Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,321,045 | A→C | L68* (TTA→TGA) | phnH ← | ribophosphonate triphosphate synthase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,321,045 | 0 | A | C | 98.6% | 273.3 / ‑4.2 | 71 | L68* (TTA→TGA) | phnH | ribophosphonate triphosphate synthase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (34/35); total (35/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.56e-01 |
CGGCGCAACGGCGGTGCCGGTGGAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTAATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGAC > NC_000913/4320897‑4321192 | cGGCGCAACGGCGGTGCCGGTGGAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCAt < 1:725307/151‑1 (MQ=255) ggCGCAACGGCGGTGCCGGGGGAAAGGGCGTTGAGCTGTTTGCTGGAAAACGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGGCGCCTGTTCCGGCTGGCTGAACAGCGGCGCGGTGGTATGAAAAAGCCGGCTCTGGTTGGCGGTATCGGTCTTTTAt > 1:1197494/1‑150 (MQ=255) gcgcAACGGCGGTGCCGGTGGAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATgg < 2:653050/151‑1 (MQ=255) aCGGCGGGGCCGGTGGAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGt < 1:499537/149‑1 (MQ=255) cggTGCCGGTGGAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGaa > 1:159531/1‑149 (MQ=255) ggTGCCGGTGGAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGc > 1:56982/1‑151 (MQ=255) ccGGTGGAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCcaca < 1:538579/151‑1 (MQ=255) ccGGTGGAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCcac > 1:1125316/1‑150 (MQ=255) gTGGAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCg > 2:1294306/1‑151 (MQ=255) gTGGAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCg > 1:484729/1‑151 (MQ=255) ggAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCgg < 2:750226/150‑1 (MQ=255) ggAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGc < 2:580490/151‑1 (MQ=255) aaaGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCgt > 2:1168086/1‑151 (MQ=255) aaGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCgtg < 2:965846/151‑1 (MQ=255) gggCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTc < 1:364285/151‑1 (MQ=255) cGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGtt > 1:1004142/1‑151 (MQ=255) ttGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTAt > 1:294981/1‑151 (MQ=255) tGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTAt < 1:331208/150‑1 (MQ=255) aGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCgg > 1:120982/1‑151 (MQ=255) tGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGcc > 1:272135/1‑150 (MQ=255) tGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGcc > 1:500189/1‑150 (MQ=255) tGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGcc > 2:843098/1‑150 (MQ=255) gTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCa < 1:421507/150‑1 (MQ=255) gCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTc > 2:187708/1‑151 (MQ=255) gCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGCCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAAAGCAGGCTCTGGTTGACGAAATCGTTATTTCATGGGGGAGAAAGCCACACCGGCGGGTCGTTATCGGCCAGCGt > 2:554773/1‑150 (MQ=255) tCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCAc > 2:406126/1‑151 (MQ=255) cGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACg < 2:290127/151‑1 (MQ=255) gCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGc < 2:692766/134‑1 (MQ=255) gCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGc > 1:692743/1‑134 (MQ=255) gCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCAc > 1:1091278/1‑149 (MQ=255) ccTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCCCTGGTTGACGTTATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGc > 2:693125/1‑150 (MQ=255) cATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCtgg < 1:191881/150‑1 (MQ=255) cATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCtg < 1:1276048/149‑1 (MQ=255) ccGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCtggtggt < 2:680705/151‑1 (MQ=255) ccGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCtggtgg < 2:572223/150‑1 (MQ=255) ccGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCtggtgg < 2:270448/150‑1 (MQ=255) cGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCtggtggtg > 2:476572/1‑151 (MQ=255) ccGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGat < 1:1206593/151‑1 (MQ=255) cGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGt < 2:470303/151‑1 (MQ=255) tCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGGGGCGATATTCAGCGGGTGCCAGc > 2:557364/1‑151 (MQ=255) cGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCcg > 2:539176/1‑151 (MQ=255) ctggctgACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCcgcg > 1:987401/1‑150 (MQ=255) gACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGa < 1:351358/149‑1 (MQ=255) gACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGa < 1:637159/149‑1 (MQ=255) aCCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCt < 1:1272524/151‑1 (MQ=255) gcggcgCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATg > 2:149293/1‑151 (MQ=255) gcgcGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAg < 2:806843/151‑1 (MQ=255) gcgcGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAg < 2:848919/151‑1 (MQ=255) gcgcGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTAATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAg < 2:190282/151‑1 (MQ=255) gcgTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGGGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCCGAtaacggg > 2:3306/1‑145 (MQ=255) cgTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGACGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGGTGAGGCGATATTCAGCGGCTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAg > 1:887442/1‑148 (MQ=255) gTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCg < 1:257993/151‑1 (MQ=255) gTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGGTTGAGCTGATGCAGGGCg < 2:632482/151‑1 (MQ=255) tATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAAt > 2:219412/1‑151 (MQ=255) aTGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATc > 2:400679/1‑151 (MQ=255) aaaaCGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACg > 2:491483/1‑151 (MQ=255) aaCGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATGTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGcc < 2:703567/151‑1 (MQ=255) aCGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGccc < 2:120059/151‑1 (MQ=255) cGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCg > 2:628984/1‑151 (MQ=255) cGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCg < 1:798523/151‑1 (MQ=255) ctGGTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGgctcgc < 2:456309/149‑1 (MQ=255) ggTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGgctcgct < 1:129254/148‑1 (MQ=255) ggTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCa < 1:204583/150‑1 (MQ=255) ggTTGACGATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCAt < 1:936647/151‑1 (MQ=255) gATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCttt < 2:816555/151‑1 (MQ=255) gATATCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCttt > 2:1249433/1‑151 (MQ=255) atatCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTa < 2:751287/151‑1 (MQ=255) atCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAAc > 1:571229/1‑151 (MQ=255) tCGTTATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAAc > 2:40472/1‑150 (MQ=255) tATTTCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGcg > 2:1170589/1‑151 (MQ=255) tttCATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGcgac > 1:1112160/1‑151 (MQ=255) | CGGCGCAACGGCGGTGCCGGTGGAAAGGGCGTTGAGCTGTTCGCTGGAAATCGCCTCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTAATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGAC > NC_000913/4320897‑4321192 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |