| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 700,614 | IS1 (–) +9 bp | coding (973‑981/1221 nt) | nagC ← | N‑acetylglucosamine‑inducible nag divergent operon transcriptional repressor |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 77 (1.100) | 68/298 | 0.1 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 700622 | 0 (0.000) | coding (973/1221 nt) | nagC | N‑acetylglucosamine‑inducible nag divergent operon transcriptional repressor | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 54 (0.770) | 51/298 | 0.6 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 700614 = | 0 (0.000) | coding (981/1221 nt) | nagC | N‑acetylglucosamine‑inducible nag divergent operon transcriptional repressor | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GTACCACCGGCAGATTAGTGCGAAACGCCTTCAGCGCCTGGGTATTAATGCAGCTTTCAATAGCAGGGAGCAGCACTTTATCGGCTTCGGTGATTTCACCGGCAATAACAATTTTTTGCGGATTAAATAAGTTGATAGCAATGGCGATGGTTTTACCCAGATGACGACCGACATACTCAATTACTTCCGACGCCAGACTATCGCCTTTGTTCGCGGCTTTGCAGATAGTTTTGATGGTGCAGTCGTCCAGCGGCACGCGGCTCTGGTAGCCCTGCTTTAACAGATTCAACACCCGTTGTT > NC_000913/700472‑700771 | gTACCACCGGCAGATTAGTGCGAAACGCCTTCAGCGCCTGGGTATTAATGCAGCTTTCAATAGCAGGGATCAGCACTTTATCGGCTTCGGTGATTTCACCGGCAATATCAATTTTTTGCGGATTAAATAAGTTGATAGCAATGGCGATGGt < 1:15744/151‑1 (MQ=255) gctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGGCGATGGttt < 1:503952‑M2/11‑1 (MQ=255) ccGGCAGATTAGTGCGAAACGCCTTCAGCGCCTGGGTATTAATGCAGCTTTCAATAGCAGGGAGCAGCACTTTATCGGCTTCGGTGATTTCACCGGCAATAACAATTTTTTGCGGATTAAATAAGTTGATAGCAATGGCGATGGTggtaat < 1:1029039‑M2/151‑7 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |