Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,040,032 | T→G | L246R (CTG→CGG) | cbdB → | cytochrome bd‑II oxidase, subunit II |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,040,032 | 0 | T | G | 98.5% | 215.4 / ‑3.7 | 66 | L246R (CTG→CGG) | cbdB | cytochrome bd‑II oxidase, subunit II |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (31/34); total (32/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.85e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.28e-01 |
ATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATC > NC_000913/1039885‑1040179 | aTCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACggg > 2:356968/1‑150 (MQ=255) tGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGGTCGG‑ATTTATGGCTTTGTACTGCTCGCCCCGGATGCCAACGGTCGTTCCAATTCGGTAATGAAACgggggg > 1:170906/1‑150 (MQ=255) gCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCa < 2:299362/151‑1 (MQ=255) cacaGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCt < 1:87218/151‑1 (MQ=255) tGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGGTACTGGCTGG‑GGGTCGGGATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGGTAATGAAACGGGGGGCCGTGCTACCTgg > 1:268049/1‑151 (MQ=255) cGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGACGGTATTGATGGGTTTATACTGCTCCCCCAGGATGCTAAAGGTCCTTCCAATCCGTTAAAGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTgggg > 2:1133957/1‑148 (MQ=255) aCCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGG‑GGGGCGGCATTGATGGCTTTGTACTGCTCGGCCAGGATGCTAACGGGCCCTCCCATCCGTTAATGAAACGGGGGGGAGGGCTACCCGGGGCCt > 2:1075108/1‑151 (MQ=255) ccAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTg < 1:900528/151‑1 (MQ=255) aCGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATg < 2:245315/151‑1 (MQ=255) cgcgCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATg < 2:481815/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGaa < 1:913453/151‑1 (MQ=255) gcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTAACTGGTGGCTGGATGaat > 2:1022/1‑150 (MQ=255) cACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGGATTGATGGCTTTTTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAAAGGGGGGCAGTGCTACCTGGGGCCTGGATGaataat > 1:820638/1‑149 (MQ=255) cTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGGATTGATGGCTTTTTTCTGCTCGCCCCGGATGCTAACGGTCCTTTCAATCCGTTAATGAAACGGGGGGCAGGGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAAtttt > 1:147829/1‑150 (MQ=255) tGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCCGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGGAGTGGTACCTGGTGCCTGGATGAAAAAtttt > 2:942773/1‑149 (MQ=255) tGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTTCTGGGTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAAGGTGCTAATGGTCCTTCCTATCCGTTAATGAAACGGGGGGCAGTGCTACCTGGGGCCTGGATGAAAAATTTTGTCggg > 2:306959/1‑147 (MQ=255) gATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCg < 2:808078/151‑1 (MQ=255) gATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCg > 2:140392/1‑151 (MQ=255) gATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCg < 1:1009402/151‑1 (MQ=255) aTGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGA‑GGGGCGGTATTGATGGGCTTGTACTGCTCGCCCCGGATGCTTACGGTTCTTCCAATTCGTTAATGTAAAGGGTGGCAGGGCGAACGGGGGCCGGGAGGAATCATTTTGTCGGGtt > 1:83468/1‑148 (MQ=255) gtgCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGtt < 1:111695/151‑1 (MQ=255) cTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGGGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGtttt > 1:1222501/1‑150 (MQ=255) cTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGGCGGTATTGATGGCTTTTTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTTATGAAACGGGGGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGtttt > 1:1147583/1‑150 (MQ=255) tttttGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTTTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGtttt > 2:953045/1‑149 (MQ=255) ttttGCTGGCGGGTTACTGGTTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTtg < 2:1291041/149‑1 (MQ=255) tttGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTtgtg < 2:609739/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTgg < 2:188654/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGGGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGa > 2:978158/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGGATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAAAGGGGGGCAGTGCTACCTGGGGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTgg > 1:323400/1‑148 (MQ=255) cGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTccc > 2:293401/1‑151 (MQ=255) gggTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCg > 1:1298568/1‑151 (MQ=255) gggTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCg > 1:1180298/1‑151 (MQ=255) ggTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCgc < 2:540689/151‑1 (MQ=255) aCTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCgctgct > 1:608897/1‑151 (MQ=255) aCTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCgctg < 1:198376/149‑1 (MQ=255) gt‑gGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTTTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGAtt < 1:806155/150‑1 (MQ=255) ggTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGAttcttc > 2:164810/1‑151 (MQ=255) ggTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGAttcttc > 2:1234857/1‑151 (MQ=255) gTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATtcttct < 1:621092/151‑1 (MQ=255) gTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATtcttct < 1:1034179/151‑1 (MQ=255) cGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGc > 2:1212058/1‑151 (MQ=255) gTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGccc > 1:834684/1‑151 (MQ=255) aTTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCAt < 1:1278958/151‑1 (MQ=255) ggCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTg > 1:1082523/1‑150 (MQ=255) aCTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATg < 2:251920/151‑1 (MQ=255) cGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGa < 2:1274406/149‑1 (MQ=255) cGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGAt < 1:67577/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGAttt > 1:784880/1‑151 (MQ=255) cccAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGAttt < 1:499329/150‑1 (MQ=255) taaGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGAttt > 1:250754/3‑149 (MQ=255) cAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATc > 2:48465/1‑151 (MQ=255) gCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGt < 1:502473/150‑1 (MQ=255) aaCGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGc < 1:586161/150‑1 (MQ=255) aCGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGccc < 2:1280281/151‑1 (MQ=255) gTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCggg < 2:1291643/151‑1 (MQ=255) ttCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTgg > 1:557950/1‑151 (MQ=255) tCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTgg < 2:893940/150‑1 (MQ=255) cAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTgggg > 2:146570/1‑150 (MQ=255) aaTCCCTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGCTCGCCCGGGTTggg < 1:377408/148‑1 (MQ=255) ccGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGAtttt > 2:769220/1‑151 (MQ=255) ccGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGAttt < 2:1230218/150‑1 (MQ=255) gTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTg > 1:133861/1‑151 (MQ=255) aaTGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTTTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGAt < 1:276670/150‑1 (MQ=255) aaTGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATg < 1:1242899/151‑1 (MQ=255) aTGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATgg < 1:493870/151‑1 (MQ=255) tGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATg < 1:513296/149‑1 (MQ=255) aaaCGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGcat < 1:690536/151‑1 (MQ=255) aaCGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGcatc > 2:875607/1‑151 (MQ=255) | ATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGT‑GGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATC > NC_000913/1039885‑1040179 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |