| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,536,197 | 0 | A | T | 46.7% | 67.1 / 68.0 | 75 | intergenic (+166/+417) | yjhR/nanS | pseudogene, helicase family; putative frameshift suppressor/9‑O‑acetyl N‑acetylneuraminic acid esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/36); new base T (35/0); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.63e-17 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCC > NC_000913/4536047‑4536346 | cATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTa < 1:367532/151‑1 (MQ=255) gATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGa < 1:305880/151‑1 (MQ=255) aTACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGaa < 1:619202/151‑1 (MQ=255) aTACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTTggg > 2:490564/1‑149 (MQ=255) cAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATga < 2:90449/151‑1 (MQ=255) aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATgaa < 2:346392/151‑1 (MQ=255) gtagtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCGTTTTTGAAt > 1:288142/1‑144 (MQ=255) gtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAAt < 2:416140/151‑1 (MQ=255) aGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaa < 1:211957/151‑1 (MQ=255) aGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaa < 2:873546/151‑1 (MQ=255) cATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGGTTTTGGAATTAAAGAAAAAgcaa > 2:27028/1‑147 (MQ=255) atTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGGTTTTTTGGAATAaaaaaaaaacaaacaaaa > 1:713890/1‑140 (MQ=255) atTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTTGGGATGAAAGAAAAAgcaaacaaaa > 1:144543/1‑148 (MQ=255) atTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCaata < 2:293458/150‑1 (MQ=255) tttACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GGTTTTTTGGATTTAAGAAAAAGCCAGCaataatt > 2:543513/1‑150 (MQ=255) ttACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataata < 1:481923/150‑1 (MQ=255) aTGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑aataat < 2:484385/151‑1 (MQ=255) gTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATgg < 2:518112/151‑1 (MQ=255) gTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATgg < 1:667825/151‑1 (MQ=255) aaGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCt < 2:978205/151‑1 (MQ=255) aaGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GCTTTTTTGGATGAAAAAAAATGGAAAAAAAAATAt‑aaaaa > 2:120271/1‑145 (MQ=255) gCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTTTGAATTAAAAAAAAAACAAGCAATAATAt‑aataaatggctta > 1:404013/1‑142 (MQ=255) gACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GGTTTTTTGGATGAAAGAAAAAGGAAACAATAAAAT‑AATAAATGGCTAAttt > 2:591765/1‑151 (MQ=255) gACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAAttt < 1:427697/151‑1 (MQ=255) tttCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGGCTTTTTGTATTGAAAAAAATAAAAAGCAAT‑ATAT‑AATAAAggggcaatttttt > 1:503420/1‑140 (MQ=255) tttCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTTTGAATGAAAAAAAAAGGAAGCAATAATAT‑AAAAAATGCCTAAtttttt > 2:17629/1‑151 (MQ=255) ccGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGC‑ATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGa < 2:991103/150‑1 (MQ=255) ccGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAAACTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGa < 2:288271/151‑1 (MQ=255) cGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGaa < 1:473590/151‑1 (MQ=255) gTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTTGGGATGAAAAAAAAAGCAAAGAATAATAT‑AATAATAGGCTAATTTCttttta > 2:882580/1‑147 (MQ=255) tttATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTTGGGATGAAAAAAAAAAAAAGCAAAAATAT‑AAAAAATGCCCAATttttttttaca > 2:708148/1‑145 (MQ=255) ttGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GCTTTTTGGGATGAAAGAAAAAACAAGGAAAAATAT‑AATAAAAGCCCAATttttttttaca > 2:76843/1‑141 (MQ=255) tGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCAtt < 2:208328/150‑1 (MQ=255) gCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTa < 2:220362/150‑1 (MQ=255) cGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GTGTTTTTGGATGAAAAAAAAAGCAAGCAAAAAAATAAAAAAAGCCCTAATtttttttacatta > 2:840281/1‑139 (MQ=255) aGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCa < 2:239356/151‑1 (MQ=255) aGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCa < 2:582503/151‑1 (MQ=255) gTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCat < 1:58756/151‑1 (MQ=255) gTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GCTTTTTGGGATGAAAGAAAAAGCAAAAAATAATAT‑AATAAAAGCCTAATTTTTTTTTAAATCATTAAACa > 2:941589/1‑150 (MQ=255) cGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCata < 1:814121/150‑1 (MQ=255) ccTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATatca < 2:377368/151‑1 (MQ=255) ccTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTTTGAAAGAAAAAAAAAGCAAACAATAATAT‑AATAAATGCCTTATTTTTTTTTAAATCATTAAACa > 2:881608/1‑146 (MQ=255) cTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTAGGGATGAAAAAAAAAACAAACAAAAAAAT‑TATAATTGGTTTATTTCTTTTTACATCCTTa > 2:338100/1‑141 (MQ=255) ttCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATatcat < 1:162475/149‑1 (MQ=255) ccTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GCTTTTTTGAAAGAAAAAAAATGAAAGAAATAATAT‑AATAAATGGCTAATTTTTTTTTACATCATTaaaaaaat > 2:501764/1‑138 (MQ=255) ccTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GCTTTTTGGGATTAAAAAAAAAGCAAGGAAAAATAA‑AATAATAGGCTAATTTTTTTTTAAATCCTTAAACaaattaaca > 2:951841/1‑144 (MQ=255) ataAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GCTTTTTGGAAATAAAAAAAAAAAAAGCAATAATAA‑AAAAAAAGGCTAAATTCTTTTTACATTCTTAAACATAAAATCATCCTCtttt > 2:656840/1‑151 (MQ=255) aaaTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTTTGAATGAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAT‑AAAAATTGACCAAATTTTTTTAAAATCATTAAACATATCATCATCGTCTAttt > 2:175542/1‑150 (MQ=255) aTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GCTTTTTTGAATGAAAAAAAAAGCAAAACAAAAAAT‑AATAAAGGGCTAATTTTTTTTTAAATCATTTAAAATATTATTATCCTCTCttt > 2:1018880/1‑148 (MQ=255) tATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGa < 1:45767/150‑1 (MQ=255) tATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGa < 2:604851/150‑1 (MQ=255) tGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTTTGGATGAAAGAAAAAGCAAGCAATAAAAT‑AAAAAAGGCCCAATTTTTTTTTAAATCAATTAACATATCATCATCGTCTATTTTTCCGAATcc > 2:868329/1‑151 (MQ=255) ttACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGt < 2:796832/150‑1 (MQ=255) tACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GCTTTTTTGATTGTAAGAAAAAGCAAAGAAAAAAAT‑AATAAAGGGGTAATTTTTTTTTAAAACATTTAAGATATCATTTATGTCTATTTGCCaaaaattgtcg > 1:329270/1‑144 (MQ=255) cTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTTGGGATGAAAAAAAAAGCAAACAAAAAAAT‑AAAAAAAGGCTAATTTTTTTTTAAATCATTTAAAAAATAATCATCGTCTATTTTTCAGAAACCg > 2:672566/1‑145 (MQ=255) cATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATaa < 1:672607/151‑1 (MQ=255) cATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTTTGAATGAAAAAAAAAGAAAGCAAAAATAT‑AATAATAGGCTAATTTTTTTTTAAATCATTAAGCATAATATCATCGTCTTTTTTTCAGAATCCGTCGACTtat > 2:550303/1‑149 (MQ=255) tCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTTGGGATGAAAAAAAAACCAAGCAATAAAAT‑AATAAAAGCCCAATTTTTTTTAATATTAATAAACATATCATCCTTGTCTATTTTTCAAAATCCGTCGACCTTTaa > 2:628111/1‑146 (MQ=255) tCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GCTTTTTTGAATGAAAAAAAAAGAAAACAAAAAAAT‑TAAAAAAGCCTAATTTTTTTTTAAAACATTAAACATATTATCCTCGGCTATTTTCCAGAATCCCGCGACtttttaacacc > 2:705758/1‑142 (MQ=255) ccTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGcc < 1:529974/150‑1 (MQ=255) ccTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCa < 2:714236/151‑1 (MQ=255) cTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTTGTGATTAAAGAAAACAGCAGCAAAAAAAT‑AAAAATTGTCTAAATTTTTTTTTAATAATTAAACATATAATCATCGTTTATTTTTCACAAACCGCCGTCTTTTaaacacc > 1:580833/1‑144 (MQ=255) cTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTTGGGAAGAAAGAAAAAACAAGCAAAAATAT‑AATAAAGGGCTAATTTTTTTTTACATCATTAAACATATCATCCTCCTCTATTTTTCCGAATACCTCGACTTATaaaaccc > 2:802831/1‑144 (MQ=255) tttGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GCTTTTTGGAATGAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAT‑AAAAAAAGCCTAATTTCTTTTAACATCATTAAACATATCATCATCGTCTATTTTTCCGAATACGTCGACTTATAATTGcc > 2:454265/1‑148 (MQ=255) ttGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGa < 1:179223/150‑1 (MQ=255) ttGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GCTTTTTGGGATGAAAAAAAAAGCAAACAAAAATAT‑AAAAAAGGCCTAATTTTTTTTAAAATCATTAAAAATATCATCATCGTCTATTTTTCACAAACCGTCGACTTATAATCGCCAGa > 2:632105/1‑150 (MQ=255) tGCATAATGCGCCTGGTATTAATTTC‑GGGT‑GCTTTTAGTAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGTCTTATAATCTCCAGat < 1:366492/150‑2 (MQ=255) gCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GCTTTTTTGGATGAAAGAAAAAGAAAGCAATAATAT‑AAAAAATGGCTCATTTTTTTTTAAATCATTAAGCATATCCTCATCCGCTCTTTTTCCGAAACCGTCCACCTTTAATCCCCaaa > 2:395363/1‑146 (MQ=255) aTAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGG‑GGTTTTTGGGA‑GAAAAAAAAAGCAAAAAAAAAAAT‑AATAATAGTCTAATTTTTTTTAAAATAATTAAAAATATAATCAACGTCTATTTTTTCAAATCAGTCCACTTATAATTACCAGaaa > 1:808172/1‑147 (MQ=255) aaTGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGG‑GGTTTTTTGGATGGAAAAAAAAACAAACAAAAAAAT‑AATAATGGCCCAATTTTTTTTTACATCATTAAACATATTATCATCGTCTATTTTTCCGAATACCTCGACTTATAATATCCACAACgg > 2:617223/1‑148 (MQ=255) gcCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAg < 1:672233/151‑1 (MQ=255) aTTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGtg < 1:488310/151‑1 (MQ=255) cTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCtgtg > 1:331422/1‑151 (MQ=255) ttttAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTgg > 2:747855/1‑151 (MQ=255) ttAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGc < 1:120209/150‑1 (MQ=255) tAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGccc > 1:397489/1‑151 (MQ=255) aGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGccc < 1:490309/150‑1 (MQ=255) | CATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGT‑GCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCC > NC_000913/4536047‑4536346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |