| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,751,537 | 0 | A | C | 42.0% | 137.7 / 13.1 | 81 | V111G (GTT→GGT) | yiaT | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/10); new base C (0/34); total (37/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.82e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAACGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTC > NC_000913/3751388‑3751686 | gaACGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATGCCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAAc < 2:601970/151‑1 (MQ=255)gaACGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAAc < 1:920725/151‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAAcccc > 1:219598/1‑151 (MQ=255) cAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGc > 1:259487/1‑151 (MQ=255) aGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGcc > 2:1039904/1‑151 (MQ=255) ggTGTCAGCGACAGACGCCCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCCCCCCCCCCCAGCCGTTG‑CTGTTACCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCg < 1:735521/151‑1 (MQ=255) ggTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGCCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGcc > 2:858700/1‑150 (MQ=255) gtCAGCGACAGACGACCTATCTCCATTTTGTGGAATCCCGATACCTCCCCCACCCAGCCTTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGGGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATCCCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTa < 1:1150991/150‑1 (MQ=255) aCAGACGCCCTATCTGCTTTTTGTGGAATACCGATAGCCCCCCCCCCCAGCCTTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGGGGCTTTCACGTTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACg < 1:1151406/151‑1 (MQ=255) aCAGACGCCCTATCTGCTTTTTGTGAAATCCCGATACCCCCCCCCCCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGACCGTCCGCAGCGGCAGAGGCTTCCACGGTC‑CCCCACCGCTCGTGGTGATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTa < 2:263431/146‑1 (MQ=255) aCAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACg > 2:625193/1‑151 (MQ=255) cAGACGCCCTATCTGCATTTTGTGAAATCCCAATAGCCCCCCCCCCCAGCCGTTG‑CTGTTACCCAAAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTC‑CCCCAACGCTCGGGGGGATCCCAGGAACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACg < 1:714139/150‑1 (MQ=255) cAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATAGAGCTAACTCCCCCAACCAGCCGGTG‑CTGGTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGCT‑GCCAAACGCTCGTAGTGATACAAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTTTCACGc > 1:1231185/1‑151 (MQ=255) aGACGCCCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCCCCCAGCCGTTG‑CTGTTACCCAGAACGCCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCAc < 1:384257/148‑1 (MQ=255) aGACGACCTATCTGCTTTTTGTGGAATCCCGATAGCCCCCCCCCCCAGCCGTTG‑CTGTTACCCAGACCGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGTTC‑CCCCAACGCTCGGGGTGATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACg < 1:83602/149‑1 (MQ=255) gacgacCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCtt > 2:206437/1‑151 (MQ=255) cgacCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTAt > 1:410242/1‑151 (MQ=255) cgacCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAACCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTAt > 1:1326079/1‑151 (MQ=255) ccTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCa > 1:300441/1‑150 (MQ=255) ccTACCTCCATTTTGGGGAAGACCGATGCCCCCCCCCCCCAGACGTGG‑CTGTTATCCAAACGGCCCGCGCCTCCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCATCTCTGGGGGTGATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTAt < 1:1320011/148‑1 (MQ=255) tCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTg > 2:983745/1‑151 (MQ=255) gctttttGGGGAATACCGATAGCTCCCCCCCCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATCCCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGt < 1:331058/146‑1 (MQ=255) gattttgGTGGAATCCCGATGGCCCCCCCCCCCAGCCGTTG‑CTTTTACCCAAACCGCCCCCGGCTGAAGAGG‑TTTCCCGGTTCCCCCACCGCTCGTGGTGACCCCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGtt < 2:996964/147‑1 (MQ=255) cATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGc > 2:1142250/1‑151 (MQ=255) ttttGTGGAATCCCGATACCCCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTTCCCAGACCGTCCGCAGCGGCAGAGGCTTTCACGGTC‑CCCCAACGCTCGTGGTGATCCCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCt < 1:970541/144‑1 (MQ=255) tttGTGGAATACCGAGACCTCCCCCCCCCAGCCGTTG‑CTTTTATCCAGAACTCCCGCAGCTGCAAAGGCTTCCACGGTC‑CCCCACCGCCCGTGGTGACCCCGGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCAt < 1:786876/150‑1 (MQ=255) gattacggatgcccccccccccCACCCGTTG‑CTGTTATCAAGACCTTCCGCAGCGGCAGGGGTTTTCCCGGTC‑CCCCACCCCTGGTGGTAATCCCGGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCAt < 1:799156/135‑1 (MQ=255) aaTACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAAt > 2:1024566/1‑151 (MQ=255) aTACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATc > 2:1250633/1‑151 (MQ=255) aCCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGt > 1:1017635/1‑151 (MQ=255) ccGATAGCCCCCCCCCCCAGCCGTTG‑CTGTTACCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTC‑CCCCAACGCTCGTGGTGATCCCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGt < 1:625208/150‑1 (MQ=255) cGATAGCTCCCCCCCCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCa < 1:90832/151‑1 (MQ=255) gATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCAt > 1:328258/1‑151 (MQ=255) gATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCAt > 1:342028/1‑151 (MQ=255) cgacaccccccccccccACCGTTGCCTGTAACCCAGACCGCCGGCAGTTGAAGAGCCTTTCACGTTC‑CCCCAACACTGGGGGTAATCCCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTc < 1:375506/143‑1 (MQ=255) aTAGCCCCCCCCCCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGACCGCCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCAtt < 2:1375580/151‑1 (MQ=255) cccccccACCCAGCCTTTG‑CTGTTACCCAGAACGTCCGCAGGTGCAGAGGCTTCCCCGGTT‑CCCCACCGCCGGCGGTGATACCAGCCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATc < 1:812974/148‑1 (MQ=255) cTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCg > 1:648724/1‑151 (MQ=255) ccccccccCAGCCGTGG‑CTTTTACCCAGACCGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCCCGTTC‑CCCCACCGCTCGTGGTAATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATc < 2:1015039/148‑1 (MQ=255) cccacccaGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGt > 2:838886/1‑149 (MQ=255) ccacccaGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAgg > 1:80055/1‑151 (MQ=255) ccaGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTc > 2:469221/1‑150 (MQ=255) caGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCa > 2:792049/1‑150 (MQ=255) 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cAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATcc > 1:1362071/1‑149 (MQ=255) aGACCGTCCGCAGCGGCGGGGGCTTCCCCGGTC‑CCCCACCGCTCGGGGTGATACCAGCCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATc < 2:970759/147‑1 (MQ=255) aaCGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAgg > 2:1342534/1‑149 (MQ=255) gTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATAGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCg > 1:1092426/1‑151 (MQ=255) ccGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCgg > 1:117144/1‑150 (MQ=255) aGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAgg > 2:901718/1‑151 (MQ=255) aGCTGCAGAGCCTTTCACGTTC‑CCCCACCGCTCGTGGTGATCCCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAg < 1:376614/150‑1 (MQ=255) cTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCt > 2:271569/1‑151 (MQ=255) agagGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGt > 2:1347429/1‑151 (MQ=255) gagGCTTTCACGGTT‑CCCAAACGCTCTTGGTGATCCCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTa < 1:1178004/147‑1 (MQ=255) gcctcccccGGTT‑CCCCAACGCTCGGGGGATTGCCAGGACCCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTc < 2:993504/142‑1 (MQ=255) tttCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAttt > 1:12130/1‑151 (MQ=255) tttCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAttt > 1:1316281/1‑151 (MQ=255) ttCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAtttt > 1:1092586/1‑151 (MQ=255) cccGGTC‑CCCCAACGCTCGTGGTAATCCCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAtttt < 2:198165/147‑1 (MQ=255) 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gttgATACCGGGAACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAAt < 2:1272652/146‑1 (MQ=255) ggtgATCCCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATa < 2:1277425/149‑1 (MQ=255) ggtgATACCGGACACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATaaa < 1:910757/151‑1 (MQ=255) ggtgATACCAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCATCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATaaa < 1:1213353/151‑1 (MQ=255) aTACCGGGAACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAAc < 2:434347/149‑1 (MQ=255) tACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCt > 2:248948/1‑150 (MQ=255) ccgggCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCt < 2:1100612/145‑1 (MQ=255) ccAGGCACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTaa < 2:670395/150‑1 (MQ=255) aaCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTc > 2:122194/1‑151 (MQ=255) | GAACGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTG‑CTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTT‑CCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTC > NC_000913/3751388‑3751686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |