| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 281,089 | 0 | A | C | 37.9% | 189.9 / 10.8 | 105 | Y299D (TAT→GAT) | yagA | CP4‑6 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/12); new base C (0/39); total (52/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.15e-18 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
ACCCGTTCTCCCCTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTGCAGCACTTCCGCCTTCAGGCTGCGGTGAAAACG > NC_000913/280941‑281239 | aCCCGTTCTCCCCTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATAcc > 2:1118167/1‑151 (MQ=255)aCCCGTTCTCCCCTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATAcc > 2:870452/1‑151 (MQ=255) ccGTTCTCCCCTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCGCCCCTTCACCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTGCTGCCGCGCTGACGGCTGATACcgc < 2:268917/151‑1 (MQ=255) ccGTTCTCCCCTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACcgc < 2:518060/151‑1 (MQ=255) ttCTCCCCTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACcgcg > 2:491000/1‑149 (MQ=255) tctcCCCTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAg < 1:1368272/150‑1 (MQ=255) tctcCCCTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGc > 1:1374813/1‑151 (MQ=255) tcCCCTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGccc > 2:674410/1‑151 (MQ=255) ccccTGAACGACTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTGTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCCCCCCTTTATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTTCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGccc < 1:1325575/150‑1 (MQ=255) cccTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCgg < 2:1307839/151‑1 (MQ=255) cccTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCgg > 2:553703/1‑151 (MQ=255) cccTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCgg > 2:1171571/1‑151 (MQ=255) gAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCCCCCCTGCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑a < 1:287920/149‑1 (MQ=255) gAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑Ac < 1:828353/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATcc > 1:930619/1‑150 (MQ=255) ccTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATcc > 2:605084/1‑150 (MQ=255) cTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATcc > 2:805215/1‑149 (MQ=255) tGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAgc > 1:835160/1‑151 (MQ=255) cAGCCTTCCCCCTTTCACCCCCAGTTTCCCGCTAATATCCCCTTCCCTG‑CCCCCCCCCCCTTCCCAGTATCCCGGGGGGTTTTTGTTGCCCCTGTTCGGCCGCGCTGCCGGCTGATCCCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTc < 1:549607/150‑1 (MQ=255) aGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCg > 1:811116/1‑150 (MQ=255) aCTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCgcgc > 1:316516/1‑151 (MQ=255) ttACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCg > 1:888893/1‑150 (MQ=255) tccccccTTTCCCGCTCACCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTC‑CCCACCCCCCCTTCATCGTATCCGGGGGGGGTTGTGTTGCCGTTGTACTGCCGCGCTGCCGGCTGATCCCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGc < 2:808877/146‑1 (MQ=255) ccccTTCCCCGCTCACCTTCCCGCTGATATCCCCTTCCCTG‑CCCACCCCCCCTTCATCGTTTCCCGGGGGGTTTGTGTTCCCGCTGTCCTGCCGCGCTGACGGCTGATCCCGCGAGCCGGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCg < 2:1374719/147‑1 (MQ=255) ccTTTCCCGCCCAGCTTCCCGCTAATATCCTCTTCCCGG‑ACCACCCCCCCTTCATCGTATCCCGGGGGCTTTGTTTTCCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATCCCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGtt < 2:532130/151‑1 (MQ=255) ccTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGt > 1:1307412/1‑150 (MQ=255) tttCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTc > 2:838602/1‑150 (MQ=255) ttCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCa > 1:486140/1‑150 (MQ=255) cACGCGCAGCTTCCCGCTGATTTCCCCTTCCCGG‑ACCACCCCCCCTACATGGTATCCGGGGGGCGTGGGTTTGCCGCTGTCCTGCCGCGCTGACGGCTGATGCCGCGAGCCTGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAg < 2:930665/150‑1 (MQ=255) gCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATCTCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGtt > 2:809834/1‑150 (MQ=255) cccAGCTTCCCGCTGATCTCCCCTTCCCTG‑ACCCCCCCCCCTTCATCGTATTCGGGGGGCTTTGTGTCCCCGCTGTACGGCCGCGCTGCCGGCTGATCCCGCGAGCCGGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTtat < 1:239108/149‑1 (MQ=255) cTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTtat > 2:108676/1‑151 (MQ=255) ccgCTTCCCGCTTATATCCCCTTTCCTG‑CCCACCCCCCCTCCTGCGTCTTCCGGGGGCGTTGTGTTCCCTCTGTCCTGCCGCGCGGAGGGCTGATCCCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTtata < 1:588552/148‑1 (MQ=255) aGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTtat > 1:1232385/1‑148 (MQ=255) aGCTTGCCTCTAATATCCCCTTTCCTG‑CCCATCCCCCTTTCACCGTTTCCGGGGGGCGTGGGGTTTCCGCTGTACTGCCGCGCGGCCGGCTGATCCGGCGAGCCGGGT‑GCCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGa < 2:420363/151‑1 (MQ=255) cTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑CCCACCCCCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTCCCGCTGTACTCCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGa < 2:69567/149‑1 (MQ=255) ttCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGt > 2:837958/1‑151 (MQ=255) ccGCTGATACCCACTTTCCTG‑ACCACCACCCCTTCATCGTATCCCGGGGGGGTTGTGTTGCCCCTGTCCTGCCGCGCTGCCGGCTGATACGGCGAGCCCGTT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGt < 2:1145046/149‑1 (MQ=255) 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tcccTG‑CCCACCCCCCCTCCATCGTATCCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTTTCCTCCCGCGCTGACGGCTGATCCCGCGAGCCGGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAg < 2:1080395/148‑1 (MQ=255) cTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGgcgc > 2:1268848/1‑151 (MQ=255) tG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGgcgcg > 2:1200875/1‑151 (MQ=255) ccccccccccTTCATCTCATGCGGGGGGTGTTGTTTTGCGGGTGCACTGCCGCGCGGACGGGTGAACCCGCGGCCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGgcgcgc < 1:175117/143‑1 (MQ=255) ccacccccccTTCATCGTATTCGGGGGGCTTTGTGTTGCCGCTTTCCTGCCGCGCTGACGGCTGATCCCGCGAGCCGGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTg < 2:1108617/145‑1 (MQ=255) ccacccccccTCCTTCGTATTCGGGGGGCGTTGTGTTGCCGTTGTACTGCCGCGCGGACGGCTGATCCCGGGGGCCGGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCt < 1:680744/144‑1 (MQ=255) ccacccccccTCCATCGTTTCCGGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTCCTGCCGCGCTGCCGGCTGATCCCGCGAGCCGGTT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCt < 2:690535/144‑1 (MQ=255) ccATCCCCCCTTCATCGTATCCGGGGGGCGTTGTTTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATCCCGCGGGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGgcgcgc < 2:627230/149‑1 (MQ=255) ccTTCATTGTTTTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCGCTCCTGCGGCGCTGCCGTTGGATCCCGCGGGCCGGGT‑CCCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCAc < 1:519829/151‑1 (MQ=255) ttCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGCTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTc > 1:279603/1‑147 (MQ=255) 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ttgcccGGGGGCGTTTTGTTGCCTCTGCCCGGCCGCGCTGACGGCTGATCCCGCGCGCCCGGT‑CCCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCg < 1:139248/140‑1 (MQ=255) ttccggggggCGTTTTTTTGCCTCTTTCCTGCCGCGTTGGCGGCTGATCCGGCGACCCGGTT‑CCCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTg < 1:164489/145‑1 (MQ=255) tCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCg > 1:1268934/1‑150 (MQ=255) ggcGGGGGAGTTGTGTTGCCGTCATAGTGCCGCGCGGACGGCGGGTTCGGGGGGCCCGGA‑GCCGCCATATCCAGCGGCTGGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGc < 2:28080/147‑1 (MQ=255) cgggggggGTTGTTTTGCCGCTGTCCGGCCGCGCTGCCGGCTGATCCCGGGAGCCGGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGc < 2:520072/146‑1 (MQ=255) 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tgtTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTg > 1:286866/1‑151 (MQ=255) ccGTTGTCCTGCCGCGCTGCCGGCTGACCCCGCGACCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTgc < 2:361373/147‑1 (MQ=255) ccGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTgcagc > 1:550076/1‑150 (MQ=255) ctcTGTCCTGCCGCGGGGCGGGCTGCTCCCGCGCGCAGGTT‑CCCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTgcagca < 1:567174/148‑1 (MQ=255) cGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTGCAGCAc > 2:1340529/1‑151 (MQ=255) ccggccgcgtggcgggCTAATCCCGCGCCCGCGGT‑CCCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTGCAGCACTTcc < 1:779259/135‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTGCAGCACTTCCGCCt > 2:381391/1‑150 (MQ=255) tGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTGCAGCACTTCCGCCTTCAGGCTg > 1:601461/1‑151 (MQ=255) tGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTGCAGCACTTCCGCCTTCAGGCTg > 1:746785/1‑151 (MQ=255) ggcggggtGATCCCGCGGCCCCGTT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTgca < 1:1182742/124‑1 (MQ=255) 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cTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTGCAGCACTTCCGCCTTCAGGCTGCGGTg > 2:1276857/1‑150 (MQ=255) aCCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTGCAGCACTTCCGCCTTCAGGCTGCGGTGAAAACg > 2:269488/1‑151 (MQ=255) | ACCCGTTCTCCCCTGAACGCCTTGCCTGCGCTCAGACTTACCCCTTTCACGCTCAGCTTTCCGCTGATATCCACTTTCCTG‑ACCATCACCCCTTCATCGTATTCCGGGGGCGTTGTGTTGCCGCTGTACTGCCGCGCTGACGGCTGATACCGCGAGCCCGGT‑ACCGCCATATCCAGCGCCTCGTGCGGGCGTTCAAGGTTATAGACCGTCCGCCAGTGGTCGAAGGCGCGCTGCAGTTCACCGCTGTCTGCGAACCATTTTCCCTGCAGCACTTCCGCCTTCAGGCTGCGGTGAAAACG > NC_000913/280941‑281239 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |