Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 29,486 | 0 | C | A | 45.7% | 103.5 / 37.9 | 70 | intergenic (+291/‑165) | dapB/carA | dihydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase small subunit, glutamine amidotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/7); new base A (0/32); total (31/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.26e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATT > NC_000913/29341‑29636 | gttgttTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAaat < 2:323313/151‑1 (MQ=255) ttgttTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAaat > 2:581604/1‑150 (MQ=255) tAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAAtata > 1:741852/1‑150 (MQ=255) aTGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATaaa > 1:126874/1‑150 (MQ=255) tGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATaaaa > 2:849293/1‑150 (MQ=255) tAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATaaaaaa < 1:793304/150‑1 (MQ=255) aaaTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATc < 2:614006/151‑1 (MQ=255) aaTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATcc < 2:252498/151‑1 (MQ=255) tGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGcc < 2:571825/150‑1 (MQ=255) tGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGcc > 1:766313/1‑150 (MQ=255) gACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCAt > 2:920595/1‑151 (MQ=255) gACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCAt > 2:307109/1‑151 (MQ=255) ccATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCAtt > 1:561327/1‑150 (MQ=255) cATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTa > 2:518354/1‑150 (MQ=255) aTTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTa > 1:897930/1‑149 (MQ=255) ggcccttttttttCTGCTCTTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTCCCAAAACAGTTTAGATAATCTTTTTGTCGCTAAATGCCTGAAAAACTTGCATGGGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGtt < 1:705439/142‑1 (MQ=255) ccACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACtt > 1:967969/1‑151 (MQ=255) ttttttCTGCTCTTTTTTTTTTCATGCAT‑TTTTCTTCCTGCGAAATCTTTTCCAAAAACAGTTTAAATAATTTTTTTGTCGTTAAATCCCTAAAAAACTTGAATGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTa < 1:566492/150‑1 (MQ=255) ttttttCTGCTCGTTTTTTTTTCA‑GCAATTTTTTTTGCGGCGCAAGCGTTTCCAAAAACAGTTTAAATGATTTTTTTGCCGTTTAAGCCCTTAAAAACATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTa < 1:40183/150‑1 (MQ=255) ttttttCTGCTCGTTTTTATTTCATGAAT‑TCTTCTTGCTGCGAAAGCTTTTCCCAAAACAGGTTAAATGATTTTTTTGTCGTTTAATCCCTGAAAAACATGCATGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTa < 1:819661/150‑1 (MQ=255) ttttCTGCTCTTTTTTATTTCATGCAT‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTTCCAGAACAGGTTAGATGTTTTTTTTGTCGTTTAATGCCTGAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAgc < 2:505460/150‑1 (MQ=255) gCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCat > 2:728283/1‑150 (MQ=255) cTCGTTTTTATTTCATGCAT‑TCTTCTTGCGCCGAAAGCGTTTCCAAAACCGGGTTAAATAATTTTTTTGCCGCTTAATGCGTGTAAACCATAAGTAAGCCAAAAAAAAATATAAAAACTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCat < 2:658178/149‑1 (MQ=255) tttttttttttTCATGCAT‑TCTTTTTGCTGCGCAAGCTTTTCCCAAAACAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGTTTAATCCCTGTAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCat < 1:977798/145‑1 (MQ=255) tCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAtc > 1:922934/1‑151 (MQ=255) tCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAtc > 1:833923/1‑151 (MQ=255) cGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAtct > 2:106580/1‑151 (MQ=255) tttttATTTGAGGAAT‑TCTTCTTGCGGCGGAGGTGTTTTCAAGAAGGGGTTAGATGATTTTTTGGTCGCGTAGTGCGTGAAAAATATGCGTGGGCCAAAAAATAATAAAAAAAGTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATAtctc < 1:610952/150‑1 (MQ=255) ttttATTCCAAGCAC‑TCTTCTTCCCTCGCAGGTGTTTTCGATAACAGGTTAGATTTTCTTTTTGTCCGTTAATGCCTGAAAAACTGTTGTGGCCCAAAAAAAAATATAAAAAGTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTcc < 2:335125/150‑1 (MQ=255) tttttCATTCAT‑TCTTTTGGCTGCGCAAGCTTTTTCAAAAACAGTTAAGATGATTTTTTTGTCACTAAATCCCTAAAAAACATGAATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGa < 1:891701/148‑1 (MQ=255) tATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGa > 1:734220/1‑150 (MQ=255) tCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATgcc > 2:467693/1‑151 (MQ=255) cATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATgccg > 2:672524/1‑151 (MQ=255) cAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGt > 1:842491/1‑151 (MQ=255) cttcttGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGc > 1:278764/1‑151 (MQ=255) tcttGCTGCGCAAGCTTTTCCCAAAACAGGTTAGATGTTTTTTTTGTCGCTTAATGCTTTAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc < 2:938973/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCGCAAGCTTTTTCCAGAACGGGTTAGATGATTTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGAATGAGCCAAAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCa < 2:443958/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCGAAAGCGTTTCCCAGAACTGGTTATATGATTTTTTTTTCTCTAAATCCCTGAAAAACATGCATGCCCCACAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAg < 2:486638/150‑1 (MQ=255) gctgcGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGaa > 2:208554/1‑150 (MQ=255) cgcAAGCTTTTCCCAAAAAAGGTAAGATGATTTTTTTGTCGTTTAAGCCCTGAAAAACATGAATGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAAt < 2:456342/148‑1 (MQ=255) cgaaggcttttaCCAAAACAGGTTAAATAATTTTTTTGTCGATTATTGCCTGAAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtc < 1:669413/142‑1 (MQ=255) ccAGAACAGTTTAGATGATTTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCa < 2:220406/149‑1 (MQ=255) aaaaCAGGTTAGATGTTTTTTTTGTCGTTTAATGCCTGAAAAACATGCATGGGCCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAg < 2:760342/146‑1 (MQ=255) aaCAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTg > 2:702080/1‑151 (MQ=255) aCAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGc > 1:217504/1‑151 (MQ=255) aCAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGc > 2:387127/1‑151 (MQ=255) aCAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGc > 1:826243/1‑151 (MQ=255) aCAGGTAAGATGATTTTTTTGTCGCTTAATGCCTAAAAAACATGCAGGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGc < 2:228256/151‑1 (MQ=255) gtttAGATGATTTTTTTGTCGCTTAATGCTTGAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCa < 2:213888/147‑1 (MQ=255) ttAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTg > 1:325580/1‑150 (MQ=255) atgatTTTTTTGTCATTAAACCCTTGTAAAACGTGAATGGCCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGAt < 2:747379/148‑1 (MQ=255) atgatCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGAttt > 1:560373/1‑150 (MQ=255) gatCTTTTTGTCCCTTAATGCCTAAAAAACATTCATGCGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTa < 1:849168/149‑1 (MQ=255) tttttttGTCGTTTAATCCCTATAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGAtt < 1:242315/143‑1 (MQ=255) tttGTTGCTAAATGCTTAAAAAACATGCTTGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtcatc < 2:734331/150‑1 (MQ=255) ttAATGCTTAAAAAACATGAAGGACCAAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtgtg < 2:923070/148‑1 (MQ=255) tAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGTGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAAtt > 1:298069/1‑151 (MQ=255) aatctctaaaaaaCATCCATGAGCCAAAAAAAAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGa < 2:498556/138‑1 (MQ=255) 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aaaaCATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCa < 2:697634/149‑1 (MQ=255) aaaaCATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCaaa < 2:315532/151‑1 (MQ=255) accatgcatgGGCCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATa < 2:219892/149‑1 (MQ=255) aaCATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAAt > 1:219836/1‑150 (MQ=255) atgcatgACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAag < 1:307045/151‑1 (MQ=255) tgcatgACCCAAAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATGTCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATaaa < 2:750571/149‑1 (MQ=255) ccAAAAAATAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGaa < 2:888579/150‑1 (MQ=255) cacaAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAat > 2:173287/1‑150 (MQ=255) caAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATAtt > 1:858707/1‑151 (MQ=255) | GTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAA‑TCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATT > NC_000913/29341‑29636 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |