Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,536,197 | 0 | A | T | 40.0% | 124.0 / 61.1 | 90 | intergenic (+166/+417) | yjhR/nanS | pseudogene, helicase family; putative frameshift suppressor/9‑O‑acetyl N‑acetylneuraminic acid esterase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/51); new base T (36/0); total (39/51) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.28e-22 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTG > NC_000913/4536050‑4536340 | gATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGa < 1:667305/151‑1 (MQ=255) tACAGTAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GT‑TTTTTGGTAt > 2:1190509/1‑151 (MQ=255) aCAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAAt < 1:654730/150‑1 (MQ=255) aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATgaa < 1:67470/151‑1 (MQ=255) aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATgaa < 1:500862/151‑1 (MQ=255) agtagtAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATgaaaga < 1:1350727/151‑1 (MQ=255) gtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAAt < 2:106743/151‑1 (MQ=255) tcaaGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GG‑TTTTTTGTATTaaaaaaaa > 2:904173/3‑149 (MQ=255) taAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTTTGAATGAAATaaaa > 2:439759/1‑149 (MQ=255) aGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaa < 1:1209008/151‑1 (MQ=255) aGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGC‑GC‑GTTTTTGAATGGAAGAAAAAgca > 1:933170/1‑150 (MQ=255) aGGGCATATGTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTACTGCTTATAAATCTTCTTGTTTACCTAATCATTATCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGTCTTGT‑GG‑TTTTAGGACTGATAGTAAATgaac < 2:1097741/151‑4 (MQ=255) ggCATATTTTGCCAATTTTAAGGCGACTTTCCGTTTTAGTGCGGGTCGGCTTTCCTCATCATAAAGCTTATTGTGGACCTAATCTTGTGCTTTTGCGTAATGCTCCTGCAATTAATGACGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAGAATgcaa < 2:1091875/149‑1 (MQ=255) ggCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaagc < 2:399941/151‑1 (MQ=255) cATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GG‑TTTTTGGGATGAAAAAAAAAgcaaaca > 1:1286945/1‑150 (MQ=255) atatTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaagcaa < 1:25492/150‑1 (MQ=255) ttACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataata < 1:1027010/150‑1 (MQ=255) ttACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataata < 2:133894/150‑1 (MQ=255) ttACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataata < 1:178986/150‑1 (MQ=255) tACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataatat < 1:1121407/150‑1 (MQ=255) tACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataatat < 1:1261033/150‑1 (MQ=255) tACCAATGTTAAGGAGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTGTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCaataattt < 2:1108541/150‑3 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAACCAataatata < 2:469213/150‑1 (MQ=255) ccAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataatataat < 2:38279/151‑1 (MQ=255) ccAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GG‑TTTTTTGAATTGAAAAAAAAgcacaaaaaaaaataa > 2:1149040/1‑137 (MQ=255) cAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAAtaatataat‑a < 1:1018165/151‑1 (MQ=255) aaTGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATAtaat‑aa < 1:792900/151‑1 (MQ=255) gTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATgg < 1:904270/151‑1 (MQ=255) gTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATgg < 1:445317/151‑1 (MQ=255) ttAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGA‑GC‑TTTTTAGAATGAAAAAAAAAGCAAGCAATAAAAtaat‑aa > 2:1232374/1‑147 (MQ=255) aaGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GG‑TTTTTGGTATTAAAGAAAATACAAGCAATAATAtaat‑aa > 2:19182/1‑145 (MQ=255) aaGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GC‑TTTTTGGAATGAAAAAAAAAACAAACAAAAATATAAT‑AAAggtc > 1:315024/1‑148 (MQ=255) gACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAAttt < 1:930379/151‑1 (MQ=255) ttCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCt < 1:661798/149‑1 (MQ=255) ttCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GG‑TTTTTTGAATTAAAAAAAAAATAAACAATAAAATAAA‑AATAGCCTCATtttttt > 2:110439/1‑151 (MQ=255) ttATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAAcat < 2:1349327/150‑1 (MQ=255) aTTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAAcatca < 1:170558/150‑1 (MQ=255) cGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAg < 1:1143179/151‑1 (MQ=255) ccTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GT‑TATTTTGGATTTAAGAAGAAGCAAACAATAATATAAT‑AAATTCCTTATTTTTTTTAACattatttaaca > 2:324184/1‑141 (MQ=255) cTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTTTGAATGAAAGAAAAAGCAAGCAAAAAAAAAAT‑AAAGGGCTTATTTTTTTTAAAATCATTAAGAata > 2:1362505/1‑147 (MQ=255) cTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GC‑CTTTTTGAATGAAAGAAAATGAAAACAATAAAATAAT‑AATAGCCTAATTTTTTTGAAAATTATTaaaaa > 1:1356853/1‑142 (MQ=255) tCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGC‑GG‑TTTTTGGAAAGAAAGAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAGGACTTATTTCTTTgtataaaattaaaca > 1:692195/1‑128 (MQ=255) cTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GG‑TTTTTGGGATGAAAAAAAAAACAAACAATAATATAAT‑AAATGGCTAATTTTTTTTAAAAACATTAAACata > 1:1219127/1‑142 (MQ=255) gATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCAGATCATCATCGTc < 2:1101609/151‑1 (MQ=255) ataAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTTTGGATGAAAAAAAAAGCAAACAAAAATATAAT‑AAATGGCTAATTTTTTTTTACATCATTTAAAATATCATCATTGTCTAtt > 1:665815/1‑151 (MQ=255) ataAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTAtt < 2:1115101/151‑1 (MQ=255) ataAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTAt < 1:326083/150‑1 (MQ=255) aaaTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTTTGAATGAAAAAAAAAGCAAACAATAAAATAAA‑AAAAGGCTAATTTTTTTTAAAATCATTAAACATATCATCATCGTCTAtttt > 1:833629/1‑150 (MQ=255) aaaTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTg < 2:683857/151‑1 (MQ=255) tCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GCTTTTTAGGAA‑GAAAAAAAATGCAAGCAAAAAAAAAAA‑AAAAGGCTAATTTTTTTTTAAATTATTAAACATATTAATATTGTCTTTTTGcc > 1:549043/1‑150 (MQ=255) tCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑CTTTTTGAATTTAAAAAAAAACAAGCAAATATTTAAT‑AATTGCCTCATTTTTTTTTAAATCATTTATCATattttcatcacccactttccc > 2:1339000/1‑139 (MQ=255) tCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GG‑TTTTTGGAATGAAAGAAAAAGCAAAAAAAAATATAAT‑AATAGGCTAATTTTTTTTTAAATCAATAAACATAATATCATCCTCTtttt > 1:404076/1‑147 (MQ=255) tATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGTCCTAATTTCTTTGAACGTCATTAAGCATATCATCAGCGTCTATGTGCCa < 2:1314894/148‑1 (MQ=255) tATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGa < 1:640408/150‑1 (MQ=255) aTTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGaa < 2:932545/150‑1 (MQ=255) aTTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GT‑TTTTTGGGATTAAAGAAAATGCAAGCAAAAATATAAT‑AAAGGCCTAAATTTTTTTAACATCATTAAAAATATCATCATCGTCTAtttttcag > 1:548839/1‑143 (MQ=255) gTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GT‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCACTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATc < 1:724506/149‑1 (MQ=255) gTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATcc < 1:122733/150‑1 (MQ=255) gTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GC‑TTTTTGGGATGAAAAAAAAAAGAAGCAAAAATAAAAT‑AAATGCCTAATTTTTTTTAACAACATTAAACATAAAATCATTGTCTTTTTTTCAGaa > 1:142690/1‑147 (MQ=255) tttACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GG‑TTTTTGGAATGAAAAAAAAAACAAGCAAAAAAATAAT‑AAAAGCCCAATTTTTTTTAACATCATTTAGCATATCATCATCGTCTATTTTTCAGAAttc > 1:1212906/1‑147 (MQ=255) ttACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGt < 2:875882/150‑1 (MQ=255) tACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTc < 2:308257/150‑1 (MQ=255) ccTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GC‑TTTTTTGAATGAAAGAAAAAGCAAGCAAAAAAATAAA‑AAAGGCCTAATTTTTTTTTACATCATTAAGAATATCATCATCGTCTTTTTTCCCGAAACCGTCGAc > 1:1103314/1‑151 (MQ=255) cTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCAGTCg < 2:329139/148‑1 (MQ=255) cTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑AT‑TTTTTTGATTTTAAAAAAAAACAAGCAAAAAAATAAT‑AAAAGGCTTATTTTTTTTTAAATCATTAAAAATATAATCATTGTCTCTTTTCTAGAATccctaca > 2:252507/1‑144 (MQ=255) cTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GC‑CTTTTGGGATGAAAAAAAAAGCAAACCAAAATATAAA‑AAAGGGCTAATTTTTTTTAAAATCATTAAAAATATCATCATCCTCTATTTTTCAGAATACGTCGAc > 1:458421/1‑150 (MQ=255) tAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGGC‑TTTTTGG‑ATGAAAAAAAAAAGAAGCAAAAAAATAATAAATGGCC‑AATTTTTTTTAACAACAATTAACAGATCATCATCGTCTCTTTTCCAGGAtaccgctac > 1:810536/1‑141 (MQ=255) aaTCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACt < 2:45822/149‑1 (MQ=255) cATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GG‑TTTTTGGGATGAAAAAAAAAGGAAGCAATAATATAAT‑AATAGGCTAATTTTTTTTAACAATATTAAAAATATAATAATCTTCTATTTTTCAGAAAACGCCGACTta > 1:29883/1‑148 (MQ=255) cATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATaa < 1:65206/151‑1 (MQ=255) aTTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GG‑TTTTTGGGATTAAAAAAAAAGCAAACAATAAAATAAA‑AATAGCCTTATTTTTTTTTAAATCATTAAACATATCATCATCGTCTTTTTTTCAGAAACCGCCGACTTTTaa > 1:970641/1‑150 (MQ=255) aTTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GC‑TTTTTTGGTTGAAAGAAAAAGCAAGGAAAAATATAAT‑AAAGGCCTAATTTCTTTTTAAAACATTTAAAATATAATCATCGTCTTTTTGTCAGAAACCGTCGACTtat > 2:221961/1‑148 (MQ=255) cTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GG‑TTTTTGGGATTAAAAAAAAAGCAAGGAATTAAATAAT‑AAAGGGCTTATTTTTTTTAAAAATATTAAAAAAATCATAATCGTCTATTTTTCAGAATTCGTCGCCTTATAATCTcc > 2:158979/1‑149 (MQ=255) cTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GC‑TTTTTGGAATGAAAAAAAAAGCAAGCAAAAATATAAA‑AAAAGCCTAATTTTTTTTTACATCATTAAACATATCATCATCGTCTATTTTTCAAAATCCGTCCACTTATAAttccc > 1:994601/1‑145 (MQ=255) cTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGC‑GC‑TTTTTGGCATTAAAGAAAAATGAAGGAAAAATAAAAT‑AATGGGATCATTTTTTTTAAAAACATTTAAAATATCATCATAGTCTATTTTTCCGAATTCGTCGACTTATAATTGcc > 2:184703/1‑149 (MQ=255) tttGCATAATGCGCCTGGGATCAATGGCGGGT‑GC‑TTTTATGTATGGAAGAAAATGCCAGCAATAATATAAT‑AAAGGGCTTATTTTTTTGAAAAAAATTAAACAAATCATCAAAGTCTATTTTCCAGAATACGTTGAATTATAAACGc > 2:892678/1‑147 (MQ=255) tGCACAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGaa < 2:1315425/150‑1 (MQ=255) gCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GC‑TTTTTTGAATGAAAAAAAAAGCAAACAAAAATATAAT‑AAAGGCCTAATTTTTTTTAAAATCATTAAGCATATTATCATCGTCTATTTTTCAGAAACCCGCGACCTATAATCGCCAGaa > 1:1073876/1‑149 (MQ=255) aTAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GG‑TTTTTTGAAAGAAAAAAAAAGGAAGCAAAAATATAAT‑AATAGGCTAATTTTTTTTTAAATCATTTAGCATTTCATCATCGTCTATTTTCCAGAAACCGTCGACTTTTAAATGCCCGaa > 1:1143377/1‑147 (MQ=255) tAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GC‑TTTTTTGGAAAAAAAAAAAAACAAACAATAAAATAAT‑AATAGCCTAATTTTTTTTTACAATATTAAACATATCATCATCGTCTTTTTTTCAGAATCCGTCGGCTTATAATTTCCAGAACGGc > 1:1103679/1‑150 (MQ=255) aaTGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCat < 1:770462/151‑1 (MQ=255) ccTGGGATTAAAGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAg < 2:99498/150‑1 (MQ=255) gggATTAATGGCGGGTGGT‑TTTTTGAAATAAAAAAAAAACCAGGAAATAA‑ATAAT‑AATGGGCTAATTTTTTTTAAAATCATTAAAAAAATAAACATCATCTATTTTCTAGAATCCGTCGACTTATAATTACCAGAAAGGCctataaag > 2:59619/1‑144 (MQ=255) gATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGt < 1:399820/151‑1 (MQ=255) aTTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGtg < 1:588511/151‑1 (MQ=255) aTTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGt < 2:748699/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCg > 1:91807/1‑151 (MQ=255) cGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAAc < 1:1233093/151‑1 (MQ=255) cGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAAc < 1:430662/151‑1 (MQ=255) gC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCtg < 2:38530/150‑1 (MQ=255) | GATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAAT‑AATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTG > NC_000913/4536050‑4536340 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |