| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 802,118 | 0 | A | C | 40.5% | 122.0 / 11.7 | 74 | T78P (ACC→CCC) | ybhI | putative DASS family tricarboxylate or dicarboxylate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/10); new base C (0/30); total (34/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.83e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGCTG > NC_000913/801970‑802261 | aaGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAac < 2:1256918/150‑1 (MQ=255) aGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAacca < 2:787066/151‑1 (MQ=255) gAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCAccg > 2:593522/1‑151 (MQ=255) aCTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGATCCTGTCGTCCTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCAccgcc < 2:213420/151‑1 (MQ=255) gggTGTTTTTTGGTATTTACCGGGCGGCTATTGTGGGGCTGTTTATCAAGCTTTTCCCGGAACCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGGGGTGGTGGG‑TAACTTACCCGACGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTaa < 1:913768/150‑1 (MQ=255) tttttACCGGGCGGCCTTTGTGGGGCGGTTTACCAAGCCTTCCCGGGACCCGCTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTCCCTAAATGGTGGTGGTCGG‑TAATTTATCCGCGGGTGCTTTAAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCtt < 1:615223/147‑1 (MQ=255) tttACCGGGCGGCCTTTGTGGGGTTGGTTATAAACCTTTCCCCGGACCCTGTCGTACTGTTATTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGCCGGTGCGTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAg < 2:1113327/150‑1 (MQ=255) aCCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTac > 1:176310/1‑151 (MQ=255) ccTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCTTATTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGGGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCTTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTa < 2:732943/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTacc > 2:846935/1‑151 (MQ=255) ccTGCCGGCCATTGGGGGGCTGGTTATCAAGCCTTCCCCGGACCCTGTCGTCTTTTTAATTGCCGTTGCTGCCCCAAGGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGAGGGTGCGTTTAAACCAACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGt < 2:134489/148‑1 (MQ=255) cTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTacc > 1:1196132/1‑150 (MQ=255) ggcggcCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGACCCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTACCCGACGGTGCGTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTacca < 2:134683/149‑1 (MQ=255) gcCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggc > 1:683011/1‑151 (MQ=255) cATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggctg > 1:980070/1‑151 (MQ=255) ttGTGGGTCTGTTTATCTGCCCTTCCCTGGAACCTGTCGTTTTGTAACTTGCCTGTGCTCCCTCAGT‑GTGGTGGGGGGTTATCTTCCCCGCCGGTCCGTTAAAGCCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctg < 1:709491/145‑1 (MQ=255) ttGGGGGGCTGTTTATCAAGCCTTCCCGGGACCCTTTCTTACTTTTAATTGCCGTTGCTCCCTCAATGGGGGGGGTCGT‑TAATTTTTCCGACGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggctg < 1:704242/149‑1 (MQ=255) gtgGGGGGGTTTATCAACCTTTCCCCGGACCCTTTGTTACTTTTAATCGGCGTGCCTGCCTCAGGGTGGGGGGTCGT‑TACTTTATCCGTCGGTGCGTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggct < 1:624908/146‑1 (MQ=255) ggCTGTTTATCAAGCCTTCCCGGGACCCTGTCTTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAATTTTCCCGACGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtctc < 2:1150336/151‑1 (MQ=255) ggCTGGTTATCAACCTTTTCCCGGACCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTAAATGGGGGTGGTCGG‑TAATTTATCCGACGGTGCGTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtctc < 2:378303/151‑1 (MQ=255) tGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGc > 1:855264/1‑151 (MQ=255) acgcttttCCCGGACCCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTAAATGGGGGTGGTCGT‑TAACTTTCCCGACGGTGCGTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTAcc < 1:119388/145‑1 (MQ=255) aatccTTTCCCGGACCTTGTCGTCTTGTAAATTCCCGTTGCTGCCTAAAGGGTGGTGGTCGT‑TACGTGACCCGACGGTGCGTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTa < 2:1193019/145‑1 (MQ=255) aacccTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTa < 2:1068441/145‑1 (MQ=255) aaGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCt > 1:573010/1‑151 (MQ=255) aaGCCTTCCCCGTACCCTGTCGTATTGTTTGTCCCGGTGGCTCCCAAAATGGGGGGGTTCGA‑TACCTCAACCGAGGGTGTTATTAAACCCTCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGttt < 2:532587/147‑1 (MQ=255) ccTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTa > 2:271806/1‑150 (MQ=255) ttccccGGACCCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTAAATGGTGGTGGTCGT‑TATCTTACCCGCGGGTGTTTTAAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTaa < 2:473200/146‑1 (MQ=255) cgcaccgtgccGTACTCTAAATTGCGGTGGCTGCCTCAAGGGGGGTGGTGGT‑TAATTTGTCCGGCGGGGCTTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGcgccg < 1:54983/140‑1 (MQ=255) ggAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGcgccgc > 2:1285850/1‑150 (MQ=255) aaCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTa > 2:143908/1‑89 (MQ=255) ccTGCCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTCCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTACCCGACGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTa < 1:143906/87‑1 (MQ=255) cTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtgt > 2:23874/1‑151 (MQ=255) cGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGacc > 2:280117/1‑151 (MQ=255) gtaattgaaaTTGCCGTTCATGGCAAAAGGGTGTTGGTCGA‑TATCTTCCCCTACGGTTTGTATAAACCCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGa < 1:1226472/140‑1 (MQ=255) ttttAATGGCTGTTGCTGCCTAAATGGTGGTCGCCGT‑AAAATTCACGGCCGGGCCGTTTAAAACCTCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCg < 2:475117/148‑1 (MQ=255) tAAGTGCCGTTGCTGCCTAAAGGGTGGTGCTGGG‑TATCTTACCCGACGGTGCTTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGtt < 2:527093/150‑1 (MQ=255) atttGCCGTTGCTGCCTCAAGGGTGGTGGTCGG‑TATTTTATCCGAGGGTGCGTTAAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGttt < 2:826921/148‑1 (MQ=255) atttGCCGTTGCGCCCTAAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCTTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGttt < 2:910700/148‑1 (MQ=255) aaTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGttt > 1:738548/1‑150 (MQ=255) aaTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGAGGTCGG‑TAATTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGttt > 2:982667/1‑150 (MQ=255) aaTTGCCGTTGCTCCCTAAATGGGGGTGGTCGG‑TAACTTACCCGACGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGttt < 2:789586/150‑1 (MQ=255) aTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGttt > 1:165809/1‑149 (MQ=255) tGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGt > 1:662093/1‑151 (MQ=255) cctttGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTACCCGACGGTGTTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAgg < 2:974489/145‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTa > 1:596217/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACg > 1:1086962/1‑151 (MQ=255) ttGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACg > 2:918975/1‑151 (MQ=255) tgctgcCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACg > 1:258788/1‑150 (MQ=255) gctccCTAAATGGTGGTGGTCGG‑TAATTTACCCGCGGGTGCTTTAAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACg < 2:954348/149‑1 (MQ=255) ccgcaggggtggtggtGGG‑TAACTTACCCGGCGGTGTTTTAAAACCCGCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACg < 1:1095562/138‑1 (MQ=255) ccTCAATGGTGGTGGCCGG‑TACCTTATCCGAGGGTGCGTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTAtt < 2:549386/149‑1 (MQ=255) aTGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATc > 1:335732/1‑151 (MQ=255) ggtggtgttCTG‑TACTTTCTCGGCGGGTGTGTTCAAAACCTCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGTCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTAt < 2:919633/141‑1 (MQ=255) tggtggtCGT‑AAATTTTCCCGTCGGGGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctg < 1:1298351/149‑1 (MQ=255) ggtggtCGT‑TATCTTATCCGACGGTGCTTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgct < 2:68044/150‑1 (MQ=255) ggtggtCGG‑TAACTTACCCGCGGGTGCGTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgct < 2:125874/150‑1 (MQ=255) gtggg‑TAACTTATCCGCCGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGAtt < 2:768753/147‑1 (MQ=255) gg‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGt > 2:704452/1‑150 (MQ=255) cgttactttACCCGAGGGTGGTTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTg < 1:3876/142‑1 (MQ=255) g‑TAACTAACCCGCCGGTGCTTTAAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGt < 1:1276798/149‑1 (MQ=255) aaCTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaaa > 2:845417/1‑150 (MQ=255) aaCTTACCGGACGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaa < 1:530223/149‑1 (MQ=255) ttATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCg > 2:380048/1‑151 (MQ=255) tATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCgg > 1:922981/1‑151 (MQ=255) aTCCGACGGTGCGTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATc < 2:341989/148‑1 (MQ=255) ccGAGGGTGTGTTAAACCCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAAt < 1:695165/145‑1 (MQ=255) cGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAac > 1:259664/1‑151 (MQ=255) aCGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAacac > 1:535744/1‑151 (MQ=255) cGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAAcacc > 2:299781/1‑151 (MQ=255) cGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAAcacc > 1:424664/1‑151 (MQ=255) ggTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAaca < 1:956775/148‑1 (MQ=255) tGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACg > 2:885246/1‑151 (MQ=255) gCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGc > 1:713567/1‑151 (MQ=255) gTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctg > 2:214843/1‑151 (MQ=255) gTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctg > 2:1277866/1‑151 (MQ=255) ttaaaacCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAAcaccac < 1:577147/143‑1 (MQ=255) | AAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGG‑TAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGCTG > NC_000913/801970‑802261 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |