| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_000913 | 2,672,981 | (CGCTAC)2→1 | coding (935‑940/1203 nt) | hcaD → | phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2672976 = | 1 (0.010) | 78 (0.970) | 65/276 | 0.3 | 99.4% | coding (930/1203 nt) | hcaD | phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit |
| ? | NC_000913 | = 2672969 | 0 (0.000) | coding (923/1203 nt) | hcaD | phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit | |||||
TGAGGCTTGCCGCACCTGCGATCCCGCGATCTTTGCCGGTGGCGATGTGGCAATCACTCGTCTTGATAATGGTGCACTACACCGCTGCGAAAGCTGGGAAAACGCCAATAACCAGGCGCAAATTGCCGCTGCCGCAATGTTAGGGCTACCGCTACCGCTACTGCCGCCGCCGTGGTTCTGGAGCGATCAGTACAGTGATAACTTACAGTTTATTGGCGATATGCGTGGCGATGACTGGCTTTGTCGTGGCAACCCGGAAACTCAGAAGGCGATTTGGTTTAATCTGCAAAACGGCGTGCTT > NC_000913/2672826‑2673126 | cattgatgaggcttgccgcacctgcgatcccgcgatctttgccggtggcgatgtggcaatcactcgtcttgataatggtgcactacaccgctgcgaaagctgggaaaacgccaataaccaggcgcaaattgccgctgccgcaatgttaggg < 1:718027‑M1/1‑1 (MQ=255) ttgatgaggcttgccgcacctgcgatcccgcgatctttgccggtggcgatgtggcaatcactcgtcttgataatggtgcactacaccgctgcgaaagctgggaaaacgccaataaccaggcgcaaattgccgctgccgcaatgttaggGc < 2:635171‑M1/2‑1 (MQ=255) atgaggcttgccgcacctgcgatcccgcgatctttgccggtggcgatgtggcaatcactcgtcttgataatggtgcactacaccgctgcgaaagctgggaaaacgccaataaccaggcgcaaattgccgctgccgcaatgttaggGCTAcc < 2:382020‑M1/6‑1 (MQ=255) 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gcaatgttaggGCTACCGCTACTGCCGCCGCCGTGGTTCTGGAGCGATCAGTACAGTGATAACTTACAGTTTATTGGCGATATGCGTGGCGATGACTGGCTTTGTCGTGGCAACCCGGAAACTCAGAAGGCGATTTGGTTTAATCTGCaa < 1:1251071‑M1/139‑1 (MQ=255) caatgttaggGCTACCGCTACTGCCGCCGCCGTGGTTCTGGAGCGATCAGTACAGTGATAACTTACAGTTTATTGGCGATATGCGTGGCGATGACTGGCTTTGTCGTGGCAACCCGGAAACTCAGAAGGCGATTTGGTTTAATCTGCaaaa > 1:1280829‑M1/11‑151 (MQ=255) atgttaggGCTACCGCTACTGCCGCCGCCGTGGTTCTGGAGCGATCAGTACAGTGATAACTTACAGTTTATTGGCGATATGCGTGGCGATGACTGGCTTTGTCGTGGCAACCCGGAAACTCAGAAGGCGATTTGGTTTAATCTGCAAAACg > 1:128390‑M1/9‑151 (MQ=255) tgttaggGCTACCGCTACTGCCGCCGCCGTGGTTCTGGAGCGATCAGTACAGTGATAACTTACAGTTTATTGGCGATATGCGTGGCGATGACTGGCTTTGTCGTGGCAACCCGGAAACTCAGAAGGCGATTTGGTTTAATCTGCAAAACgg < 1:674641‑M1/144‑1 (MQ=255) gttaggGCTACCGCTACTGCCGCCGCCGTGGTTCTGGAGCGATCAGTACAGTGATAACTTACAGTTTATTGGCGATATGCGTGGCGATGACTGGCTTTGTCGTGGCAACCCGGAAACTCAGAAGGCGATTTGGTTTAATCTGCAAAACGGc > 2:269194‑M1/7‑151 (MQ=255) aggGCTACCGCTACTGCCGCCGCCGTGGTTCTGGAGCGATCAGTACAGTGATAACTTACAGTTTATTGGCGATATGCGTGGCGATGACTGGCTTTGTCGTGGCAACCCGGAAACTCAGAAGGCGATTTGGTTTAATCTGCAAAACGGCGt > 2:1120628‑M1/4‑150 (MQ=255) GCTACCGCTACTGCCGCCGCCGTGGTTCTGGAGCGATCAGTACAGTGATAACTTACAGTTTATTGGCGATATGCGTGGCGATGACTGGCTTTGTCGTGGCAACCCGGAAACTCAGAAGGCGATTTGGTTTAATCTGCAAAACGGCGTGCtt < 2:88129‑M1/151‑1 (MQ=255) GCTACCGCTACTGCCGCCGCCGTGGTTCTGGAGCGATCAGTACAGTGATAACTTACAGTTTATTGGCGATATGCGTGGCGATGACTGGCTTTGTCGTGGCAACCCGGAAACTCAGAAGGCGATTTGGTTTAATCTGCAAAACGGCGTGCtt > 2:1036825‑M1/1‑151 (MQ=255) | TGAGGCTTGCCGCACCTGCGATCCCGCGATCTTTGCCGGTGGCGATGTGGCAATCACTCGTCTTGATAATGGTGCACTACACCGCTGCGAAAGCTGGGAAAACGCCAATAACCAGGCGCAAATTGCCGCTGCCGCAATGTTAGGGCTACCGCTACCGCTACTGCCGCCGCCGTGGTTCTGGAGCGATCAGTACAGTGATAACTTACAGTTTATTGGCGATATGCGTGGCGATGACTGGCTTTGTCGTGGCAACCCGGAAACTCAGAAGGCGATTTGGTTTAATCTGCAAAACGGCGTGCTT > NC_000913/2672826‑2673126 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |