Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,691,406 | T→G | D401A (GAT→GCT) | bcsB ← | regulator of cellulose synthase, cyclic di‑GMP binding |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,691,406 | 0 | T | G | 98.7% | 276.1 / ‑4.2 | 74 | D401A (GAT→GCT) | bcsB | regulator of cellulose synthase, cyclic di‑GMP binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (43/30); total (44/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.39e-01 |
CCTCCTGTTTGCTGCTCAGGTTGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGATCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGTACGGCTTACGCGG > NC_000913/3691263‑3691548 | cctcctGTTTGCTGCTCAGGTTGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCcggcgg < 2:923012/151‑1 (MQ=255) cctcctGTTTGCTGCTCAGGTTGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCcggcgg > 1:393979/1‑151 (MQ=255) cctcctGTTTGCTGCTCAGGTTGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCcggcgg > 2:427066/1‑151 (MQ=255) ctcctGTTTGCTGCTCAGGGTGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCTTCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCggcggc > 1:10537/1‑151 (MQ=255) gTTTGCTGCTCAGGTTGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAgg < 1:262755/149‑1 (MQ=255) tgctgcTCAGGTTGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTa < 1:564951/150‑1 (MQ=255) gctgctCAGGTTGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAg < 2:670646/150‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGt < 2:188837/151‑1 (MQ=255) ggTTGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGtt < 1:835307/151‑1 (MQ=255) tGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAAt > 1:12458/1‑151 (MQ=255) tGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAAt > 2:277261/1‑151 (MQ=255) aaGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCg > 2:1193909/1‑151 (MQ=255) aGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATACCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCgc > 1:763137/1‑151 (MQ=255) cAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCTGCGGCATGGGGTTGTGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCCCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGCAACGCTAATCGCTGCTgg > 1:1176037/1‑150 (MQ=255) cAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGc > 1:1213421/1‑151 (MQ=255) aGGAACTGGTTATTCAGGCCGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGctgctg > 1:1199871/1‑148 (MQ=255) aCTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAg < 2:1208545/151‑1 (MQ=255) tGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGAc > 2:1263270/1‑151 (MQ=255) tGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGAc > 2:1029522/1‑151 (MQ=255) ggTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGAcc < 1:620406/151‑1 (MQ=255) gTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCg < 2:1086663/151‑1 (MQ=255) aTTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTg > 2:1153012/1‑151 (MQ=255) ttCAGCCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCAACGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGAGCATCAGGCAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGAGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCt > 1:1209424/1‑149 (MQ=255) tCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTgg < 2:850991/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGAt < 1:992117/151‑1 (MQ=255) cTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCCCCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTgg > 1:198878/1‑145 (MQ=255) tGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTa > 1:635957/1‑150 (MQ=255) tGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTa > 2:1070015/1‑150 (MQ=255) tGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTa > 2:650335/1‑150 (MQ=255) gATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTa < 2:229370/149‑1 (MQ=255) tccGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGttcttc > 1:1069121/1‑151 (MQ=255) gcgAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAAATGTTCTTCAt > 1:631116/1‑150 (MQ=255) gAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAgg < 2:128237/151‑1 (MQ=255) aCTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTACCTGTTCGTCATAGGt < 1:664873/150‑1 (MQ=255) gTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGtttt > 2:520695/1‑150 (MQ=255) gTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGtttt < 1:1032936/150‑1 (MQ=255) cTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTc > 1:217067/1‑149 (MQ=255) ttCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAg < 2:1162588/149‑1 (MQ=255) tCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGtt < 2:732889/150‑1 (MQ=255) ggcATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAAtg < 1:110009/151‑1 (MQ=255) ggcATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAAtg > 2:468255/1‑151 (MQ=255) gcATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAAtgt > 2:542655/1‑151 (MQ=255) gcATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAAtgt < 2:172068/151‑1 (MQ=255) tgtAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCgg > 1:878984/1‑151 (MQ=255) aGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACg > 2:534328/1‑151 (MQ=255) aGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACg > 1:723902/1‑151 (MQ=255) cGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGAt > 1:59861/1‑151 (MQ=255) cGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGAt < 2:735393/151‑1 (MQ=255) ggTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATc < 2:1170927/151‑1 (MQ=255) gcaattaatATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCg > 2:606520/3‑151 (MQ=255) gTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCg > 1:516224/1‑151 (MQ=255) taattaatATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCgg > 2:760965/1‑151 (MQ=255) attaatATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGgt > 1:1125152/1‑150 (MQ=255) taatATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGgtac > 1:531151/1‑150 (MQ=255) ccATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTAccc > 1:18329/1‑150 (MQ=255) ccATATCAATACCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGATCGCCAAATGCGACCGGACGATCGGTACGTAcc > 2:472907/1‑149 (MQ=255) atCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGATCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTACTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTc > 2:482135/1‑151 (MQ=255) cAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCgg < 1:795492/151‑1 (MQ=255) gCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGgcgc > 2:838852/1‑150 (MQ=255) cGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATc > 2:29911/1‑151 (MQ=255) cGGTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATc > 2:1013976/1‑151 (MQ=255) ggTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCg < 2:1035269/151‑1 (MQ=255) gTACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCTAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGt < 1:1021120/151‑1 (MQ=255) tACTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGt > 2:508736/1‑150 (MQ=255) cTGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCCGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGTAc < 1:96878/150‑1 (MQ=255) tGCGCATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGTACgg > 2:1234183/1‑151 (MQ=255) gcgcATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGTACg < 1:538978/149‑1 (MQ=255) cgcATCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGTACGGCt < 2:855676/151‑1 (MQ=255) aTCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGTACGGCTTAc > 2:35952/1‑151 (MQ=255) aTCAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGTACGGCTTAc < 1:427056/151‑1 (MQ=255) cAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGTACGGCTTAcgc < 2:393989/151‑1 (MQ=255) cAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGTACGGCTTAcgc > 1:85505/1‑151 (MQ=255) cAGGTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGTACGGCTTAcgc < 2:1130091/151‑1 (MQ=255) ggTAGAGAGCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGTACGGCTTACGCgg > 1:382741/1‑151 (MQ=255) | CCTCCTGTTTGCTGCTCAGGTTGAAGGATTGCAGGAACTGGTTATTCAGGCTGATATCCATCCGCGAACTGTCTTTCACCGGCGGCATGGTGTAGCGGTAATTAATATCCATATCAATGCCGGTACTGCGCATCAGGTAGAGATCCGGCGGCAGGTTTAGCGAAACGTTAATCGCTGCTGGCTCAAGACCGCTGGATTGTAACTGTTCTTCATAGGTTTTCAGTTCGCCAAATGTGACCGGACGATCGGTACGTACCCAGTTCGGCGCATCGTACGGCTTACGCGG > NC_000913/3691263‑3691548 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |