| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,751,537 | 0 | A | C | 40.2% | 126.0 / 20.7 | 82 | V111G (GTT→GGT) | yiaT | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/14); new base C (0/33); total (35/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.07e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAACGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTC > NC_000913/3751388‑3751686 | gaACGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAAc > 1:509464/1‑151 (MQ=255) aaCGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAAcc > 2:1002822/1‑151 (MQ=255) aaCGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAAcc > 1:1261116/1‑151 (MQ=255) aCGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAAccc < 1:916050/151‑1 (MQ=255) cccAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAAccccc > 2:1098961/1‑150 (MQ=255) cccAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCg < 2:1099830/151‑1 (MQ=255) gtgtCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGt > 2:398282/1‑151 (MQ=255) tCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACt > 1:1245778/1‑151 (MQ=255) cAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACt > 1:448768/1‑150 (MQ=255) aGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTAt > 1:959696/1‑151 (MQ=255) aGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTAt > 1:710224/1‑151 (MQ=255) gCGACAGCCGCCCTATCTGCTTTTTGTGAAATACCGATACCCCCCCCCCCCAGCCTTT‑GCTGTTATCCAGAACGCCCGCAGCTGCAGAGGTTTT‑CCCGTTT‑CCCCACCG‑CTGGTGGTAATCCCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTAt < 2:559396/150‑1 (MQ=255) cGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATc > 1:1023431/1‑150 (MQ=255) gACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCAc > 1:873050/1‑151 (MQ=255) aCAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATCCCGATAGCTCCCCCCCCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGACCGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGTTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCAc < 1:914600/150‑1 (MQ=255) aGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCt > 2:871656/1‑151 (MQ=255) aGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCt > 2:584225/1‑151 (MQ=255) ccTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCa > 2:90553/1‑150 (MQ=255) ccTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCa > 1:921200/1‑150 (MQ=255) catATCTCCATTTGGTGAAATACCGATAGCCCCCCCCCCCGCCCGTT‑GCTTTTACCCAGAACGCCCGCAGCTGCAGAGCCTTC‑CACGTTC‑CCCCAACG‑CCGGGGTTGACACAAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATc < 2:962266/147‑1 (MQ=255) cTATCTGATTTTGGTGGAATCCCGATAGCCCCCCCCCCCAGCCTTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGCCTTT‑CACTGTC‑CCCCACCC‑CTCGGGTTGATACCGGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCa < 2:892743/140‑1 (MQ=255) tcggctttttGTGGAATCCCGATAGCCCCCCCCCCCACCCTTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCACCGGCAGAGGTTTT‑CCCGTTT‑CCCCACCG‑CTCGTGGTCATCCCGGCCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCt < 1:1065382/144‑1 (MQ=255) gCATTTTGTGAAATCCCGATAGCCCCCCCCCCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGAGGAGGCTTT‑CCCGGTC‑CCCCACCG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCt < 1:414235/147‑1 (MQ=255) ttttGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCAt > 1:944409/1‑151 (MQ=255) tttGTGGAATGCCGATACCCCCCCCCCCCAGCCGTT‑GCTGTAACCCAAATCCCCAGCAGTCGCGAAGTTTCC‑CCCGGTC‑CCCCACCG‑CCCGTGGGAACCCCGGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCAt < 2:722118/150‑1 (MQ=255) tttGTGGAATACCGATAGCCCCCCCCCCCACCCGTT‑GCTTTTACCCAGAACGCCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CCCGTTC‑CCCCAACC‑CTCGTGGTAATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTg < 2:477042/147‑1 (MQ=255) ttGTGGAATACGGATATCTCCCCCACCCAGCCTTG‑GCTGTTTTCCAGACCGTCCCCAGCTGCAGATGCTTC‑CCCGTTC‑CCCAAACC‑CTGGTGGTATTCCTAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGc < 2:1084594/147‑1 (MQ=255) aTACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATTGCATAATc > 2:638747/1‑151 (MQ=255) tACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCg > 2:824227/1‑151 (MQ=255) ccGATAGCCCCCCCCCCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CCCGGTC‑CCCCACCG‑CTCGGGGTGATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTc < 1:682666/151‑1 (MQ=255) gATAGCCCCCCCCCCCAGCCGTT‑GCTTTTACCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CCCGTGGGGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCAt < 1:1258555/151‑1 (MQ=255) tacccccccccccCAGCCGTT‑GTTGTTATCCAGAACGCCCGCAGCTGCAGAGGTTTT‑CACGTTC‑CCCCACCG‑CTCGTGGTGATCCCAGCCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCAt < 1:629184/144‑1 (MQ=255) cccccACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGt > 2:781722/1‑151 (MQ=255) ccccccCAAGCCGTG‑GCTGTTATCAAAACGGCCCGCAGCGGGAGAGCCTTC‑CACGGTC‑CCCCAACG‑CTCGGGGTAATCCCGGCCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTa < 2:954032/151‑1 (MQ=255) cgccccaGACGTTGGCTTTGATCCAGACCCGCCGCGGCTG‑AGAGGGCTT‑CATGGTTCCCCCAACT‑CGCGTGGTGGTACCAGGAACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAg < 2:852093/148‑1 (MQ=255) cacccaGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAggg > 1:389983/1‑151 (MQ=255) cccaGCCTTT‑GCTTTTACCCAAACCGCCCGCAGCGGCAGAGTCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGGGGTGATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAggg < 2:880438/149‑1 (MQ=255) cacccttt‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGCCTTT‑CCCGTTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTAATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCaa < 2:411740/145‑1 (MQ=255) caGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCa > 2:82929/1‑150 (MQ=255) tt‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTcc > 2:1864/1‑150 (MQ=255) tt‑GCTGTTATCCAGAACGCCCGCAGCTGAAGAGTCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGAACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTcc < 1:412115/150‑1 (MQ=255) gCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGc > 2:1150956/1‑151 (MQ=255) aTCCAGAGCGGCCGCAGCTCGGGAGCCTTT‑CACGGTT‑CCCCATCG‑CTCGTGTGGATCCCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCg < 2:412528/146‑1 (MQ=255) gAACGCCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CCCGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATCCCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAgg < 1:133253/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCGGAGGCTTT‑CCCGTTC‑CCCCGACG‑CCCTGGGTAAAACCAGACAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGt < 1:689221/151‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCAGAGGTTTT‑CCCGTTT‑CCCCAACG‑TTCGGGGTGTTCCCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATg < 1:858390/147‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGt > 1:1108314/1‑151 (MQ=255) ccGCAGCGCCAGGGCTTTT‑CCCGGTC‑CCCAACCG‑CTCGTGGTCAACCCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATg < 2:69716/147‑1 (MQ=255) gCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTc > 1:163786/1‑150 (MQ=255) gCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTc > 2:387063/1‑150 (MQ=255) gCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCACCG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAgg < 1:584242/150‑1 (MQ=255) tGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCt > 2:623491/1‑150 (MQ=255) gCAAAGTCTTG‑CAGGGTC‑CCCCAACG‑CCCGTGGCAACACAAGCAAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGt < 1:1142218/143‑1 (MQ=255) gagCTTTCCACGTTT‑CCCCAACG‑CGCGGGGTGATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAg < 2:285111/147‑1 (MQ=255) ttt‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAttt > 2:910610/1‑151 (MQ=255) tccactttt‑CCCCAACG‑GTCGTGTTGTACCCGGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAt < 1:6913/141‑1 (MQ=255) t‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTGGGGGTGATACCGGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAtttt < 2:1222746/150‑1 (MQ=255) ccgggTT‑CCCCAACG‑CCGGGGGGGATCCCGGGAACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAtt < 1:71832/144‑1 (MQ=255) cACGGTT‑CCCCACCG‑CTCGTGGTGATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAttttt < 1:678315/150‑1 (MQ=255) cACGGTC‑CCCCAACG‑CTCGGGTTGACCCCGGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGTATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAtttttt < 2:944362/151‑1 (MQ=255) cGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTc > 2:925064/1‑151 (MQ=255) ggTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTc > 1:210505/1‑150 (MQ=255) ggTC‑CCCCAACG‑CTCGGGGTGATCCCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAttttttt < 2:853582/149‑1 (MQ=255) gTT‑TCCCAACGCCTCGTGTTAACACCGGGCACCCACCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAttttttt < 2:630997/149‑1 (MQ=255) ttcccccACCC‑CTGGTGGTATTACCAGCCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAATCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAttttttt < 2:957912/145‑1 (MQ=255) t‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACtt > 1:39922/1‑151 (MQ=255) ccccAGCG‑CTCGTGGTAATCCCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTACCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACttt < 1:1153339/151‑1 (MQ=255) ccccAGCG‑CTCGTGGTAATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACtt < 2:1261050/150‑1 (MQ=255) ccccAACG‑CTCGTGGTGATCCCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACttt < 1:245869/151‑1 (MQ=255) ccccAACG‑CCGGGGGTGATACCTGCCCCCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCa < 2:818098/147‑1 (MQ=255) ctggtggtgATACCCGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACa < 2:988896/146‑1 (MQ=255) cTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGAc > 2:173866/1‑148 (MQ=255) gtggtgACACCAGCCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATa < 2:1241946/151‑1 (MQ=255) gtggtaATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAg < 1:470300/147‑1 (MQ=255) gtggtaATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGa < 1:999936/148‑1 (MQ=255) ttgtgATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATa < 2:321099/148‑1 (MQ=255) tggggATACCAGCCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATa < 2:91466/150‑1 (MQ=255) ggtgATCCCAGCCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGaa < 2:921154/147‑1 (MQ=255) gATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAAc < 1:1128792/150‑1 (MQ=255) gATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAAcc > 1:650953/1‑151 (MQ=255) cAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACg > 1:1016568/1‑151 (MQ=255) aGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACAATTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGAAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACg > 2:1219143/1‑150 (MQ=255) aaCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTc > 1:336555/1‑151 (MQ=255) | GAACGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTT‑GCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTT‑CACGGTT‑CCCCAACG‑CTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTC > NC_000913/3751388‑3751686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |