| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,326,450 | 0 | T | G | 43.9% | 145.0 / 14.2 | 82 | G114G (GGT→GGG) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/38); new base G (36/0); total (44/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.07e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGA > NC_000913/2326304‑2326596 | gcgcGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATgg < 1:417936/151‑1 (MQ=255) cgTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATggga > 2:528615/1‑148 (MQ=255) cgTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATg > 1:1133818/1‑147 (MQ=255) tCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGgaaa > 1:546938/1‑150 (MQ=255) cAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTCTGGaaaa > 2:187543/1‑149 (MQ=255) aGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAatat < 1:1007519/151‑1 (MQ=255) ggCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCGGCCCAAGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAatat < 1:58375/150‑1 (MQ=255) cTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGtt > 2:80751/1‑151 (MQ=255) gTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGttt < 2:286659/150‑1 (MQ=255) gTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGttt < 1:540388/150‑1 (MQ=255) gTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTa < 1:130530/151‑1 (MQ=255) ttAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATGAGgtt > 2:961938/1‑149 (MQ=255) tAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAg < 2:68711/150‑1 (MQ=255) aaGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGccccc < 1:1079700/151‑1 (MQ=255) aaGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGTTTAGccccc > 1:1109910/1‑151 (MQ=255) aGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCt < 2:1147476/151‑1 (MQ=255) cGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCtac > 1:97906/1‑151 (MQ=255) tGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCtacttac > 1:344548/1‑150 (MQ=255) ggCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCtacttact < 2:1055836/150‑1 (MQ=255) cAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGTTTAGCCCCCTACCTACTCg > 1:1020121/1‑150 (MQ=255) cAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGAGGGAAAATATTGGTTTAGCCCCCTCCTTACTCg > 1:306269/1‑150 (MQ=255) aGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAt < 2:1093780/151‑1 (MQ=255) aaaCGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGGAAATATGAGTTTTGCCCCCTACTTACTCg > 1:421271/1‑147 (MQ=255) ggTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCaaa < 2:988735/150‑1 (MQ=255) gtgCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCa < 2:144835/151‑1 (MQ=255) gCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCGAAAGCACg < 2:1110337/151‑1 (MQ=255) ggATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGTTTAGCCACCATCTTATTCCCT‑GGAAAAACACg > 2:962830/1‑149 (MQ=255) gATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGCTGGAAAATATGAGATTAGCCCCCCACCTACTCGAT‑GTAAAAGGACGctc > 1:566540/1‑151 (MQ=255) ttCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGGAAATATTGGTTTTGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAACACGctct > 2:46857/1‑150 (MQ=255) ttCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTg > 1:457950/1‑151 (MQ=255) ttCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCCACTTACTCGAT‑GCAAAAGAACGccct > 1:281851/1‑150 (MQ=255) aCGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAAAATGGGGTTAGCCCCCTACTTACTTGAT‑GCAAAAACACGCCCTgg > 1:855294/1‑149 (MQ=255) ggTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTAt < 2:687690/151‑1 (MQ=255) ggTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGtt > 2:184425/1‑149 (MQ=255) gTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATGAGGTTAGACCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCAAGCTCTgggt > 1:1129377/1‑146 (MQ=255) cAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGt > 2:150766/1‑151 (MQ=255) aaTAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTAAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGTTGGGAAAAATGAGTTTAGGCCCCTCCTTACTAGGT‑GCCACAACCCGACCTGGTTAt > 1:509227/1‑147 (MQ=255) aaaGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTg < 2:477751/151‑1 (MQ=255) gTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGGAAATATGAGTTTAGCCCCCCACTTACTCCAG‑GGAAAAGGACGCCCTGGGTATTGGCtt > 1:184486/1‑147 (MQ=255) gTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAACACGCTCTGGTTATCGTCTTgg > 2:503373/1‑149 (MQ=255) aTGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCCACCTACTCGAT‑GCCAAAGCCACCTCTGGTTTTTGTCtt > 2:587862/1‑145 (MQ=255) tgtgGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCCCTTGGTATCGTCTTGGAGAc > 2:249066/1‑150 (MQ=255) cGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGt < 1:800493/151‑1 (MQ=255) cGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGGAAATATGAGGTTAGCCCCCCACTTACTCGAT‑GCAAAAAAACGCCCTGGGTTTCGTCTTTGGGACGGGCAgg > 2:448900/1‑150 (MQ=255) tAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATg < 2:362468/149‑1 (MQ=255) tAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGa < 2:208920/150‑1 (MQ=255) aaaaGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGTTTAGCCCCCCACTTACTCGAT‑GCAAAAACACGCTCTGGGTATCGGCTTGGGGACGGACAGGGTTAt > 1:1094092/1‑147 (MQ=255) aaaaGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAAACTCAGTTTAGCCCCCCACCTATTTGGT‑GCAAAAGCACGCCCTGGTTATCGTCTTTGAGACGGAGCGGGTTATg > 1:39317/1‑148 (MQ=255) aaaGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGTTGGGAAAAATGAGTTTAGCCCCCTACTTAATCGAT‑GCAAAAACACGCCCTGGTTATCGTATTGGGGCAGGACAGGGTTTTGACg > 1:77617/1‑150 (MQ=255) aaaGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGGAAATATGGGGTTTGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGGACGCGCTGGGTATCGGCTTTGAGACGGAAAGGTTTAt > 1:1025711/1‑146 (MQ=255) ggCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTg < 1:950452/151‑1 (MQ=255) ggCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTg < 2:1019843/151‑1 (MQ=255) ggCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAACACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCt > 2:870722/1‑150 (MQ=255) ggCGCTTGCCGCCCAGGCCACTCCGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGGGGAAAATCTGAGTTTAGAACCCCACTTTCTCCAT‑GCAAAAGGACGCCCCGGTTATTGTCTTGGCGACGGTAAGGGTTCCGACGTAATcc > 1:119435/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATATGTTTAGCCCCCCACCTTCTCGGT‑GTAAAAGAACGCCCTGGTTTTCGGGTTGGGGACGGACAAGGGTATGACGTAAACCcgcg > 1:345822/1‑149 (MQ=255) gccgccCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGGAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCCCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGcgcg > 2:355514/1‑148 (MQ=255) ccgccCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATgg < 1:615995/151‑1 (MQ=255) cccAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCt < 2:689346/151‑1 (MQ=255) aGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGAt < 2:658028/151‑1 (MQ=255) aGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCCACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGGTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGAt > 2:828603/1‑151 (MQ=255) ggCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGAt < 1:46838/150‑1 (MQ=255) ggCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGAGGGGGGGATAGTAAACAAGTGGTTTGGCCCCCACTTAATCGATGGCAAAAAC‑CGCCCTGGTTTTTCTGTTGGAGCCGGACCGGTTTTTGAGGTGATCCTgctcttagggct > 1:963977/1‑137 (MQ=255) gCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAACACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGGTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCCGAtgt > 2:464896/1‑151 (MQ=255) ccATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGAtgtg < 2:898195/151‑1 (MQ=255) cATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGGTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGAtgt > 2:191407/1‑149 (MQ=255) aTTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTgcg < 2:821082/151‑1 (MQ=255) aTTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTgcg < 1:162184/151‑1 (MQ=255) tCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTgcgc < 2:426009/150‑1 (MQ=255) ggcaggTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCAcc < 1:379786/151‑1 (MQ=255) aggTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCAt < 2:97928/151‑1 (MQ=255) ggTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATg < 2:1020527/151‑1 (MQ=255) aGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTa < 1:381068/151‑1 (MQ=255) aGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGGTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATgggt > 2:1014264/1‑148 (MQ=255) agagCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCatat < 2:657576/151‑1 (MQ=255) cATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATgggg < 2:646109/151‑1 (MQ=255) tgtgGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGAt < 2:973026/150‑1 (MQ=255) gtgGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGAtt < 1:925432/150‑1 (MQ=255) ggggggTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGATTAccgcc > 1:1019686/1‑151 (MQ=255) gggggTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGATTAccgccg > 1:358460/1‑151 (MQ=255) ggggTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGATTAccgccg > 2:501399/1‑150 (MQ=255) ggggTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGa < 1:905563/151‑1 (MQ=255) gggTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGa > 2:742668/1‑150 (MQ=255) | GCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGAT‑GCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGA > NC_000913/2326304‑2326596 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |