Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 862,559 | 0 | G | T | 38.7% | 103.6 / 41.1 | 75 | H16Q (CAC→CAA) | ybiW | putative pyruvate formate lyase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (14/32); new base T (29/0); total (43/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.76e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTGCGATTCGCCAGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGCAAAGTCGAGCAGTTCTGGCGCATCAAGCGGTTTTTCCGGGGCGTCAT > NC_000913/862416‑862709 | gTGCGATTCGCCAGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCtt < 1:859927/151‑1 (MQ=255) tGCGATTCGCCAGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGAGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCTCAATAAACACCAGCGCATTTTTTTGCGCttt > 1:444816/1‑151 (MQ=255) gCGATTCGCCAGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑a < 2:239307/151‑1 (MQ=255) aTTCGCCAGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTCCAATATTCACCAGCGCCTTTTTTTGCGCcttt > 1:280691/1‑147 (MQ=255) cGCCAGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCgg < 2:481025/151‑1 (MQ=255) cGCCAGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCgg < 2:1091595/151‑1 (MQ=255) ccAGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTc < 1:1193229/151‑1 (MQ=255) cAGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTTCAAAATGCCCCAGCGCCATTTTTTGCGCTTT‑TATTCGGGCg > 2:1052268/1‑151 (MQ=255) aGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTTCAATATGCACCAGCGCATTTTTTTGGGCTTT‑TATGCgg > 2:947365/1‑147 (MQ=255) aGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAAAATTGACCCGCGCAGTTTTTTTCGCGTT‑TATgt > 1:1252081/1‑144 (MQ=255) ggTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCt < 2:563527/151‑1 (MQ=255) gTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTg < 1:842312/151‑1 (MQ=255) tGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACCAAATGCACCCGCGCCTTTTTTTTCGCTTT‑AATTGGGGCGCTg > 1:493682/1‑150 (MQ=255) gATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAg < 1:1374803/151‑1 (MQ=255) tGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAAAATGCACCAGCGCATTTTTTTGTGCTTT‑TAAGCGGGTGGTGAGCg > 2:368418/1‑151 (MQ=255) gcCAGTGCCCGCGCGCGACGGACTGAGATTGGCTTATCGAGATGTTGTGGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCACGCTGGGTACAGACTGGCGGTTTCACCATGTGCGCCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCgta < 1:123448/150‑2 (MQ=255) gcCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAATAATCCCCCGCGCCTTTTTGTGCGCTTT‑TATTCGGTCGCTGAGAgtg > 2:988429/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTc < 1:1180756/151‑1 (MQ=255) cgcgcgACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAAAATGCACCAGCGCCTTTTTTTGGGCTTT‑TATGCGGGCGCTGGGCGGGTCCAGttt > 2:1144110/1‑147 (MQ=255) aCGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAATATGCACCAGCGCATTTTTTTGCGCTTT‑TATTCGGGCGCTGGGCGTGTCCCGTTTCAGTGTgg > 2:1259879/1‑149 (MQ=255) aCGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAATATGCACCAGCGCATTTTTTTGCGCTTT‑TATGCGGGCGCCGAGCGTGTGCAGGTTCAGGGTgg > 1:745756/1‑149 (MQ=255) gTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAATATGCACCAGCGCACTTTTTTGCGCTTT‑AATTCGGTCGCTGGGCGGGTCCCGTTTCCGTGTGGTCAt > 2:964922/1‑151 (MQ=255) aCCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATg < 1:1033453/150‑1 (MQ=255) ccGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACCATATGCACCAGCGCAATTTTTTGGGCTTT‑AATATGGTGGCCGAGCGTGTTAAGGTTCAGTGCGGTCCTgg > 2:714538/1‑150 (MQ=255) ccGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACCAAATGCACCCGCGCCATTTTTTGCGCTTT‑TATGCGGGGGCCGAGGGTGGGCCGCTTTAGTGTgggcgttg > 1:288496/1‑144 (MQ=255) ccGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAATATGCACCAGCGCATTTTTTTGGGCTTT‑AATGCGGGCGCTGGGCGGGTCCAGTTTCCGTGTgggcct > 2:1407727/1‑144 (MQ=255) aTCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAAAAAACAACAGAGGAATTTTTTTTGCTTT‑AAATCGGGGGCTGAGCGGGTCCCCTTTTAATGTGGGCATGggtgtt > 1:1019014/1‑150 (MQ=255) ggCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGGTTTAAAATGTACACCAGCGCATTTTTGTGCGCGTT‑AATGTGGGCGCTGAGCGGGTGCAGGTTCAGTGGGGTCGTGgttgtt > 2:868730/1‑147 (MQ=255) gCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCt < 1:54429/151‑1 (MQ=255) gCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGCTTCACAATTTTCACCACTGCATTTTTTGGGGCTTTAAATTCGG‑CGCCGAGCGCGTCCACATTTAGGGTgggtccgggt > 2:1192457/1‑135 (MQ=255) tATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCg < 2:926180/150‑1 (MQ=255) gagaTGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCCCAATATTCACCAGTGCCGTTTTTTGCGGCTT‑TATGCGGGCGGTTGGCGTGTTCCCGTTCACGGGGGTCATGGTTGTTTTTCTTGTac > 1:668332/1‑148 (MQ=255) gagaTGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGGCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTaa < 1:512622/149‑1 (MQ=255) agaTGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGt < 2:99737/151‑1 (MQ=255) gaTGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTc < 2:1113177/151‑1 (MQ=255) aTGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGGTTCTCAAAATGCACCCGCGCCTTTTTTTGGGCTTT‑TATGCGGGCGCCGAGCGTGTCCCGGTTCTGTGTGGGCATGGTTGTTTTCCTCGTAAGGGcg > 1:1114493/1‑151 (MQ=255) tgttgtTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCCTTTTTTTGCGCTTT‑TATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCCGTTTTTGTGTGGGCATGGTTGTTATCCTCGTAAgg > 2:957235/1‑147 (MQ=255) ttgttgATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAAAATGCACCCACGCATTTTTTTGCGCTTT‑AATGGGGGCGCTGAGCGTGTCCAGTTTTAGTGTGGGCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCgg > 2:87547/1‑151 (MQ=255) tgttgATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCgg < 1:659789/150‑1 (MQ=255) gttgATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAATATTTCCCAGCCCCTTTTTTTTGGCTTT‑TATGCAGGCGCCGGGAGGGGCCCGTTTCAGTGGGGGCCTGGTGGTTTTTCTCCTAAAGTc > 1:1365107/1‑145 (MQ=255) gttgATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGtt < 2:1108958/151‑1 (MQ=255) aTACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGGTTCAAAATATGCAACAGCGCATTTTTTTGTGCTTT‑TATTGGGGGGCTTCGGGTGTGCAGTCTTAGTGGGGGGATGGTTGGTATTCTCGCAAGGTGGCgggt > 1:1271419/1‑145 (MQ=255) cATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCTCAATAAGACCCCGCGCACTTTTGTGGGCTTT‑AATGCGGGGCCTGAGCGTGTCCAGATTTAGTGGGGGTCTGGGTGGTTTCCTCGTCAGGGCGCGGGTAACCCtt > 1:48605/1‑151 (MQ=255) cATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCtt < 2:1191014/151‑1 (MQ=255) ctcGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTCCAATATGCACCAGCGCATTTTTTTGCGCTTT‑TATGCGGGCGCTGAGCGTGTCCCGTTTTTGTGTGGGCATTGTTGTTATCCTCGTAAGGGCGCGGGTTACCCTTTCt > 2:1047203/1‑151 (MQ=255) tcGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGGTTCTCAATATGCACCCACGCCTTTTTTTTGGCTTT‑TTTGCCGGCGCTGCGCGGGTCCCGTGTCCCGGTGGTGTCGGGTTTTTTCCCTGTAAGGGCGCGGGGTACCCttt > 2:1190775/1‑148 (MQ=255) cGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCt < 1:1112861/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAATATGCACCAACGCATTTTTTTGCGGCTT‑TATGTGGGCGGGGAGCGTGTCCCAGTTCCGTGTGGGCATGGTTGTTATCCTCTTGAGGGCGCGGTTAATCCTCTCTtgcgggcac > 1:243141/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAATATGCCCCAGCGCCTTTTTTTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTTAGTGTGGGCATGGTTGTTATCCTCGTTAAGTGGCGGGTTACCCTTTTTGGCAGGCAt > 2:760682/1‑150 (MQ=255) tgcGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCCCAAAATGCACCCGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑TATGCGGGCGCTGCGCGTGGCCAGGTTTAGTGTGGGCCTGGGTGTTTTTCTCGTAAGGTCGCGGGTAAACCCTTCTTGCAGGGATAct > 1:1008440/1‑150 (MQ=255) gcgcgcgcTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATActg < 1:166150/150‑1 (MQ=255) gcgcgcgcTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATActg < 2:1089032/150‑1 (MQ=255) gcgcgcgcTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCACGCATActg < 2:1000786/150‑1 (MQ=255) cgcgcgcTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACTATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATActgct < 2:782392/151‑1 (MQ=255) cgcTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACCAAATTCAACACGGCCCTTTTTTGCGCCTT‑CAAATGGGGGGTGTGCGAGTGCAGGTTTTGTGTGGGCCTGGTTGTTTTTCTCCGAAGGGCGCGGGTAACCCCTTCTGGGAGGCATActcattg > 1:1414597/1‑144 (MQ=255) cTCGGTACAGACTGGCGGTTTTACAAAATGCACCCACGCATTTTTTTTCGCTTT‑AATGGGGTCGCTGAGCGTGTCCCGTTTCAGTGTGGTCCTGGTTGTTTTTCTCGTAAAGGCGCGGGTAAACCCTTTTTGCAGGCATACTGCTggg > 1:767338/1‑148 (MQ=255) tCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTTTGCGCTTT‑AATGAGGTCGCTGAGCGGGTCCAGTTTCAGTGGGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGGaa > 2:1123990/1‑150 (MQ=255) cGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGCaaa < 1:643548/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGCAAAGTCGAGCAGtt > 2:269102/1‑151 (MQ=255) ggCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGCAAAGTCGAGCAGTTc > 2:1347498/1‑151 (MQ=255) cGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGCAAAGTCGAGCAGTTCTg < 2:41901/151‑1 (MQ=255) ttCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGCAAAGTCGAGCAGTTCTGgcgc > 1:138293/1‑151 (MQ=255) acaATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGCAAAGTCGAGCAGTTCTGGCGCATc < 1:1255710/151‑1 (MQ=255) 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ttttGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGCAAAGTCGAGCAGTTCTGGCGCATCAAGCGGTTTTTCCGGGGc < 2:340088/150‑1 (MQ=255) tttGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCATTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGCAAAGTCGAGCAGTTCTGGCGCATCAAGCGGTTTTTCCGGGGCg < 2:584397/150‑1 (MQ=255) gtgCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGCAAAGTCGAGCAGTTCTGGCGCATCAAGCGGTTTTTCCGGGGCGTCAt < 2:555993/151‑1 (MQ=255) | GTGCGATTCGCCAGGTGATGCGCCAGTGCCAGCGCGCGACGTACCGGGATCGGCTTATCGAGATGTTGTTGATACATCTCGGTATAGTGCTGCGCGCGCTCGGTACAGACTGGCGGTTTCACAATATGCACCAGCGCATTTTTGTGCGCTTT‑AATGCGGTCGCTGAGCGTGTCCAGTTTCAGTGTGGTCATGGTTGTTATCCTCGTAAGGTCGCGGTTAACCCTTTCTGGCAGGCATACTGCTGGGCAAAGTCGAGCAGTTCTGGCGCATCAAGCGGTTTTTCCGGGGCGTCAT > NC_000913/862416‑862709 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |