Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,764,785 | 0 | T | A | 40.6% | 97.4 / 43.8 | 69 | intergenic (‑399/+149) | sufA/ydiH | Fe‑S cluster assembly protein/uncharacterized protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/7); new base A (0/28); total (34/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GAGATAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGCGGCATTA > NC_000913/1764640‑1764925 | gagaTAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGc < 2:1157537/151‑1 (MQ=255) agaTAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCt > 2:676408/1‑151 (MQ=255) agaTAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCt < 1:347568/151‑1 (MQ=255) aTAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTa > 1:729928/1‑150 (MQ=255) aTAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTa > 1:691554/1‑150 (MQ=255) ggTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑ccc < 2:416568/151‑1 (MQ=255) gTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑Cccg > 1:1215177/1‑151 (MQ=255) aaaaaaGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑Cccgcc > 2:270996/1‑151 (MQ=255) aaaaaaGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑Cccgcc > 2:989231/1‑151 (MQ=255) aaaaGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGt > 1:455433/1‑151 (MQ=255) aaaGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGtt > 2:456649/1‑151 (MQ=255) aaaGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGtt > 1:1118425/1‑151 (MQ=255) aaGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGttt > 2:867558/1‑151 (MQ=255) taaaaaaaaaaaaaACCCTTTAATTTTGTCCGACAAGGGTTTAAGGT‑TTTCCCCCCCATCGGGCGTTTATCCCCGGCCCTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCAAAAAA‑AATAATCTCAAAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTa < 1:384986/139‑1 (MQ=255) aaaaaaaaaaaaACCC‑TAAATTCTGGGCAACACA‑GTTTAAGGGTTTTCTCCCCCCCCCGGCGCTTATCCCCGCCACTCTCAGTGTTTTAGCTTTTGAAGGGGCAATAAA‑AATAATTTAAAAAAGCAAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACt < 1:1057727/147‑1 (MQ=255) aaaaaTAAAAAACCCC‑TGAAGTCTTGGCAACACGGGCTAAGGGT‑TTTCCCCCCCACCCGGCGTTTATCCCCGGCACTCTAAGTGGCTTAGCTTTTGAGGGGGCAAAAAA‑AAAAATCTAAAAAAGAAAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAAc < 1:412449/146‑1 (MQ=255) aaaTAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCg > 2:1256494/1‑150 (MQ=255) aaaTAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCg > 1:909929/1‑150 (MQ=255) aaaTAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCg > 1:10937/1‑150 (MQ=255) acccc‑TAAAGTGTGGGCGAAACAGGCTGAAGGT‑TTTTTACCCCTCCCGGCTATTATCCCCGTCACTCTAGTTGGTTTAGCTATAGAGGGACAGATAAA‑AATAA‑CCAAAAAAGGTAACCCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGta < 1:788395/146‑1 (MQ=255) aaCCCTTTAAGTCTGTGCGCCACAGGTTTAAGGT‑TTTCCACCCCACCGGCCGTTTACCTCCGGCTCTCGCAGTGGTTTAGCTTTTGAAGGGGAAAAAAA‑AATAATTTAAAAAAGCAAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGtatt < 1:51201/151‑1 (MQ=255) aaCCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGtatt > 1:202544/1‑150 (MQ=255) ccc‑TTAGGTCTGTCCAACACAGGTTTAAGGG‑TTTCTCCCCCCCCCGGCCTTTACCTCGGGCACTCTCAGTGGGTTATCTCTGGAAGGGGGGAAAAA‑AAAAATCTAAAAAGGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTattatt < 2:1166843/151‑1 (MQ=255) aaGTCTGGGCGACAAAGGTTAAGGGG‑TTTCTACCCCCCCCGGCCTTTACCTCCGCCACTCTCGGTGGTTTAGCTTTGGAGGGGGTAAAAAA‑AATAATATAAAAAAGAAAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTg < 1:1236726/150‑1 (MQ=255) aGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGa > 2:277051/1‑150 (MQ=255) tCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAAc > 1:1071979/1‑150 (MQ=255) cTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACa > 2:1243008/1‑150 (MQ=255) gtgGGACACGGGCTTGAGGG‑TTTCTACGCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCACTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATCAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACACAATGCGATTAGTATTATTTTTGAACAat > 1:1099278/1‑150 (MQ=255) tgCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAatat > 1:773427/1‑151 (MQ=255) cGACACAGGCTTAAGGG‑GTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATc > 1:322524/1‑150 (MQ=255) acccaGGCTAAAGGT‑TTTCTCCCCCACCCGGCGCTTACCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCCCTAGAAGGGGCGAAAAA‑AAAAATCTAATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAat < 2:191161/142‑1 (MQ=255) cacaGGTTTAGGGT‑TTTCTCCCCCCCCCGGCGTTTATCCCCGCCACTCTCAGTGGTTTGCTTTTTGAAGGGGCAATAAA‑AATAATCTAAAAAAGCTAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCa < 2:225214/148‑1 (MQ=255) actggctaagagttttCTCCCCCACCCGCCGTTTTTCTCCCGCTCCTGCATTGTCTTAGCT‑TTTAAGGGGAGAAAAGAAAAAATTTTAAAAACTAAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGc < 1:73753/137‑1 (MQ=255) ggtttAGGGT‑TTTCTCCCCCACCCGGCGTTTACCCCCGGCCCTCTCAGTGGTTTAGCTCTGGAGGGGGCAAAAAA‑AAAAATCTCAAAAACCAAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTa < 2:1237089/148‑1 (MQ=255) ggCTTAAGGG‑TTTCCCCCCCACCCGGCGCTTATCTCCGGCCCACCAAGTGGTTTATCTCTTGAAGGGGCAATAAA‑AAAAATCTAAAAAAGCAAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGt < 2:164420/150‑1 (MQ=255) aggtttttcccccccACCCGCCGCTTTTCCCCGCCCTTCAAAGTGGCTCAGCTCTAGAGGGGGCAAAAAA‑AATAATCTAAAAAAGCAAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATaa < 1:541619/140‑1 (MQ=255) gg‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGc > 1:281433/1‑150 (MQ=255) g‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGc > 1:1046994/1‑149 (MQ=255) tttCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGt > 2:383599/1‑151 (MQ=255) ttCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTGAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGt > 2:299198/1‑150 (MQ=255) cccccccACCGGGCGCTTATCCCCGGCACTCTCAGTGGTTTAGCTCTTGAGGGGGCAAAAAA‑AAAAATCTAAAAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTa < 2:870968/146‑1 (MQ=255) cTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTAtt > 2:1048290/1‑151 (MQ=255) aCCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTa > 2:10930/1‑150 (MQ=255) ccccATCCGGCGTTTATCCCCGCCCCTCTCGGTGGTTTAGCTCTTGAAGGGGCAAAAAA‑AAAATTCTAAAAAAGCTAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTAt < 2:1009327/147‑1 (MQ=255) cccATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTa > 1:870034/1‑148 (MQ=255) ccgggcctttATCCCCGCCACTCTAAGTGGTTTAGTTTTAGAAGGGGGAAAAAA‑AAAAATCTAAAAAAGCAAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGt < 1:448004/143‑1 (MQ=255) ccGGCGCTTATCTCCGGCCCTCTCAGGGGTTTAGTTCTTGAAGGGGCAATAAA‑AATAATCTCAAAAAGCTAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTc < 2:137293/151‑1 (MQ=255) ccGGCGCTTATCCCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAGGGGGCGATAAA‑AATAATCTAAAAAAGCAAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGt < 2:381959/150‑1 (MQ=255) gcgtTTATCCCCGGCACTCACAGTGGTTTAGCTTTTGAGGGGGCAATAAG‑AATAATCTCAAAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCAt < 1:952247/150‑1 (MQ=255) gcTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCg > 2:90531/1‑150 (MQ=255) ttATCCCCGGCCCTCTCAGTGGTTTAGCTCTTGAAGGGGCGAAAAA‑AAAAATCTAAAAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGaa < 2:820002/150‑1 (MQ=255) ccgcccctctctGTGGTTTAGTTTTTGAAGGGGCAATAAA‑AATAATCACAAAAACAAAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTg < 1:426133/142‑1 (MQ=255) gccACTCTCGGTGGTTTAGTTCTGGAGGGGGCAAAAAA‑AAAAATCCAAAAAAGATAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTg < 2:1006668/144‑1 (MQ=255) aGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATc > 1:468110/1‑151 (MQ=255) gTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATcc > 2:1056396/1‑151 (MQ=255) tGGTTTAGCTTTTGAGGGGGCGAAAAA‑AAAAATCTAAAAAAGCTAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGtt < 1:1134064/145‑1 (MQ=255) ttatctttggagggggCAAAAAA‑AATAATTCAAAAAAGCAAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGtt < 1:551546/129‑1 (MQ=255) tgacctctTGAGGGGGCAAAAAA‑AAAAATCTAAAAACGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATc < 1:1033110/141‑1 (MQ=255) ttGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTgg > 1:400327/1‑151 (MQ=255) aaGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCg > 1:10435/1‑150 (MQ=255) aaGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCg > 1:731725/1‑150 (MQ=255) ggggCGATAAA‑AATAATCAAAAAAAGCAAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGc < 1:480035/147‑1 (MQ=255) gggCGAAAAA‑AATAATCTAATAAAGCAAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACt < 2:1040767/151‑1 (MQ=255) ggtgaaaaG‑AATAACATCAAAAGTCAAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACtt < 1:848177/145‑1 (MQ=255) ggaaaaaaaaataatCAAAAAAATCAAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACtt < 1:1181771/142‑1 (MQ=255) aTAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGCgg > 1:605888/1‑151 (MQ=255) aaaaaaataatCTCATAAAGCTAC‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGCgg < 2:513248/146‑1 (MQ=255) aaaaaaataatCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGc < 2:647737/144‑1 (MQ=255) aataatCTAAAAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGCGGCATTa < 2:1241217/151‑1 (MQ=255) | GAGATAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCC‑TTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAG‑AATAATCTCATAAAGCTAA‑CCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCAGGCGGTAGATAAGCAGTATTAAGAAGGTCATCGAACCTGGACGGAGGTTAATCCAGGTCGATTTGGCGAACTTGCGGCATTA > NC_000913/1764640‑1764925 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |