New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3382680 = | 48 (0.730) | 67 (1.020) | 62/298 | 0.1 | 57.0% | coding (481/1068 nt) | degS | serine endoprotease, periplasmic |
? | NC_000913 | = 3397130 | 53 (0.800) | coding (666/1470 nt) | rng | ribonuclease G |
GCCCAGCGAGTTCACCAGCGCGCCGCCAGAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3382829‑3382680 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGACAAGCAAGCTGGAGCATTACACAGGACGCCAGCCGATTTTCGATCTCTTTG < NC_000913/3397130‑3396985 GCCCAGCGAGTTCACCAGCGCGCCGCCAGAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGT > 1:581143/1‑151 CCAGCGAGTTCACCAGCGCGCCGCCAGAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTT < 1:386830/151‑1 AGCGAGTTCACCAGCGCGCCGCCAGAGTTACCGTGGTTAAGGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTC < 2:650457/150‑1 GTTCACCAGCGCGCCGCCAGAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGAT < 2:865738/151‑1 GTTCACCAGCGCGCCGCCAGAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGAT < 1:765777/151‑1 CAGCGCGCCGCCAGAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGA > 2:974252/1‑150 GCCGCCAGAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGAC < 2:572182/151‑1 CCAGAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGC > 2:496658/1‑150 AGAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATT > 1:221782/1‑151 AGAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCAGCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTTGGGTTCAGACCGATACGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCAT < 2:413971/150‑1 GAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTC < 2:342398/151‑1 GAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTC > 1:239259/1‑151 GTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGC > 2:226333/1‑151 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2:632175/151‑1 GTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCA < 2:947570/151‑1 TTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTC > 1:596436/1‑149 TAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCAC < 2:764327/150‑1 TAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGCTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACG > 1:172758/1‑151 AATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGC > 2:44780/1‑151 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1:648222/151‑1 GAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTA < 2:659365/151‑1 TTTGCCGCCCGGTCGGGTTCATACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGGATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGT < 1:361441/150‑1 GCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCA < 1:973802/150‑1 GCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAACGTTACTTGAGTTCAC > 1:772120/1‑151 CCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACC > 1:366316/1‑151 CCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCG > 2:969042/1‑151 CCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGG < 1:406008/151‑1 CGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGG > 2:694411/1‑150 GGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGG > 1:675080/1‑149 CGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTAC > 2:203018/1‑151 gtGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTGCGAAGCGTTACTTGAGTTCACCGCGGAGTACA < 1:678970/149‑1 TCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCC > 2:994151/1‑151 ACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAG < 1:1007290/151‑1 CGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCG > 2:600420/1‑147 TTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGAC > 1:536975/1‑151 GACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGACA > 1:669216/1‑149 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2:477702/1‑150 AATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGACAAGCAAGCTGGAGCAT < 1:694700/151‑1 AATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGACAAGCAAGCTGGAGCAT > 1:344155/1‑151 CCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGACAAGCAAGCTGGAGCATTACACA < 1:78953/151‑1 CCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGACAAGCAAGCTGGAGCATTACAC < 2:340811/150‑1 GGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGACAAGCAAGCTGGAGCATTACACAGGACG > 2:185198/1‑150 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1:145421/151‑1 CGAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGACAAGCAAGCTGGAGCATTACACAGGACGCCAGCCGATTTTCG > 1:206106/1‑150 GAGGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGACAAGCAAGCTGGAGCATTACACAGGACGCCAGCCGATTTTCGAT < 2:219080/151‑1 GGTTGTACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGACAAGCAAGCTGGAGCATTACACAGGACGCCAGCCGATTTTCGATC > 1:152187/1‑150 TACGGTTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGACAAGCAAGCTGGAGCATTACACAGGACGCCAGCCGATTTTCGATCTCTTTG > 2:2850/1‑151 GCCCAGCGAGTTCACCAGCGCGCCGCCAGAGTTACCGTGGTTAATGGAAGCATCGGTTTGGAGGAAGTTTTGCCGCCCGGTCGGGTTCAGACCGATTCGACCCGTGGCACTAATAATCCCCTGGGTAATGGTCTGCCCGAGGTTGTACGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3382829‑3382680 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTCGCCGATGCCGAACTGGACCGCATTCGCGTTGACTCACGCCTGACTTACGAAGCGTTACTTGAGTTCACCTCGGAGTACATTCCCGAGATGACAAGCAAGCTGGAGCATTACACAGGACGCCAGCCGATTTTCGATCTCTTTG < NC_000913/3397130‑3396985 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |