| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 701,614 | IS1 (+) +9 bp | coding (1130‑1138/1149 nt) | nagA ← | N‑acetylglucosamine‑6‑phosphate deacetylase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 46 (1.040) | 44/298 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 701622 | 0 (0.000) | coding (1130/1149 nt) | nagA | N‑acetylglucosamine‑6‑phosphate deacetylase | |||||
GCTTTGCTCGGCAATCTGAATCCGCGAGATTGGCCCGTACTGGTCAATCAGGCGATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCTCGTTACCGTTAACGATGGTCTTGGTGATTTTAAAATCAGGTGTGAATGCAGTCAGGTTGGCTACTTTACCTGCGGCGAGTGTGCCGAGACGTTTCTCAACGCCAATCGCACGCGCCGGATAGAGCGTCGCCATACGTAGCACTT > NC_000913/701469‑701763 | tgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGAcc < 2:82945‑M2/5‑1 (MQ=255)tgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGACCt > 2:433818‑M2/146‑151 (MQ=255)gCTTTGCTCGGCAATCTGAATCCGCGAGATTGGCCCGTACTGGTCAATCAGGCGATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCt < 1:498340/151‑1 (MQ=255) 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tctTATTGAGTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgc < 2:292930‑M2/151‑130 (MQ=255) ctTATTGAGTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgcc < 2:199077‑M2/151‑131 (MQ=255) tATTGAGTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccg > 1:293828‑M2/1‑19 (MQ=255) agtcattaccCGACCTCGTTACCGTTAACGATGGTCTTGGTGATTTTAAAATCAGGTGTGAATGCAGTCAGGTTGGCTACTTTACCTGCGGCGAGTGTGCCGAGACGTTTCTCAACGCCAATCGCACGCGCCGGATAGAGCGTCGCCATAc > 1:546789‑M2/11‑151 (MQ=255) gtcattaccCGACCTCGTTACCGTTAACGATGGTCTTGGTGATTTTAAAATCAGGTGTGAATGCAGTCAGGTTGGCTACTTTACCTGCGGCGAGTGTGCCGAGACGTTTCTCAACGCCAATCGCACGCGCCGGATAGAGCGTCGCCATACg > 1:115368‑M2/10‑151 (MQ=255) 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cattaccCGACCTCGTTACCGTTAACGATGGTCTTGGTGATTTTAAAATCAGGTGTGAATGCAGTCAGGTTGGCTACTTTACCTGCGGCGAGTGTGCCGAGACGTTTCTCAACGCCAATCGCACGCGCCGGATAGAGCGTCGCCATACGt > 2:12577‑M2/8‑150 (MQ=255) gTTACGACCTCGTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatca > 2:655012‑M2/1‑13 (MQ=255) cCGACCTCGTTACCGTTAACGATGGTCTTGGTGATTTTAAAATCAGGTGTGAATGCAGTCAGGTTGGCTACTTTACCTGCGGCGAGTGTGCCGAGACGTTTCTCAACGCCAATCGCACGCGCCGGATAGAGCGTCGCCATACGTAGCACtt < 1:440780‑M2/150‑1 (MQ=255) | GCTTTGCTCGGCAATCTGAATCCGCGAGATTGGCCCGTACTGGTCAATCAGGCGATAAACCGCCGCGCTGTTAAGCTGTTTTACGAGATCAACATTACCTATCTGAGCTTGTCCGCCTGGTGTCATACTTTCTCTTATTGAGTTACGACCTCGTTACCGTTAACGATGGTCTTGGTGATTTTAAAATCAGGTGTGAATGCAGTCAGGTTGGCTACTTTACCTGCGGCGAGTGTGCCGAGACGTTTCTCAACGCCAATCGCACGCGCCGGATAGAGCGTCGCCATACGTAGCACTT > NC_000913/701469‑701763 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |