Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 29,496 | 0 | T | A | 43.8% | 92.4 / 30.6 | 64 | intergenic (+301/‑155) | dapB/carA | dihydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase small subunit, glutamine amidotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/4); new base A (0/28); total (32/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.43e-14 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTGGAGGG > NC_000913/29348‑29646 | tAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAAtata > 1:717978/1‑150 (MQ=255) tAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAAtata < 1:43234/150‑1 (MQ=255) aaTGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATaaa < 2:478223/151‑1 (MQ=255) aaTGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATaa > 2:996877/1‑150 (MQ=255) tGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATaaaa > 2:52199/1‑150 (MQ=255) aTTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATccc > 1:978370/1‑151 (MQ=255) tttGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGc > 1:637553/1‑151 (MQ=255) gACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCa < 1:49587/150‑1 (MQ=255) aTTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTa > 2:747785/1‑149 (MQ=255) aTTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTa > 2:252258/1‑149 (MQ=255) ggcccATTTTTTTCTGCTCTTTTTTTTTTCATGCAATCTTCTTGCTGCCAAAGCGTTTCCAAAAACAGGTTAAATAATTTTTTTGTCGTTTAT‑TCCCTGA‑AAAA‑CATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTg < 1:792513/147‑1 (MQ=255) gTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGAc > 2:929153/1‑151 (MQ=255) ttttttCTGCTTTTTTTTTTTTAATGCATTCTTTTTGCTGCGAAGGCTTTTTCAAAAACAGTTAAAATAATTTTTTTGTCTCTAAA‑TCCCTGA‑AAAA‑CATGAATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTa < 1:920841/150‑1 (MQ=255) tttttCTGCTTTTTTTTATTTCATGCAATTTTCTTGCTGCGAAAGCGTTTTCCAGAAAAGGTTAGATGATC‑TTTTGGCCCTTAATTGCTTAA‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAg < 2:332094/150‑1 (MQ=255) ttCTGCTCTTTTTTATTTCATACAATTTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTTCCAAAACAGGTTAAATGATTTTTTTTTCTCTTAT‑TCCCTGA‑AAAA‑CTTGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAgcgc < 1:459730/150‑1 (MQ=255) ctctTTTTTTTTTCATGCAATTTTTTTGCTGCGCAAGCTTTTTCCAGAACAGTTTAGATAATTTTTTTGTCGTTTAA‑TCCCTTA‑AAAA‑CTTGCATGACCCAAAAAAAAATATAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCa < 1:220267/148‑1 (MQ=255) ctctTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAGGCTTTTTCCAGAACAGTTTAGATGATTTTTTTGTCGTTTAA‑TGCCTGA‑AAAA‑CATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCat < 2:479260/149‑1 (MQ=255) tcttttttATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTCCCAAAACAGGTTAGATGTTTTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTAA‑AAAA‑CATGCATGAGCCAAAAAATAATATAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGccc < 1:249684/143‑1 (MQ=255) tttttATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTcc > 1:836462/1‑151 (MQ=255) tATTTCATGCATTCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGTTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCAGGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGa < 2:340949/150‑1 (MQ=255) tttCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTCCCAGAACAGTTTAGATGATTTTTTTGTCGCTAAA‑TGCCTGA‑AAAA‑CATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAAt < 2:841048/150‑1 (MQ=255) tttCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATg > 1:599960/1‑151 (MQ=255) aTGCATTCTTTTTGCTGCGAAAGCTTTTTCCAAAAAGGGTAAGATGATTTTTTTGCCGTTTAA‑TGCTTAA‑AAAA‑CATGCATGAGCAAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATgccgc < 2:495515/151‑1 (MQ=255) tcttctTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTg > 1:619660/1‑151 (MQ=255) tcttGCTGCGCAAGCGTTTTACAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc > 1:891958/1‑150 (MQ=255) cttGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc > 1:713436/1‑149 (MQ=255) tggctacaaaaGTGTTTCCCAAAAAAGTTAAGAGTATCTTTTTCTC‑TTTAA‑AGCCTTA‑AAAACCATGCTGGACCAAAAAAATAAAAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGtt < 1:137987/135‑1 (MQ=255) ctgcGAAGGCTTTTCCAAAAACAGGTAAGATGATTTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTTA‑AAAA‑CATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCa < 1:122033/146‑1 (MQ=255) tgcGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAAtt > 2:446805/1‑151 (MQ=255) cgcAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGA‑AAAA‑CATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtc < 2:344887/150‑1 (MQ=255) cAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgtc > 2:681459/1‑151 (MQ=255) gcttttcCCAAAACGGTTTAGATGTTTTTTTTGTCTTTAAA‑TGCCTAA‑AAAA‑CATGCATGACCAAAAAAATAATAAAAAAATTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcg < 2:394052/143‑1 (MQ=255) gTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTa > 2:257218/1‑150 (MQ=255) ttttCCAAAACAGGTTAGATAATTTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGA‑AAAA‑CATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGt < 1:252192/148‑1 (MQ=255) ttttCAAGAACAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGA‑AAAA‑CATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCgg < 2:1011374/147‑1 (MQ=255) tttcCCAAAAAAGGTAAGATAATTTTTTTGTCGTTTAA‑TCCCTGA‑AAAA‑ATTGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgtc < 1:4996/145‑1 (MQ=255) ccAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGc > 1:885216/1‑148 (MQ=255) aGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGAtt > 1:663724/1‑151 (MQ=255) cAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGc > 2:598605/1‑150 (MQ=255) gatCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACg > 2:907337/1‑151 (MQ=255) gatCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACg > 2:455288/1‑151 (MQ=255) tttttttGTCTTTTAA‑GCCCTAA‑AAAA‑CATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGt < 1:511921/148‑1 (MQ=255) tttttGTCGTTTAA‑TGCCTGA‑AAAA‑CATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtca < 2:458062/150‑1 (MQ=255) tttGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtcatc > 1:50236/1‑150 (MQ=255) gTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtg > 2:371126/1‑151 (MQ=255) tCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtgt > 1:992775/1‑151 (MQ=255) cgttaaa‑TGCTTGA‑AAAA‑CATGCATGAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCAtt < 2:103003/143‑1 (MQ=255) cGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtgtg > 2:88176/1‑151 (MQ=255) gCTTAA‑TGCCTGA‑AAAA‑CATGCATGACCCAAAAAATATTAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtgtg < 2:230868/150‑1 (MQ=255) ta‑TGCCTTTAAAAA‑CTTGCAACAGCCAAAAAATAATAAAAAAATTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAAt < 2:718099/149‑1 (MQ=255) a‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTa > 2:995954/1‑150 (MQ=255) ccttaaaaa‑CATGAATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAAt < 1:996715/140‑1 (MQ=255) aaaa‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCaa > 1:481151/1‑150 (MQ=255) aaaa‑CAGGCAGGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATg < 2:978532/147‑1 (MQ=255) aaaa‑CAGGAAGGACCCAAAAAATAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCaa < 1:952295/150‑1 (MQ=255) aaa‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAAt > 1:758675/1‑151 (MQ=255) a‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATa > 2:68310/1‑150 (MQ=255) atgAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg > 2:505115/1‑149 (MQ=255) tgAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgagt > 1:239492/1‑151 (MQ=255) gAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgagtg > 1:265524/1‑151 (MQ=255) gAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgagtg < 2:637663/151‑1 (MQ=255) aaaaaaaaaaaaaaaaTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATtc < 1:123309/151‑1 (MQ=255) aaaaaaATAAAAAAACCCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAatat < 2:775225/149‑1 (MQ=255) aaaaTAATAAAAAAAACCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATtc < 1:257150/151‑1 (MQ=255) aaaTAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATtct > 1:731521/1‑151 (MQ=255) aataAAAAAACTCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTgg < 2:151938/151‑1 (MQ=255) aataAAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTgg < 1:521306/151‑1 (MQ=255) tataAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTgg > 2:1034644/1‑149 (MQ=255) taAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTGGAggg > 2:779555/1‑151 (MQ=255) | TAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAA‑TGCCTGT‑AAAA‑CATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAATATTCTCTGGAGGG > NC_000913/29348‑29646 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |