| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2805674 = | 0 (0.000) | 83 (1.090) | 74/298 | 0.1 | 100% | coding (860/1203 nt) | proV | glycine betaine/proline ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
CTGCGTTAACGCGGTTTTAAGCGAATCGATGGAGACTGCGCCGACAAACTTATTACCGCGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2805819‑2805674‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAAT < NC_000913/3584195‑3584049 CTGCGTTAACGCGGTTTTAAGCGAATCGATGGAGACTGCGCCGACAAACTTATTACCGCGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTA > 1:846530/1‑150 GCGTTAACTCGGTTTTAAGCGAATCGATGGAGACTGCGCCGACAAACTTATTACCGCGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAAT < 2:750539/150‑1 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1:129707/1‑150 GCGGTTTTAAGCGAATCGATGGAGACTGCGCCGACAAACTTATTACCGCGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAAC < 2:297545/151‑1 GCGGTTTTAAGCGAATCGATGGAGACTGCGCCGACAAACTTATTACCGCGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAAC > 2:1064975/1‑151 GGTTTTAAGCGAATCGATGGAGACTGCGCCGACAAACTTATTACCGCGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTT > 1:419001/1‑151 ggTTTAAGCGAATCGATTGAGACTGCGCCGACAAACTTATTACCGAGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCAGCCTGCAATAATTTGAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTTA < 2:693455/149‑1 GTTTTAAGCGAATCGATGGAGACTGCGCCGACAAACTTATTACCGCGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTTA < 2:1112327/151‑1 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2:681716/150‑1 CGACAAACTTATTACCGCGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC > 2:1104768/1‑151 CAAACTTATTACCGCGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 1:1000975/1‑151 AACTTATTACCGCGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 2:6219/151‑1 AACTTATTACCGCGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 1:846623/1‑147 ACTTATTACCGCGTTCGATAACGTAGCCATATTCGCGATCTTCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 2:249134/1‑151 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2:157088/1‑150 TCATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCG < 1:905692/150‑1 ATCCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACT > 2:484911/1‑151 CCTGCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTC > 2:689893/1‑151 GCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT < 1:577133/151‑1 GCAATAATTTCAGTGCCGAACGTGGGCCGAAGCCAGGGGTTTTACGAATTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > 2:907639/1‑151 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NC_000913/2805819‑2805674‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAAT < NC_000913/3584195‑3584049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |