| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,376,505 | 0 | A | C | 46.8% | 116.2 / 14.8 | 79 | T158P (ACC→CCC) | ycjR | putative TIM alpha/beta barrel enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/8); new base C (0/37); total (34/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGG > NC_000913/1376358‑1376655 | ttACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAa‑ca < 1:820585/148‑1 (MQ=255)ttACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CAccc > 2:1248837/1‑151 (MQ=255) aCCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCt < 1:1097878/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTc > 2:714018/1‑151 (MQ=255) gccgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGcc > 2:144757/1‑151 (MQ=255) cgATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGa < 2:1162430/151‑1 (MQ=255) gATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGAt < 2:53826/151‑1 (MQ=255) aTGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATg < 2:12449/151‑1 (MQ=255) gACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGcc > 2:1288667/1‑151 (MQ=255) cgccgcGTAGGCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCccgc < 1:666674/149‑1 (MQ=255) cgccgcGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCccgc < 1:1283639/149‑1 (MQ=255) gccgcGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGt > 1:1084171/1‑151 (MQ=255) ccTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACAtcgtc > 2:118780/1‑151 (MQ=255) ggccGGCGACCACAAAATGGGGAGTGTTTCCCGG‑CGCGTGCTGAAAGGGGTCGCCGCGCGTCGGGGACCG‑GGGG‑TGTATCCCGACCCTTTAAC‑CCTT‑TATCAGAATAATATGATCAA‑CCCCCGCGCCGATGCCCGCCGTTACAt < 1:52836/141‑1 (MQ=255) ggACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGa > 1:636302/1‑150 (MQ=255) gACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCAGTTACATCGTCGaaa < 2:1142693/151‑1 (MQ=255) aCGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGaaa > 1:714955/1‑150 (MQ=255) ggCGACCGAAAAGTGGGGGGTGATTCCCTG‑CGCGTCCGGAAACAGGTCGCCGCGCGTCCGGGAACT‑GGGT‑TGTACCTCGACCCTTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGACAAA‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGaaa < 2:1132804/148‑1 (MQ=255) cccGAAAAATGGTGGGT‑ATTCCCCGCCGTGAATTGGAACAGGTCGCTGCGGGTCCGGAAACC‑GGGG‑GTTATCTGCAACCATAAAC‑CCAC‑TAACGGTATAATATTATAAC‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCt < 2:92386/150‑1 (MQ=255) aCCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCt > 2:426800/1‑151 (MQ=255) ccGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCtt > 1:1091838/1‑151 (MQ=255) ccGAAAAAGGGGGAGTGATCCCCGG‑CTCGTCCGGAAAGGGGTCGCCGGGCGAACCGGAACG‑GTGT‑TTTATCCCGACCCGTAAAC‑CCGC‑TAAAAGGATAAAATAATAAC‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCtt < 1:44846/151‑1 (MQ=255) gCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTa > 1:920353/1‑150 (MQ=255) aaaaTGGTGGGTGATTCCCGG‑CGCGTACGGGAACGGGGCGCCGCGGGTCCCGAACCG‑GTGG‑TGTATCTCGACCCTTTAAC‑CCGC‑TATAAGGATCATATAATCAC‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAAc < 2:823925/151‑1 (MQ=255) aaaaGGGTGAGTCATCCCCCG‑GGCGTCCGGGAACAGGCCCCCGCCCGTCCCGAAACG‑GTGT‑TTTCTCTCCACCCTTTAAC‑CCCC‑TATAAGAATCATATATACAA‑CCCCCCCCCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAAc < 2:1189007/151‑1 (MQ=255) aaaTGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAAc > 1:272851/1‑150 (MQ=255) ggttgattgctcccgtG‑CGCTTACTGAAACGGGCCACCCCGCG‑CCCGGAACCGGGGG‑TGTATCGCTAGCGTTTAAC‑CCGT‑TGTAGGGATCATAGAATAAC‑CCCCCGCGCAGTTCGCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATg < 1:140119/135‑1 (MQ=255) ggTGAGTGATCCCCTC‑GGCTTATGGGAAAGGGTGGCGGCGCGACCGGGACCC‑GTGG‑TGTTTCCCGAACCTTAACC‑CCGC‑AATCAGGATAATATGAACAC‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACa < 1:440073/147‑1 (MQ=255) gtgagtgaTTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTAc > 1:351736/1‑151 (MQ=255) tgagtgaTTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACAt > 1:526580/1‑146 (MQ=255) gtgttccccTG‑CGCGTCCGGAAACAGGCCCCCGCGCGTACCGAACCT‑GTGG‑TTTATCTC‑AACCCTTAAACCCGA‑TATAAGAATAATAAGACCAC‑CCCCCCCGCCGATCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGt < 1:1195670/139‑1 (MQ=255) tgaTTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGAtt > 2:214873/1‑151 (MQ=255) tatccccTG‑CGCTTACGGAAACGGGCCGCGGCGCGACCCGGACCT‑GTGG‑TGTTTC‑CCAACCCTTAAACCCTT‑TACCAGAATCATATACCCAC‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACa < 1:50785/142‑1 (MQ=255) gttccccTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACGGGAACC‑GTGG‑TGTTTCCCAACCCGTAAAC‑CCTC‑TATAAGAATCATATGAACAC‑CCCCCCCGCCGAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTAc < 2:1229005/141‑1 (MQ=255) gaTTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAAc > 2:293830/1‑139 (MQ=255) catccccTG‑CGCGTCGTGGACCAGGTCCCCGCGCGTCCCGGACCG‑GTGT‑TTTATCCCAAACCGTAAAC‑CCGC‑GTTAAGGATCATTTAACAAC‑CCCCCCCGCCGTGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTa < 2:776050/147‑1 (MQ=255) ttccttc‑cGCTTACTGGACCAGGTCGCGGCGCTTCCCGAACCC‑TTGT‑TGTACCTCGACCCGTTAAC‑CCGT‑TTCCATTAAAATATCTTAAC‑CCCCCGCGCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAg < 2:1064861/145‑1 (MQ=255) ttCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATc > 2:116444/1‑151 (MQ=255) cccTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCgg > 1:1065982/1‑151 (MQ=255) cccTG‑CGCGTACGGAAACGGGTCGCCGCGCGTACCGGACCG‑GTGG‑TGTATCTC‑AACCCTTAAACCCGC‑TATCAGAATAATATGACCAA‑CCCCCGCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTa < 2:317432/147‑1 (MQ=255) cccTG‑CGCGTACGGAAACAGGTCCCCGCGCGT‑CCGGAACCGGTGG‑TTTACCCCGACCCTTAAAC‑CCGT‑TAGCAGGATAATATAACAAA‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTAt < 2:558314/148‑1 (MQ=255) cccGG‑CGCGTCCGGGAACGGGTCCCCGCGGTTACCGGAACG‑GTGT‑TTTATC‑CCAACCCTTAAACCCCC‑TATCAGAATAATATGACCAC‑CCCCCCCGCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGAt < 1:1024480/145‑1 (MQ=255) cccggcttttacgtgAACGGGTCCCCCCGCGTACCGAAACC‑GTGG‑TGTATCACCATCGGTAAAA‑CCAT‑AAAAAGTATCATATGTTCAA‑CCCCCCCGCCCATACCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATc < 2:579586/135‑1 (MQ=255) cgcttatgggaaggggTCGCCGCGGGTCCCGGACGG‑GGGT‑TGTATCTCAACCCGTAAAC‑CCCT‑TATGAGGATCATA‑GAACAACCACCCTCACCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGAt < 1:407418/136‑1 (MQ=255) gcgTACTGGAAGAGGTCGCCGCGCGTACC‑GAACC‑GGGGTTGTATCTCAAACCGTAAAC‑CCGT‑TATCAGGATCATATGATCAC‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGa < 2:280204/148‑1 (MQ=255) gcgTACGGAAAGAGGTCGCCGCGCGTCCCGACCCG‑GTGG‑TGTATCTCAACCTTTTAAC‑CCTC‑TATCAGGATCATATAATAAA‑CCCCCCCGCCGATCCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGAtt < 1:377038/150‑1 (MQ=255) ggAACGGGTCCCCGCGCCTCCCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCTTTAAA‑CCGC‑TATCAGGAACATATAAAAAA‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTAt < 2:979216/148‑1 (MQ=255) gAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATcac > 2:871284/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACAt > 1:1004869/1‑151 (MQ=255) acggttCGCCGCGCGTCCGGGAACC‑GTGG‑TTTATCTCAACCCTTTAAC‑CCGC‑TATCAGGATCATATAACCAC‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATg < 2:1123040/146‑1 (MQ=255) accggTCCCCGCGCCCCCCGGACCC‑GTGG‑TATACCGCGACCTGTAAAA‑CCGG‑TATCAGTATATTATTACAAC‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTAt < 2:1011094/142‑1 (MQ=255) cAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATg > 2:988302/1‑150 (MQ=255) ggcccccgcGCG‑ACCGGAACCGGTGT‑TGTATC‑CCAACCCTTAAACCCCC‑TATAAGAATAAAATAACCAC‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGaa < 1:377217/145‑1 (MQ=255) ggTCCCCGCGGGTCCCGAACCC‑GGGG‑TTTATCCCGACCCGTAAAA‑CGGC‑TATAAGAATAATATGATCAC‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATca < 2:1062077/144‑1 (MQ=255) ccccgcGCGTCCCGAACCC‑GTGG‑TTTACCCCGACCCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATAATCAC‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAat < 2:125085/146‑1 (MQ=255) cgcgtgTCCCGAAACG‑GAGG‑TGTTTCTCAACCCGTAAAC‑CCGT‑TTTCAGGAATATATAACCAA‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAata < 2:1272660/146‑1 (MQ=255) ccgcgctcccGGGACCGGTGG‑TGTATCCCGACCCGTAAAC‑CCGC‑TATAAGAATAATATAACCAC‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAatat < 1:636625/140‑1 (MQ=255) cgcgTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCga > 2:276672/1‑148 (MQ=255) gcgTACCGGACCC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCTTTAAC‑CCGC‑TATCAGGATCATATGAACAA‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAatat < 2:946945/144‑1 (MQ=255) tACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaaga > 2:1125137/1‑147 (MQ=255) gtccgggaccggggg‑tgTATCTCAACCCGTAAAC‑CCGC‑TATCAGGATAATATGACCAA‑CCCCCCCGCGGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaagaa < 1:1187822/136‑1 (MQ=255) cccGGACCC‑GGGG‑TGTATCGCGACCCTTAAAC‑CCGC‑TATCAGGATCATATGACCAA‑CCCCCTCGCCGTTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATa < 2:110383/150‑1 (MQ=255) cggtaccggtgt‑tgTATCCCGACCCGTTAAC‑CCGC‑TACCAGGATAATATGAGCAC‑CCCCCGCCCGGGTGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCgaa < 1:1048512/135‑1 (MQ=255) ccc‑GTGT‑TTTTTCTCGAACCGTTAAC‑CCTA‑AATCAGAATAATAATACCAA‑CCCCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTgg < 2:250485/150‑1 (MQ=255) cc‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgc > 2:252232/1‑151 (MQ=255) gtgt‑tgTATC‑CCAACCCTTAAA‑CCCCTTATCAGTATCATATAATCAC‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgcg < 2:1188345/150‑1 (MQ=255) tgg‑tgTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCCCATGAATATCGAAGAAGATAACCTGgcg > 2:759632/1‑149 (MQ=255) gggttATCTCAACCCTTTAAC‑CCGC‑TACCGGGTTCAAATGAACAC‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTgg < 2:203256/142‑1 (MQ=255) tATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGgcgc > 2:413379/1‑151 (MQ=255) aTCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCt > 1:1088636/1‑151 (MQ=255) aTCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCt > 1:54385/1‑151 (MQ=255) ctcGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGc > 1:1017584/1‑151 (MQ=255) cccGACCCGTAAAC‑CCGT‑TATCAGAATCATAGGACCAC‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTg < 1:1265384/148‑1 (MQ=255) ccGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGAc > 1:361262/1‑150 (MQ=255) ttAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAAcc > 1:81254/1‑151 (MQ=255) aaa‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACcgc > 2:352349/1‑151 (MQ=255) gC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCt > 1:1166059/1‑151 (MQ=255) cgttatcgagcacATATAATCAC‑CCCCCTCGCAAAGGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGAcc < 2:651958/139‑1 (MQ=255) gcaaacAGGATAATATGACAAC‑CCCCCCCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCt < 2:228680/146‑1 (MQ=255) tGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCCTGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGc > 2:744288/1‑150 (MQ=255) cacCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGCg > 1:59365/1‑151 (MQ=255) acCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGCgg > 1:1170722/1‑151 (MQ=255) | TTACCGCCGATGACCTCGCCGCGTAGCCTGGACGGCGACCGCAAAATGGTGAGTGATTCCCTG‑CGCGTACTGGAACAGGTCGCCGCGCGTACCGGAACC‑GTGG‑TGTATCTCGAACCGTTAAA‑CCGC‑TATCAGGATCATATGATCAA‑CACCCTCGCCGATGCCCGCCGTTACATCGTCGAAAACGATCTTAAACATGTACAGATTATCGGCGATTTCTATCACATGAATATCGAAGAAGATAACCTGGCGCAGGCGCTGCATGACAACCGCGACCTGCTCGGTCATGTGCATATTGCGG > NC_000913/1376358‑1376655 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |