Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,236,901 | 0 | T | C | 39.2% | 100.3 / 16.6 | 74 | T285A (ACG→GCG) | mglC | methyl‑galactoside transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/15); new base C (0/29); total (30/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.98e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGCGCGTATTTCAGTGAATCCAGCGCTACGGCGAAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGAACACGCCAGACAA > NC_000913/2236753‑2237045 | cgcgcgTATTTCAGTGAATCCAGCGCTACGGCGAAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTcc < 1:287704/151‑1 (MQ=255) cAGTGAATCCAGCGCTACGGCGAAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACAccgccg > 2:845008/1‑151 (MQ=255) cAGTGAATCCAGCGCTACGGCGAAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACAccgcc < 2:148056/150‑1 (MQ=255) tGAATCCAGCGCTACGGCGAAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTg > 2:698217/1‑151 (MQ=255) aTCCAGCGCTACGGCGAAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAAc > 1:783443/1‑151 (MQ=255) ccAGCGCTACGGCGAAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACg > 1:860666/1‑150 (MQ=255) aGCGCTACGGCGAAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGAt > 2:38316/1‑150 (MQ=255) gcgtTACGGCGAAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATTTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGAt < 1:435165/149‑1 (MQ=255) cGAAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTAc > 1:328545/1‑151 (MQ=255) aaGATAATACTCGCCCCTTTGATGTGGTACTGCCAGTATGGTTTTACGCCAATATACGTCAGCCCATAGTTGATGAGGGT‑AAAAATAATTCCCCCGTCCCCCCCCCCAACCCCCGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTAc < 2:624493/149‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTAcc > 1:915999/1‑150 (MQ=255) gATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACcacg > 2:43299/1‑151 (MQ=255) ataataATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACcacgc > 2:1091609/1‑151 (MQ=255) taataaTCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACcacgc > 2:81139/1‑150 (MQ=255) aatCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTCCCCCGGTCACCACGCCAATCCCCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCAcgcc < 2:1021741/151‑1 (MQ=255) atCGCCCCTTTAAGGATGTCCGCCCAATTTGGGTTTCCCCCGATATCCGCCAGGCCATAGTTGAGGCCGGA‑AAAAATAATCCCCCCGGTCCCCCCCCCAACCACCGTCCCCACCCCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCAcgccg < 1:844975/151‑1 (MQ=255) tttGATAATGTACTGCCAGTATGGTTTTCCGCCAATATACGTCAGGCCATATTTGATGACGGT‑AAAAAAATTTCCCCCGGCCCCCACGCCAACCACCGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGc < 1:183905/150‑1 (MQ=255) tgatgaTGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCTTATTTGATGACGGT‑AAAAATAATTCCCCCGGCCCCCACGCCAACCCCCGTCCCCACCCCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGc < 2:386745/148‑1 (MQ=255) gatgatGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATcc > 2:984914/1‑151 (MQ=255) atgatgTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATcc > 2:124729/1‑150 (MQ=255) taagttccTGCAAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCGGGCCATATTTGATGACGGT‑AAAAAAAATTCCCCCGGCCCCCACCCCAATCCCCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCa < 1:816749/143‑1 (MQ=255) atgTACTGCCATTATGGTTTTACGCCAATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCa < 2:1191692/148‑1 (MQ=255) tgTACTGCCAGTAGGGTTTTACGCCGATATACGTCGGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTCCCCCGGTCCCCACGCCAATCACCGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCa < 1:1055829/147‑1 (MQ=255) gTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTc > 1:1049190/1‑150 (MQ=255) tACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTcat > 2:1143972/1‑151 (MQ=255) tGCCAGTAGGGGTTTACGCCGATATCCGTCAGGCCATAGTTGATGACTGT‑AAAAAAAATTCCCCCGCCCCCCCCGCCAATCCCCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGc < 2:744016/144‑1 (MQ=255) ccAGTATGGTTTTACGCCGATATCCGCCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTCCCCCGGTCCCCACCCCAATCCCCGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTcatacata < 1:552990/151‑1 (MQ=255) ccAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTcatacat > 2:916524/1‑150 (MQ=255) cAGTATGGGTTTCGGCCGATATACGTCAGGCAATGGTGGTTGCCGGA‑AAAAATAATCCCCCCGGTCACCGCGCCAATCACCGCCCCCCCACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTcatacata < 2:1022175/150‑1 (MQ=255) aGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATaa > 1:214567/1‑150 (MQ=255) tATGGGTTTCCGCCATTATACGTCAGGCCTTATTTGAGGACGTT‑AAAAATAATTACCCCGTTCCCCCCGCCAACCACCGCCCCCCCACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATaaa < 1:439229/149‑1 (MQ=255) gggTTTCCGCCAAAATACGCCGGCCCATACTTGAGGACGGT‑AAAAAAAATTCCCCCGGCCCCCACGCCAATCACCGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAg < 2:92855/147‑1 (MQ=255) gggTTTACGCCAATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTCCCCCGGTCACCACGCCAACCCCCGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCg < 1:584397/150‑1 (MQ=255) ggTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGcc > 1:272525/1‑148 (MQ=255) ggTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCg > 2:76438/1‑149 (MQ=255) tttACGCCGATATACGTAAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTCCCCCGGTCCCCACCCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAgg < 2:1122280/150‑1 (MQ=255) cGCCGATATACGTCGGGCCATAGTGGATGACGGT‑AAAAAAAATTCCCCCGCTCCCCCCGCCAACCCCCGTCCCCCCCCCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGgttg < 1:191250/149‑1 (MQ=255) cGATCTACGTGAGCCCATAGTGGAAAGCGTA‑AAAAATAATCCCCCCGGCCACAACGCCAACCCCCCCCCCCACCCCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGgttgt < 1:1074782/147‑1 (MQ=255) cGATATCCGTCGGCCCATAGTTATTACCGGA‑AAAAATATTTCCCCCGGTCCCCACCCCAACCCCCGCCCCCCCACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGttgttg < 2:865024/149‑1 (MQ=255) gATATACGCCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCACGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTtggt > 1:703982/1‑150 (MQ=255) tatcCGTCAGCCAATATTTGA‑GAGGGTAAAAAAAAATTCCCCCGGCCCCCACCCCAATCCCCGCCCCCCCACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTtggtgg < 1:750332/150‑1 (MQ=255) aCGTCAGTCAATAGTTAATACCAGT‑AAAAAAAATTCCCCCGCTGACCCCGCAAGTCCCCCCCCCCACCCCGCCCCTGAACGATACCCCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCag < 1:19127/150‑1 (MQ=255) cGTAAGGCCATAGTTGATGCCGGT‑AAAAAAAATTCCCCCGGCCCCCCCGCCAATCCCCGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCaga < 1:197744/150‑1 (MQ=255) gTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGc > 1:795148/1‑151 (MQ=255) ggCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGa > 1:919595/1‑150 (MQ=255) gcccATAGTTGATGACGGA‑AAAAATAATTACCCCGGTCCCCCCGCCAACCCCCGCCCCCACCCCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGc < 1:321448/145‑1 (MQ=255) caaTAGTTAATGACGGT‑AAAAATAATTACCCGGATCCCCACGCAAATCCCGGCCCCCCCACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATAc < 2:382850/149‑1 (MQ=255) aTAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGt > 1:929159/1‑151 (MQ=255) tAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACATCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTc > 1:548661/1‑151 (MQ=255) ttGATGACGGT‑AAAAATAATTCCCCCGGTCCCCACGCCAACCCCCGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCg < 2:718363/150‑1 (MQ=255) ataccGGT‑AAAAATAATTCCCCGGGCCCCCCCGCCAACCACGGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGc < 1:398415/145‑1 (MQ=255) gaCGGT‑AAAAAAAATTCCCCCGGTCCCCACGCCATTCCCCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCt < 2:660525/148‑1 (MQ=255) aCGGT‑AAAAATAATTCCCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCt < 2:516520/150‑1 (MQ=255) gat‑AAAAATAATTCCCCCGCCCCCCCCGCCAACCCCCGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTaa < 1:676764/148‑1 (MQ=255) aaaaaTAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATc > 1:1134737/1‑151 (MQ=255) aaaaTATTTCCCCCGGCCCCCACGCCAACCCCCGTCCCAACCCCGCCGCTGAACGATGCACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAAc < 2:12931/147‑1 (MQ=255) aaaaTAATTACCCCGTTCCCCACGCCAATCCCCGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATcc < 1:266952/151‑1 (MQ=255) aaaTAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATccc > 2:805864/1‑151 (MQ=255) aataatTCCCCCGGTCCCCCCCCCAATCACCGCCCCCCCACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCg < 2:648547/151‑1 (MQ=255) aatTCCCCCGCCCACCACGCCAACCACCGTCCCCACCCCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGcc < 2:562419/150‑1 (MQ=255) aCCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAgg > 2:378392/1‑151 (MQ=255) cggcccccacGCCAACCCCCGCCCCCACCCCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATa < 1:200638/145‑1 (MQ=255) ccccccGCCAACCACCGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGa < 2:987029/144‑1 (MQ=255) ccccacCCCAACCCCCTCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGAac < 2:685513/149‑1 (MQ=255) caccacGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGAac > 1:372466/1‑151 (MQ=255) ccacGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGAacac > 2:217998/1‑151 (MQ=255) ccacGCCAACCCCCCCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTGCCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGTCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGAacac < 1:300733/151‑1 (MQ=255) cacCCCAATCCCCTCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGAacac < 1:43294/150‑1 (MQ=255) cccaactccccGCCCCCCCGCCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGAACACGcc < 2:701662/142‑1 (MQ=255) cGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGAACACGcc > 1:293630/1‑151 (MQ=255) ccactcccccGCCCCCGCACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCTCCCACGTCGCGATGGCATCCAGCTCATACATACAGCCGCGTTTGTTGGTGTCAGCGCCGCTTCGTCCTGCTTCTAACTTCCCGCCAAAGTCATAGAACACg < 1:353968/140‑1 (MQ=255) aacccccGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGAACACGCCa < 1:886026/143‑1 (MQ=255) aaTCCCCGCCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGAACACGCCa < 1:867134/148‑1 (MQ=255) cACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGAACACGCCAGACaa > 1:960746/1‑150 (MQ=255) | CGCGCGTATTTCAGTGAATCCAGCGCTACGGCGAAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAGGCCATAGTTGATGACGGT‑AAAAATAATTACCCCGGTCACCACGCCAATCACCGTCCCCACACCGCCGCTGAACGATACACCGCCTACCACGCACGCCGCGATAGCATCCAGCTCATACATAAAGCCGAGGTTGTTGGTGGCAGAGCCGATACGTCCGGCTTCTAACATCCCGCCAAAGGCATAGAACACGCCAGACAA > NC_000913/2236753‑2237045 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |