001764‑2002053 | ccTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCTCGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGaaa < 2:301300/151‑1 (MQ=255)ccTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGaaa < 1:431869/151‑1 (MQ=255) ttCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGaaaa > 1:459049/1‑150 (MQ=255) tCAGCGGTATAGAGTTAATTCACGATAAACAGACCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGTGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGaaaa < 2:891640/149‑1 (MQ=255) ggTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑cccc > 1:1260180/1‑151 (MQ=255) gTATAGAGTGAATTCACGATAAACATCCCTGCGTTATAGGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGTGTTGCAGGGAAATTCCAGGCAGAAAAAAT‑cccc < 2:594644/150‑1 (MQ=255) ataGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCccgcc < 1:637045/151‑1 (MQ=255) ataGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCccgc < 1:1268073/150‑1 (MQ=255) gagTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCgg > 1:1019385/1‑150 (MQ=255) gagTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGt > 1:803592/1‑151 (MQ=255) tGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGc > 1:77749/1‑151 (MQ=255) tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCgggg > 1:555986/1‑150 (MQ=255) cACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGa > 2:99880/1‑150 (MQ=255) gATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGc > 2:487104/1‑150 (MQ=255) aaaCAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTTGGGGGTAAAAGGAGGGTTTTTTTGGGGGTTACAGGAAAATCCCAGGCAAAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGt < 1:126696/151‑1 (MQ=255) aaCAGCCTGGGGTTATATGAGTTGTGGGATTGATTACCTGTTTGTGGAGGTTTTTAAAGGGGCGGATTGGTGGGTGAAAGGGGGGGTTGTTGGGGGGTACCGGGAAAATCCCGGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGtt < 2:388358/151‑1 (MQ=255) ccttGCTTTATATGATTTTGCGGCATGTTTATCCGTTTGTGCGGGTTTTTTAATCGGACGATGAGGGGGTGAAAGGGGGGGTTTTTTGGGGGTTACAGTAAAATTCCGGGAAGAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTg < 2:176451/147‑1 (MQ=255) cccTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGc > 2:848619/1‑148 (MQ=255) ccTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGAc > 1:233695/1‑151 (MQ=255) cGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGGGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACaaa > 2:176444/1‑150 (MQ=255) ttATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAAtt > 1:270471/1‑150 (MQ=255) tataTGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTCTTTGGGGGTTACAGGTAAATTGCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGGGGCGGGGCAGCACGTTGCTGACAAATTg > 2:1254803/1‑150 (MQ=255) gatttATCGGCATGATTATCCTTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTAAAAGGAGGGGTTATTGGGGGGTTACAGGAAAATTCCAGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCtt < 1:377274/147‑1 (MQ=255) aGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTgcg > 2:684018/1‑146 (MQ=255) ttATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATg > 1:865160/1‑151 (MQ=255) gccATGATTATCCTTTTCTGAAGGGTTTTTAAGCGTACTATTAGTGGTTAAAATGGGGGGTTTTTTGGGGGTAACGGTTAATTACCAGCAAAAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTg < 2:1041795/147‑1 (MQ=255) cATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCgg > 1:684469/1‑151 (MQ=255) tGATTATCCGTTTCTGCAGGTTTTTTAATCGGACGATTAGGGGGTAAAAGGGGGGTTTATTGGGGGGTTACAGGAAATTCCCAGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCgg < 1:107742/149‑1 (MQ=255) tGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGAt > 1:1087705/1‑151 (MQ=255) tttcccGTTGTTGCGGGTTTTTTAATGAAAAGATTGGTGGGTAAAATGGGGGGTTATTTGGGGTGTAAAGGTAAATTCAAGGAAAAAAAAAG‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGag < 2:802722/144‑2 (MQ=255) tatcgttttCTGCAGGTTTTTTAATCGAACTATTTGTGTGTGAAATGAGGGTTTATTTGGGGGTTACAGGAAAATTCCGGAAAAAAAAACC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTGTATGTTGCCGGAt < 2:1198356/141‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGCCGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCCGAAAAAAA‑CCCCGCCGGGGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACCAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATgcggcg > 2:189589/1‑149 (MQ=255) gTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTa > 2:692772/1‑150 (MQ=255) ttCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAAc > 1:1093874/1‑151 (MQ=255) tCTGCGGGTTTTTAAATCGGACGTTTAGTGGGTGAAATGGGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGAAAATCCCAGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAAc < 1:32642/150‑1 (MQ=255) gcgggttttttAATCGGACGATTAGGGGGTGAAAGGAGGGGTTATTGGGGGTTTACAGGTAAATCCCAGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGc < 1:442994/143‑1 (MQ=255) ggTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc > 1:830993/1‑151 (MQ=255) aatggggagtttggTGGGTAAAATGAGGGTTTTTTTGGGGGTTAAGGGTAATTTCCAGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGc < 1:1112954/135‑1 (MQ=37) ggaggaTTGTTGGGTAAAAGGAGGGTTTTTTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGAAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCt < 2:915566/146‑1 (MQ=38) ggtttaaggggAGAAATGGGGGGTTTTTTGGGGTTTAAAGGTATATTCCAGAAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACaaaaa < 2:270662/142‑1 (MQ=25) cGATTAGGGGGAGAAATGAGGGTTTATTGGGGGTTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAt < 1:354265/151‑1 (MQ=38) gATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAtg > 1:1208878/1‑151 (MQ=255) gATTAGTGGGTAAAGTGGGGGGTTATTTGGGGGTTACGGGTAAATTCCGGGCAGAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGTCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACaaaa < 2:925571/148‑1 (MQ=38) ttggTGGGTGAAATGAGGGTTTATTGGGGGTTTGCGGGTAATTCCCAGGCAAAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGTGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTAAAAAAAt < 2:821709/145‑1 (MQ=37) ttAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAtgtg > 1:80652/1‑151 (MQ=255) aGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGc > 2:949879/1‑150 (MQ=255) ggggggaaaaTGGGGGGTGATTGGGGGTTGACGGTAAAATTCCACGCAAAAAAACC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTTCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCa < 1:1005836/143‑1 (MQ=25) gggggTAAAAGGAGGGTTTATTGGGGGGTTACAGGAAAATTCCAGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCaa < 1:382206/149‑1 (MQ=37) gggTGAAATGAGGGGTTTTTGGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCa < 1:271253/148‑1 (MQ=255) aaaggggggtTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATCCCAGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAAt < 1:792805/145‑1 (MQ=37) aaaTGAGGGTTTTTTTGGGGGTTACAGGTAATTTCCGGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTc < 2:110279/148‑1 (MQ=37) aTGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATa > 1:340868/1‑150 (MQ=255) tGAGGGGATATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAACAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACCAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGAGGCGTACACGCCTTATCCGCCCTACAAAAATGTGCAAATTCaa > 2:897877/1‑147 (MQ=255) ggAGGGTTTTTTTGGGGGTTAAAGGTAATTCCCGGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATaaa < 2:1119576/150‑1 (MQ=25) gAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAAt > 2:958609/1‑151 (MQ=255) ggtttATTGGGGGTTTACAGAAAAATTCCAGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATaa < 1:136220/143‑1 (MQ=25) gggTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGc > 2:1218019/1‑151 (MQ=255) gTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCa > 2:395859/1‑150 (MQ=255) 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ggTTACAGTAAAATTCCAGAAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGt < 1:1265423/151‑1 (MQ=37) aCAGTTAAGTTCCAGG‑AGAAATACGCCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCTGCGTAAACGCCTTATCCGGTCTCCAAAAATGTGCAAATTCAATAAAGTGCAATGCAACTTGTAgga < 2:243183/151‑2 (MQ=255) ggTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTg > 1:616949/1‑151 (MQ=255) ggTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTg > 1:40379/1‑151 (MQ=255) ggTAAATTCCAGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCt < 2:1177659/150‑1 (MQ=255) tAAATTCCAGGCAGAAAAACA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGACTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGAt > 2:1267961/1‑151 (MQ=255) aaaTTCCAGGCAGAAACAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGATGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAAGGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGa > 2:407945/1‑149 (MQ=255) aaaTTCCAGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCt < 1:487523/147‑1 (MQ=255) aaaTTCCAGCCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAg < 1:81474/143‑1 (MQ=255) aaTCCCAGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATaa < 1:849164/151‑1 (MQ=255) tCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAagcg > 2:1015093/1‑151 (MQ=255) | CCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCG > NC_000913/2001764‑2002053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |