| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,765,456 | (TATGGCAC)6→5 | intergenic (‑303/+50) | yfjL ← / ← yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2765412 | 2765419 | 8 | 66 [0] | [0] 64 | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2765420 = | 0 (0.000) | 47 (1.050) | 41/210 | 0.2 | 100% | intergenic (‑267/+93) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 2765411 | 0 (0.000) | intergenic (‑258/+102) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein | |||||
CAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATC > NC_000913/2765271‑2765567 | gcaggtatcaagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgc > 2:2144‑M1/150‑151 (MQ=255) tatcaagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactat < 1:663226‑M1/7‑1 (MQ=255) atcaagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatg < 1:1650‑M1/8‑1 (MQ=255) atcaagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatg < 1:807725‑M1/8‑1 (MQ=255) gcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcact < 1:172972‑M1/13‑1 (MQ=255) gcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcact < 1:737951‑M1/13‑1 (MQ=255) cttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcact < 2:505229‑M1/13‑1 (MQ=255) caggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggc > 2:664341‑M1/133‑150 (MQ=255) ggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcact < 2:500633‑M1/21‑1 (MQ=255) tccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatg > 2:268325‑M1/127‑150 (MQ=255) ccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggc > 1:765436‑M1/126‑151 (MQ=255) caaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcact < 2:669983‑M1/29‑1 (MQ=255) caaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcact < 2:45357‑M1/29‑1 (MQ=255) aatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactat > 2:970450‑M1/121‑151 (MQ=255) attgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggc > 1:518299‑M1/118‑151 (MQ=255) aaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactat < 1:204368‑M1/39‑1 (MQ=255) ccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg > 2:589111‑M1/111‑151 (MQ=255) cgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGc > 1:777353‑M1/105‑151 (MQ=255) tctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGcc < 2:609884‑M1/48‑1 (MQ=255) aatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCa > 2:890627‑M1/100‑148 (MQ=255) aatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGc > 2:602329‑M1/100‑150 (MQ=255) atttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCg < 2:25792‑M1/52‑1 (MQ=255) ggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGt > 1:245334‑M1/95‑151 (MQ=255) atataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAAt > 2:639540‑M1/91‑150 (MQ=255) atataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAAt > 2:384660‑M1/91‑150 (MQ=255) ataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATcac < 2:829796‑M1/63‑1 (MQ=255) aacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATcaca > 1:932461‑M1/87‑150 (MQ=255) ctgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGat < 2:780404‑M1/70‑1 (MQ=255) gccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGatat > 2:17837‑M1/79‑150 (MQ=255) gccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtatt > 2:856704‑M1/79‑151 (MQ=255) ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtatta > 1:974968‑M1/78‑151 (MQ=255) ccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtattat < 1:796021‑M1/75‑1 (MQ=255) taacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAac < 2:355372‑M1/80‑1 (MQ=255) acgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAacac < 1:785046‑M1/82‑1 (MQ=255) taaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGtt < 1:963838‑M1/86‑1 (MQ=255) taaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGtt < 1:131574‑M1/86‑1 (MQ=255) aggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGtt > 1:757334‑M1/64‑149 (MQ=255) cacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACGCAGTTGCACGCatt > 2:254236‑M1/57‑151 (MQ=255) agccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCattatt < 2:79809‑M1/98‑1 (MQ=255) agccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCattatt < 1:130787‑M1/98‑1 (MQ=255) agccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCattatt < 1:468803‑M1/98‑1 (MQ=255) ccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTc < 2:80429‑M1/100‑1 (MQ=255) taatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCt > 2:796170‑M1/49‑150 (MQ=255) aatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCtgg < 1:456817‑M1/104‑1 (MQ=255) aatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCtgg > 2:156424‑M1/48‑151 (MQ=255) ggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTa > 2:562298‑M1/42‑151 (MQ=255) ttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGTACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCtggttgg > 2:888722‑M1/40‑147 (MQ=255) ttttcaaatagatcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCat < 1:959418‑M1/117‑1 (MQ=255) tcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATAtct < 2:742291‑M1/121‑1 (MQ=255) tcaaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATAtc > 2:950185‑M1/31‑150 (MQ=255) caaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATAtctc < 2:203865‑M1/122‑1 (MQ=255) caaatagttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATAtctc < 2:853933‑M1/122‑1 (MQ=255) gttcagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGct < 2:735976‑M1/128‑1 (MQ=255) cagagctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCtt < 2:528040‑M1/131‑1 (MQ=255) ctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTg > 1:534696‑M1/16‑148 (MQ=255) ctgagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGc < 2:771308‑M1/136‑1 (MQ=255) gagaccgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCa < 2:365650‑M1/137‑1 (MQ=255) cgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCa > 2:756701‑M1/9‑151 (MQ=255) cgccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCa > 1:505121‑M1/9‑151 (MQ=255) ccaaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAAc < 1:903388‑M1/145‑1 (MQ=255) caaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACa > 2:856898‑M1/6‑151 (MQ=255) aaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACAt > 2:190143‑M1/5‑151 (MQ=255) aaccGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACAt < 1:474831‑M1/147‑1 (MQ=255) accGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATc < 2:488827‑M1/148‑1 (MQ=255) | CAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATC > NC_000913/2765271‑2765567 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |