| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,765,456 | (TATGGCAC)6→5 | intergenic (‑303/+50) | yfjL ← / ← yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2765412 | 2765419 | 8 | 50 [0] | [0] 49 | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2765420 = | 0 (0.000) | 35 (0.810) | 33/210 | 0.5 | 100% | intergenic (‑267/+93) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 2765411 | 0 (0.000) | intergenic (‑258/+102) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein | |||||
TTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCG > NC_000913/2765276‑2765570 | tatcaagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactat < 1:343054‑M1/7‑1 (MQ=255) aagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggca > 2:20616‑M1/141‑151 (MQ=255) aagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggca > 1:245153‑M1/141‑151 (MQ=255) aagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgg < 2:781025‑M1/9‑1 (MQ=255) agcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcac > 1:14011‑M1/140‑151 (MQ=255) tttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcgctatggcacta > 2:767864‑M1/136‑149 (MQ=255) ttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgg < 1:133779‑M1/17‑1 (MQ=255) caggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggc > 2:96065‑M1/133‑150 (MQ=255) ccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggc < 2:730016‑M1/26‑1 (MQ=255) aaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcact < 1:417707‑M1/29‑1 (MQ=255) ccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg > 2:492987‑M1/111‑151 (MQ=255) ctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc < 2:710947‑M1/42‑1 (MQ=255) tgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACtatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac < 1:208210‑M1/44‑1 (MQ=255) 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ataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATca > 1:401683‑M1/89‑150 (MQ=255) aacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCacac > 1:312707‑M1/87‑151 (MQ=255) catactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACtt > 1:335819‑M1/85‑151 (MQ=255) ctgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggctttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGat < 2:665076‑M1/70‑1 (MQ=255) ccaactaacgtacggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtatta < 2:796311‑M1/74‑1 (MQ=255) actaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATaaaa > 1:880520‑M1/73‑151 (MQ=255) aacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAac > 1:179439‑M1/70‑149 (MQ=255) acgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAacac < 1:783012‑M1/82‑1 (MQ=255) cgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAacac < 2:375943‑M1/82‑1 (MQ=255) aaggtaggcccagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACCGTTg < 2:169856‑M1/87‑1 (MQ=255) aggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatatttcagagctgagaccgccaaccGCTCTATGGCACTATGGCACTATGTCACTATGGAACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAACCACAGtt > 2:495465‑M1/64‑149 (MQ=255) gacacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCATTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCa > 2:759490‑M1/59‑151 (MQ=255) agccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCattatt < 2:592422‑M1/98‑1 (MQ=255) ccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccAGATTATGGCACTATAGCACTATGGCATTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTAttt > 2:512099‑M1/52‑150 (MQ=255) caaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCtggttg > 2:13120‑M1/45‑151 (MQ=255) 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agttcagagctgagcccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATg > 2:821498‑M1/25‑150 (MQ=255) agttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATg > 2:847194‑M1/25‑150 (MQ=255) ttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGct < 2:344‑M1/128‑1 (MQ=255) gctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGa > 2:482894‑M1/17‑150 (MQ=255) gagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCa < 2:83870‑M1/137‑1 (MQ=255) 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GCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATcgcg > 1:452608‑M1/1‑151 (MQ=255) | TTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCG > NC_000913/2765276‑2765570 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |