Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 516,925 | 0 | T | G | 40.9% | 98.5 / 10.3 | 66 | S115A (TCG→GCG) | fetB | iron export ABC transporter permease; peroxide resistance protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (14/25); new base G (27/0); total (41/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.51e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAA > NC_000913/516778‑517058 | aCATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGGATTACCCTGGCGGGGCTGATTTTCTCAGGGt > 1:155200/1‑148 (MQ=255) tattGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGGCGAtt > 2:674163/1‑149 (MQ=255) tGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGGGCTGATTCTCTCAGGGTCGGttttatt > 2:1185805/1‑146 (MQ=255) gATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGGGGGGCTGATTTTCCCCGGGGGGGTTGAAtt > 2:669169/1‑150 (MQ=255) gATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGGCGGTTTAAttt > 2:921863/1‑151 (MQ=255) tatttatCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGGGCTGATTCTCTCAGGGGCGGTTTAATTTTTccc > 2:424616/1‑148 (MQ=255) atttatCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAAATAACCTGGGGGGGCTGATTCTCTCAGGGGCGAATTAATTTAttc > 1:189413/1‑144 (MQ=255) atCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAg < 2:490416/150‑1 (MQ=255) tttAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTTTCTCAGGGGCGGTTGAATTTATTCCGATGCAGGTGGTcc > 2:1150242/1‑151 (MQ=255) tAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGGGCTGATTCTCTCAGGGGCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATccc > 2:573410/1‑150 (MQ=255) aaTGCACCGTGGACCGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTATTAAAGCTTTTTTTTCATCGTTTATTTCCCTTACAGTTTGTTCGTGACTTAAACCGGCGGTGCTGATTCTCGCAGAGTCGATTGAAATAATCCAAATGCAAGCGATc < 1:922535/147‑1 (MQ=255) cggcgTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGGGCTGATTTTTTCAGGGGCGATTGGATTTTTCCCGCTGCCGGGGGTCCCTATCGc > 1:1144668/1‑151 (MQ=255) cgTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCgg < 2:647163/151‑1 (MQ=255) gTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCCGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGGCGATTGAATTTTTTCCGATGGAGGGGATGCCAATCGCCggg > 1:1175353/1‑151 (MQ=255) ggAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGgat < 1:779763/151‑1 (MQ=255) aaCGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGGCGATTGAATTTATTCCGATGCAGGGGGTCCCTATCGCCGGgatg > 2:38857/1‑150 (MQ=255) gcgcAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGGCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGGGATCCCTATCGCCGGGGTGAtt > 2:1172278/1‑150 (MQ=255) cAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCg < 1:314889/151‑1 (MQ=255) aaaaaCGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGGTGATTTTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGGAGGGGATCCCTATCGCCGGGGTGATTTCCgg > 1:61670/1‑151 (MQ=255) aaaaCGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGt < 2:918461/151‑1 (MQ=255) aaaCGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCCGTTTTTCTCAGGGGCGGTTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATTCCTATTGCCGGGGTGATTTCCgg > 1:326226/1‑149 (MQ=255) aGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCa < 1:885142/151‑1 (MQ=255) aGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGGGCTTATTCTCCCAGGGGCGATTGAATTTATCCCGGTGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCCGtta > 2:911231/1‑144 (MQ=255) gTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTTTCTCCGGGGCGGTTGAATTTATTCCCATGGCGGTGATCCCCATCGCCGGGGTGATTGCCGGGAAAGcc > 2:863720/1‑149 (MQ=255) gTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCAt < 1:355581/151‑1 (MQ=255) tAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCCGGCGGGGGTGTTTTTCTCACGGTCGATTGAATTTATTCCCGTGGCGGGGATCCCTCTCGCCCGGGAGATTGCCGGTAAAGcc > 1:863411/1‑148 (MQ=255) aaaTATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATgg < 1:185164/151‑1 (MQ=255) aaaTATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGGGCTGATTCTCTCAGGGGCGATTGAATTTATTCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCCGGATGATTGCCGGGAACGCCATgg > 2:797523/1‑151 (MQ=255) aaTATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGGGCTGATTTTCTCAGGGGCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGGGGTCCCCATCGCCGGGGTGATTGCCGGGAACGCCATgg > 2:1137915/1‑150 (MQ=255) aaTATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTCGCGGGGCTGATTTTCTCAGGGGCGATTTAATTTATTCCCCTGCAGGGGATTCCTATCGCCGGGGTGATTGCCGGGAACGCCATgg > 1:281259/1‑150 (MQ=255) atatTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAg < 2:241371/150‑1 (MQ=255) gCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTg < 1:838695/150‑1 (MQ=255) gCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGGGCTGATTTTCTCAGGGGCGATTGAATTTATCCCGGTGCAGGGGGTTCCTATCGCCGGGGTGATTGCCGGGAAAGCCATTGGAGCGgggg > 2:464244/1‑151 (MQ=255) tAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGGATTACCCTGGCGGTGCTGATTTTCTCAGGGGCCGTTAAATTTATTCCCGTTCTGGGGGTCCCTATCCGCGGGATGGTTGCCGGGAAAGCCATGGTgggggggggg > 2:1041860/1‑151 (MQ=255) aaaGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTggg < 1:761080/149‑1 (MQ=255) aaaGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGt < 2:1180430/151‑1 (MQ=255) gCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTtgt < 2:820176/151‑1 (MQ=255) ttttATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTTTTTCAGGGTCGATTGAATTTTTCCCGATGCCGGTGGTTCCTATCGCCCGGGTGATTTCCGGCAACCCCCTGGTAGCGGTGGGGgtgt > 1:557846/1‑149 (MQ=255) tttATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAAATACCCTGGCGGGGTTGATTTTCTCAGGGTCGATTGGAATTTTTCCGATGCCGGGGGTCCCTATTGCCGGGGGGATTGTCCGTAAAGCCATGGTAGCGGGGGGGGtggggt > 1:1152702/1‑147 (MQ=255) tATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTa < 2:70587/150‑1 (MQ=255) tATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTCGCGGGGCTGATTCTCTCAGGGGCGGTTGAATTTATCCCCATGCAGGGGATCCCTTTTGCCGGGCTGAATGCCGGGAACGCCCTGGGGGCGGTGGGGGTGTGtt > 1:549633/1‑149 (MQ=255) aTCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTTTCTCAGGGGCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGGGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGGAGCGGTGGGGGTGTGtt > 2:236159/1‑148 (MQ=255) aTCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGGGCTGATTTTCTCAGGGGCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGGGATCCCCATCGCCGGGGTGGTTGCCGGTAACGCCATGGGAGGGGGGGGGGTGGGtt > 2:417964/1‑148 (MQ=255) aTCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCCTGCGGGGTCGGTTCTCTCCGGGGCGGTTTGATTTTTCCCCATGCAGGGGATCCCCATTGCCGGGGGGATTGGCGGGAACCCCATGGGAGggggggggg > 1:675751/1‑141 (MQ=255) ctcATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGGGCTGATTCTCTCAGGGGCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGGGGTCCCTATCGCCGGGGTGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGGGGGGGTGTGGTacaa > 2:69991/1‑150 (MQ=255) aTCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTTTCTCAGGGGCGATTGAATTTTTCCCGATGCAGGTGATTCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCCAGGTAGCGGGGGGGGTGGGTTaaaa > 2:841594/1‑147 (MQ=255) cGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAAtt < 1:1005761/150‑1 (MQ=255) aTTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTCCCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGAGTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGc < 2:520068/151‑1 (MQ=255) tGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCa < 1:294378/150‑1 (MQ=255) tGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCCGATTCTCTCCGGGTTGGTTTAATTTTTCCCCGTGCAGGTGGTCCCTTTCCCCCGGGTGATTGCCCGTAACGCCATGGGAGCGGGGGGGGTTTGCTTCCACAATTTTgggga > 1:430866/1‑148 (MQ=255) tGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTAACCTGGCGGTGCTGATTTTTTCAGGGGCGATTGAATTTATCCCCATGCAGGGGATCCCCATCGCCGGGGTGATTGGCGGGAAAGCCCTGGGAGCGGGGGGGGTGTGTTAAAAAAATTTAagg > 1:2954/1‑148 (MQ=255) ccATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGGGCTGATTCTCTCAGGGGCGGTTGAATTTATTCCGGTGCAGGGGGTCCCTATCGCCGGGGTGATTGCCGGGAACGCCATGGGAGCGGGGGGGGTGTGTTTCAACAATTTAGGGCaa > 1:1200660/1‑149 (MQ=255) aCGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCa < 2:708017/151‑1 (MQ=255) cGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCAt < 1:1170935/151‑1 (MQ=255) ggTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGGTTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTTGTACAACAATTTTGGGCAACGGGGCAtt > 2:1052783/1‑151 (MQ=255) ggTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCAtt < 2:981479/151‑1 (MQ=255) cGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAg < 2:818254/150‑1 (MQ=255) cGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGc < 1:746026/151‑1 (MQ=255) cGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGGTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGGCATTAg > 2:56435/1‑150 (MQ=255) cGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAAc > 2:362287/1‑150 (MQ=255) cGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACa < 1:140801/151‑1 (MQ=255) ggAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAg > 1:1043882/1‑150 (MQ=255) aCCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAAc > 1:374211/1‑148 (MQ=255) aCCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGGTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAAc > 2:682832/1‑148 (MQ=255) cccTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGGGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCGTGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCaa > 2:239940/1‑146 (MQ=255) ggTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTATCGAACAGCAACAGATTCAGgag < 1:832068/151‑1 (MQ=255) gCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGaa > 1:674803/1‑150 (MQ=255) | ACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAA > NC_000913/516778‑517058 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |