| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,198,201 | C→T | E13K (GAA→AAA) | ymfE ← | e14 prophage; putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,198,201 | 0 | C | T | 94.7% | 253.0 / 4.4 | 75 | E13K (GAA→AAA) | ymfE | e14 prophage; putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/3); new base T (38/33); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
CCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTCAGGCTGACCTAG > NC_000913/1198054‑1198343 | cccAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTAtt < 1:960993/151‑1 (MQ=255)cccAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCAtt < 1:1166339/151‑1 (MQ=255) ccAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTttatta < 1:1184574/151‑1 (MQ=255) aaTTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATtata < 2:615006/151‑1 (MQ=255) aTTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATtata > 2:728734/1‑150 (MQ=255) aataaAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAAttt > 2:578789/1‑151 (MQ=255) aataaAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAAtt < 1:889358/150‑1 (MQ=255) ataaAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAAtttt < 1:221416/151‑1 (MQ=255) aaaGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑g > 1:736516/1‑151 (MQ=255) aGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑ggg < 2:789437/151‑1 (MQ=255) gCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑gggg < 2:858800/151‑1 (MQ=255) tctcATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑gggggg > 2:837367/1‑151 (MQ=255) cATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCATTATAATTTTT‑GGGGGGt < 1:359209/149‑1 (MQ=255) tttAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACat > 1:533543/1‑150 (MQ=255) tAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACatat < 1:816902/150‑1 (MQ=255) aaTAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACAtatta < 2:51761/151‑1 (MQ=255) aaTAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACAtatt > 1:712560/1‑150 (MQ=255) aGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTc > 2:190687/1‑151 (MQ=255) gggACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCt > 2:684464/1‑151 (MQ=255) gggACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCt > 1:69498/1‑151 (MQ=255) cATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGt > 1:914686/1‑151 (MQ=255) tACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTc > 2:852691/1‑150 (MQ=255) aCTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCa < 2:391627/150‑1 (MQ=255) cTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACg > 2:1096096/1‑151 (MQ=255) gTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAgt < 1:561022/150‑1 (MQ=255) tattaAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAgtgt < 1:303911/150‑1 (MQ=255) taAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAAt < 1:847931/150‑1 (MQ=255) aaaGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATgg > 2:176836/1‑151 (MQ=255) aaaGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATCATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATgg > 1:582433/1‑151 (MQ=255) gTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATAttt < 2:506088/151‑1 (MQ=255) gTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATAtt < 2:1121889/150‑1 (MQ=255) gTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATAtt < 2:1173384/150‑1 (MQ=255) aTTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATtta > 1:1083745/1‑150 (MQ=255) cGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATttaatta < 2:531807/151‑1 (MQ=255) cGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATttaatt > 2:603496/1‑150 (MQ=255) cGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATttaatt > 1:1007992/1‑150 (MQ=255) gTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATttaattaa < 2:281675/151‑1 (MQ=255) gTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATttaatta > 2:794100/1‑150 (MQ=255) cTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCAtt > 1:647929/1‑151 (MQ=255) aGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCAtt < 2:484211/149‑1 (MQ=255) aGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCAtt < 2:170290/149‑1 (MQ=255) aGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATtat > 2:693499/1‑151 (MQ=255) aGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATta < 1:129770/150‑1 (MQ=255) aGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATta < 2:1021743/150‑1 (MQ=255) aaGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATtatat > 2:1216668/1‑151 (MQ=255) aaGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATtatat > 1:888240/1‑151 (MQ=255) tGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACttt > 1:357592/1‑151 (MQ=255) tGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACttt > 2:612313/1‑151 (MQ=255) cAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTc > 2:39406/1‑151 (MQ=255) cAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTc > 2:916841/1‑151 (MQ=255) atTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGCTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTa > 2:38716/1‑149 (MQ=255) tAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGgtt > 1:176025/1‑151 (MQ=255) aGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATTCTTTTCATTAGgtt < 2:157459/150‑1 (MQ=255) cGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATttaatt > 2:857427/1‑119 (MQ=255) cGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATttaatt < 1:857379/119‑1 (MQ=255) gTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGgttagtt < 1:568877/151‑1 (MQ=255) tATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGgttagtt > 2:457260/1‑150 (MQ=255) aTTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGgttagtta < 2:648431/150‑1 (MQ=255) ttAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACa > 2:586934/1‑150 (MQ=255) aaGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAAtt < 2:294031/151‑1 (MQ=255) aaaGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAAttttt < 2:259274/151‑1 (MQ=255) aaGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGATAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAAtttttt > 1:1170162/1‑151 (MQ=255) aGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTg < 2:698681/151‑1 (MQ=255) ttGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGt > 2:191577/1‑150 (MQ=255) aTGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGtt < 1:532075/150‑1 (MQ=255) tGAAGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTc > 2:670801/1‑150 (MQ=255) gAAGTTTAGGCAACATTTCATTATAATTTTTGGGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTc > 1:1133267/1‑150 (MQ=255) aaGTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTCAgg < 1:162255/151‑1 (MQ=255) gTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTCAGGCt < 1:663761/151‑1 (MQ=255) gTTTAGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTCAGGCt < 2:9833/151‑1 (MQ=255) aGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTCAGGCTGAcc < 1:237990/151‑1 (MQ=255) aGGCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTCAGGCTGAcc > 1:613416/1‑151 (MQ=255) ggCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGGTAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCCGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTCAGGCTGACCt > 2:685788/1‑151 (MQ=255) gCAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTCAGGCTGACCTa < 2:300854/151‑1 (MQ=255) cAACATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTCAGGCTGACCt > 2:440113/1‑149 (MQ=255) aaCATTTTATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTCAGGCTGACCTAg > 1:1191073/1‑150 (MQ=255) | CCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCATTATAATTTTT‑GGGGGGTTCGAACATATTATTCACCTGAGTCACGCTTTAGGATAGTGTAATGGTAATATTTAATTAAGTGTCATTATATACTTTTCAGTAGGTTAGTTACAATTTTTTGTATCTGTTCAGGCTGACCTAG > NC_000913/1198054‑1198343 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |