| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,569,172 | G→A | pseudogene (175/921 nt) | yjiP → | pseudogene, transposase_31 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,569,172 | 0 | G | A | 99.0% | 350.1 / NA | 96 | pseudogene (175/921 nt) | yjiP | pseudogene, transposase_31 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (42/53); minor base C (0/1); total (42/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
GCATGATGCATTATTTAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGGCGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGATGTAGCGCCATAT > NC_000913/4569024‑4569317 | gccttctgCATTATTTAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGacg > 1:1013855/7‑151 (MQ=255) cATGATGCATTATTTAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGCTTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCAAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGacg > 2:952010/1‑150 (MQ=255) atgatgCATTATTTAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCt > 1:1080703/1‑151 (MQ=255) atgatgCATTATTTAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCt < 1:1169315/151‑1 (MQ=255) atgCATTATTTAAAACCTTTCTCACGCTCCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGTTaca < 2:847275/151‑1 (MQ=255) gCATTATTTAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACt > 1:1045216/1‑151 (MQ=255) attattTAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTcc < 1:116/151‑1 (MQ=255) attattTAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATACACTTACCTAAAGAGTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTcc < 2:363013/151‑1 (MQ=255) tattTAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCg < 2:777705/150‑1 (MQ=255) attTAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGat < 1:713126/151‑1 (MQ=255) ttAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCTATATCTTAAAACTGTAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAAGTGCGGACGCTACACTCCGata < 2:321188/150‑1 (MQ=255) ttAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGatat > 1:261748/1‑151 (MQ=255) tAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTCCCTAACGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATCtt > 2:409964/1‑151 (MQ=255) tAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTACGATAtt > 2:146932/1‑151 (MQ=255) aaaaCCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATAtt < 1:211102/150‑1 (MQ=255) aaCCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATAtttt > 2:631160/1‑150 (MQ=255) aCCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTAt < 1:340385/151‑1 (MQ=255) aCCTTTCCCACGCACCCTGTCACTGCACGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTATGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCGACACTCCGTTCTTTTAt > 2:191714/1‑151 (MQ=255) cTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAATACTGGAATCCGCCAGCGGTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATg < 2:731773/150‑1 (MQ=255) ttCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTc > 1:642088/1‑151 (MQ=255) tctcACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCg > 1:999426/1‑151 (MQ=255) cACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGt > 1:650146/1‑150 (MQ=255) gCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTaa > 1:43073/1‑149 (MQ=255) cccTGACCCTGCGCTGGATTTTATGGAGAGTCACTTACCTAAAGATTTACGTTAACTTTGCGATCTCGTTCGCTTAAAACTGGAGTCCGCCATCATTGTCGATGAAAAAGTGCGGACGCTCCTCTCCGATATTTTATGGTCAGTTAAGAcc < 2:84003/151‑1 (MQ=255) gcgcGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCg < 1:463407/151‑1 (MQ=255) cgcgGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCg > 1:880153/1‑150 (MQ=255) gcgGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGAt < 2:143990/151‑1 (MQ=255) cgGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATg < 1:482554/151‑1 (MQ=255) gATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCt < 2:1013783/151‑1 (MQ=255) tttATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCtat < 1:316326/150‑1 (MQ=255) ttATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTatat > 1:83484/1‑151 (MQ=255) tATGGAGATTCACTTGCCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGTTCTCGATAGCTTAAACCTGGTTTACGTCAGCGTTGTCCATGAAAAATTGCGGCCTCTACACTCCGATATTTTATGGTCTCTAAAGACCCGCGAAGGCGATTGCTatat < 2:411423/150‑1 (MQ=255) tATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTatat > 2:1136554/1‑150 (MQ=255) tATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATc > 1:852881/1‑151 (MQ=255) tGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTatat > 2:956783/1‑148 (MQ=255) ggAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTAt > 1:585201/1‑151 (MQ=255) agaTTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTAtgt < 2:1138430/151‑1 (MQ=255) tCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATgtggt < 2:434719/150‑1 (MQ=255) tCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATgtggt < 1:487988/150‑1 (MQ=255) cTTACCTTAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGAtt > 2:65513/1‑151 (MQ=255) cTTACCGTAAGATTTACGTGAACTGTGCGACCTCGATAGCGTAAAACTGGAACCGGCCAGGTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCGGATAGTTTATGGTCAGTAAACTCGCGCGAAGGCGATGGCTATATCTAtgatgtgcc < 2:128876/150‑8 (MQ=255) aCCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTg > 2:1016788/1‑149 (MQ=255) ccTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGTTGGCTATATCTATGTGGTGATTGaa > 2:647324/1‑150 (MQ=255) ccTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAAc > 1:896886/1‑151 (MQ=255) aaaGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACa < 2:732621/149‑1 (MQ=255) aaaGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACa < 1:333408/149‑1 (MQ=255) aaaGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACAt < 2:277042/150‑1 (MQ=255) aaaGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACAt < 1:498622/150‑1 (MQ=255) aaaGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATc > 2:66208/1‑151 (MQ=255) aaaGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATc > 1:1150019/1‑151 (MQ=255) aaGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTTGAGGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCTGTAAAGACGCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGGGTTGATTGAACATCa < 2:1123034/151‑1 (MQ=255) aaGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCa < 1:271/151‑1 (MQ=255) aGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGAGAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTCCACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCTCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGAGTGAACATCag < 2:798621/151‑1 (MQ=255) gATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATc > 1:159696/1‑148 (MQ=255) gATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATc > 1:491504/1‑148 (MQ=255) gATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCaga < 1:599746/151‑1 (MQ=255) aCGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCcg < 2:890973/150‑1 (MQ=255) gTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCcgcg > 1:656436/1‑150 (MQ=255) gTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGa < 1:929663/151‑1 (MQ=255) gAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAgg < 1:706651/151‑1 (MQ=255) aaCTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGa < 1:969187/151‑1 (MQ=255) gtgCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACa < 1:361783/149‑1 (MQ=255) tgCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACAtt > 2:1173621/1‑150 (MQ=255) tgCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTc > 1:406325/1‑151 (MQ=255) gCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTc < 1:295213/150‑1 (MQ=255) gCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTc < 1:930817/150‑1 (MQ=255) gacctcGTTAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGATTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATGTTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATGTATGTGGTGATTGAACAACAGAGCCGCGAGGACATTCaga < 2:791885/148‑3 (MQ=255) cGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCatat < 2:202009/147‑1 (MQ=255) gATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCt < 1:1179690/151‑1 (MQ=255) aTAGCTTAAAACTGTAATCCGCCAGCTTGGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCTATATTTTATGGTCGATAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATTTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCt < 2:915327/150‑1 (MQ=255) aTAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCtt > 2:761324/1‑151 (MQ=255) aTAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCtt < 2:620660/151‑1 (MQ=255) gCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCg < 2:276295/151‑1 (MQ=255) cTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGATACACTCAGACATTTTATGGTCGGTAAAGACCAGCGAAGGCGATGGCTATATCTCTGTGGCGATTGAACATCAGAGCTGCGAGGACATTCATATGTCCTTTc > 2:1125/1‑149 (MQ=255) aaaCTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTg > 2:47482/1‑150 (MQ=255) aaCTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGAt < 1:943618/151‑1 (MQ=255) aTCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTAt > 1:606235/1‑151 (MQ=255) cGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTcc > 1:408511/1‑151 (MQ=255) gCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTcc > 2:307062/1‑150 (MQ=255) gCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTc > 2:721627/1‑149 (MQ=255) gCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCa < 1:583321/151‑1 (MQ=255) ccAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCAt < 1:1070895/151‑1 (MQ=255) cAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATg < 1:1103050/151‑1 (MQ=255) gCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGc > 1:300106/1‑151 (MQ=255) gCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGc < 1:929932/151‑1 (MQ=255) ttGTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCg < 2:896315/149‑1 (MQ=255) gTCGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGa < 1:682344/151‑1 (MQ=255) cGATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGATg < 2:897388/151‑1 (MQ=255) gATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGAt < 2:535014/149‑1 (MQ=255) gATGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGATGt < 2:43067/151‑1 (MQ=255) aTGAAAAATTGCGGACGCTTCACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGAt < 2:204310/148‑1 (MQ=255) tGAAAAATTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGATGt > 1:657737/1‑149 (MQ=255) aaaaTTGGGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCGATGGCGGGGATGTAgcg > 2:45596/1‑150 (MQ=255) aaTTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGATGTCGAGcc > 2:404237/1‑150 (MQ=255) aaTTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGATGTAGCGCCa < 2:146074/151‑1 (MQ=255) aTTGCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGATGTAGCGCCat > 2:611508/1‑151 (MQ=255) gCGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGATGTAGCGCCatat > 1:1134563/1‑150 (MQ=255) cGGACGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGATGTAGCGCCatat > 1:401990/1‑149 (MQ=255) | GCATGATGCATTATTTAAAACCTTTCTCACGCACCCTGACACTGCGCGGGATTTTATGGAGATTCACTTACCTAAAGATTTACGTGAACTGTGCGATCTCGATAGCTTAAAACTGGAATCCGCCAGCTTTGTCGATGAAAAATTGCGGGCGCTACACTCCGATATTTTATGGTCGGTAAAGACCCGCGAAGGCGATGGCTATATCTATGTGGTGATTGAACATCAGAGCCGCGAGGACATTCATATGGCCTTTCGCCTGATGCGCTATTCCATGGCGGTGATGTAGCGCCATAT > NC_000913/4569024‑4569317 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |