| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,143,217 | A→C | M230L (ATG→CTG) | frwC → | putative enzyme IIC component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,143,217 | 0 | A | C | 98.7% | 267.9 / ‑6.3 | 75 | M230L (ATG→CTG) | frwC | putative enzyme IIC component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (45/29); minor base T (0/1); total (45/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
GGTGATCATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTC > NC_000913/4143072‑4143362 | ggTGATCATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCgctggggctggg < 1:814419/150‑1 (MQ=255) aTGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCg > 2:1102413/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGCGTTCGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTg > 2:45738/1‑151 (MQ=255) aTGCTGGCGTTCGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTg > 2:231567/1‑151 (MQ=255) aTGCTGGCGTTCGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTg > 1:448501/1‑151 (MQ=255) aTGCTGGCGTTCGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGATGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTg > 1:1014900/1‑151 (MQ=255) cGTTCGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTaa < 1:1084542/151‑1 (MQ=255) cGTTCGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTa > 1:269230/1‑150 (MQ=255) gTTCGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTaa > 2:477808/1‑150 (MQ=255) tccGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGTTTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATGCCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTTTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTaaa < 1:376400/148‑1 (MQ=255) cGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAAt > 2:453912/1‑151 (MQ=255) atatGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAAttt < 2:685892/151‑1 (MQ=255) atatGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAAttt > 2:699405/1‑151 (MQ=255) tatGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTtc > 1:1011723/1‑151 (MQ=255) tGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTtctc > 1:77657/1‑151 (MQ=255) ggCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCg < 1:419494/151‑1 (MQ=255) ggCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCg < 1:1210079/151‑1 (MQ=255) cGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCa < 2:95735/151‑1 (MQ=255) ggTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGc > 1:510724/1‑149 (MQ=255) ttAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAgc < 2:1053163/150‑1 (MQ=255) tAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAgcg > 2:144578/1‑150 (MQ=255) cAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGa > 2:321728/1‑150 (MQ=255) aaacgggCCTATGGCTTCGTGCTGTTTTGCGTTCCTGGGGGTGTTCATCGCAGGGTGCACATCGCTGGTGTTGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGTTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGaa < 2:1029664/145‑1 (MQ=255) aaGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAAc > 1:102126/1‑151 (MQ=255) ccTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCa > 2:857736/1‑150 (MQ=255) tATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCaa > 1:878255/1‑149 (MQ=255) aTGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCaaa < 1:1023340/149‑1 (MQ=255) tGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGc < 2:596856/150‑1 (MQ=255) ccTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTTTTTATACCGTGGTGGCCTTCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGc < 1:707645/151‑1 (MQ=255) ccTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGc > 2:1124808/1‑151 (MQ=255) cTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGc > 1:647282/1‑150 (MQ=255) ttCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCAc > 2:1149444/1‑151 (MQ=255) aTGCTGATTTGCGTTGCTCAGGTTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTACCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACt < 2:534241/149‑1 (MQ=255) aTGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTgg < 1:351173/151‑1 (MQ=255) tGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTgg > 2:400816/1‑150 (MQ=255) gCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTg < 2:879141/151‑1 (MQ=255) cTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTg > 2:587192/1‑150 (MQ=255) gATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTTTCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGa < 2:503417/149‑1 (MQ=255) gATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATg < 1:455664/151‑1 (MQ=255) gATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATg > 2:182760/1‑151 (MQ=255) cGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCtg > 1:865072/1‑150 (MQ=255) cGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCtg > 2:1007738/1‑150 (MQ=255) cGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTACCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCtgt < 2:257620/151‑1 (MQ=255) ttGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCtgt < 1:1082607/149‑1 (MQ=255) ttGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTgtgt > 2:1039817/1‑151 (MQ=255) aGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGt > 1:234846/1‑151 (MQ=255) gggTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGtt > 2:779409/1‑151 (MQ=255) gggTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGtt < 1:340301/151‑1 (MQ=255) tataCCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGa > 2:1181489/1‑149 (MQ=255) tataCCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGa > 1:1128750/1‑149 (MQ=255) ataCCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAgg > 2:533700/1‑151 (MQ=255) ataCCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAg < 2:462516/150‑1 (MQ=255) aCCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAgg > 2:916258/1‑149 (MQ=255) ccGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGc > 2:878219/1‑151 (MQ=255) gtggtgGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCg > 2:866491/1‑150 (MQ=255) gCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCtt < 2:1083205/151‑1 (MQ=255) ccATCGCTGCCGTGGGTTTTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCttt < 1:147630/151‑1 (MQ=255) ccATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCttt < 1:788535/151‑1 (MQ=255) cATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTc < 2:1227197/151‑1 (MQ=255) cATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTc < 2:843031/151‑1 (MQ=255) cGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTcgc < 2:277183/150‑1 (MQ=255) cTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTcgccgc > 2:366703/1‑151 (MQ=255) cTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTcgccgc > 1:150965/1‑151 (MQ=255) 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tATTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCg > 2:186515/1‑151 (MQ=255) aTTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATcc < 1:321929/149‑1 (MQ=255) aTTTGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGc > 1:7801/1‑151 (MQ=255) ttGTATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCt < 1:505548/150‑1 (MQ=255) tATCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCg > 2:25353/1‑150 (MQ=255) aTCCCGCCGCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCgtg > 1:1084083/1‑151 (MQ=255) ccgccgCTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTc > 2:852796/1‑150 (MQ=255) gccgcTGGGGCTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCAtt > 1:526779/1‑151 (MQ=255) gctggggctgggGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCTGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCAttcct < 1:744247/151‑1 (MQ=255) gctggggctgggGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCAttcct > 1:777367/1‑151 (MQ=255) ggggctggggctGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCAttccttc < 1:453900/150‑1 (MQ=255) | GGTGATCATGGGTCTGATGCTGGCGTTCGATATGGGCGGTCCGGTTAACAAAGTGGCCTATGCCTTCATGCTGATTTGCGTTGCTCAGGGTGTTTATACCGTGGTGGCCATCGCTGCCGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTC > NC_000913/4143072‑4143362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |