| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/45); new base A (32/0); total (38/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.86e-17 | |||||||||||
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GTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCA‑T‑TAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAG‑A‑TTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAA > NC_000913/2903542‑2903839 | gTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAc < 2:47919/151‑1 (MQ=255)gTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAc < 2:331690/151‑1 (MQ=255) tttACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAACa > 2:1443902/1‑150 (MQ=255) 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aaaCCACTCA‑T‑TAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAG‑A‑TTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTaa < 1:232596/151‑1 (MQ=255) aaaCCACTCA‑T‑TAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAG‑A‑TTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTaa < 1:393487/151‑1 (MQ=255) | GTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCA‑T‑TAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAG‑A‑TTTATTACTTAACC‑AATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAA > NC_000913/2903542‑2903839 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |