Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 802,118 | 0 | A | C | 47.6% | 61.1 / 17.9 | 63 | T78P (ACC→CCC) | ybhI | putative DASS family tricarboxylate or dicarboxylate transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (22/11); new base C (0/30); total (22/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.78e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGCTGGGTCTGG > NC_000913/801977‑802268 | cTGGCGTGGGGGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCACGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCAccgcc > 2:758266/1‑150 (MQ=255) gCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTAt > 1:135790/1‑151 (MQ=255) tGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTa > 1:881928/1‑150 (MQ=255) tGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCgg > 2:307805/1‑151 (MQ=255) tttttGTTATTTCCCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTCCCCGGAC‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAAGGGGGGTGGTCGGTAATTTACCCGACGGTGCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGtt < 2:54790/150‑1 (MQ=255) tttgGGTATTTCCCTGGCGGCCTTTGTGGGGCGGGTTATCAA‑CCTTTCCCCGAACCCGGTCTTATTGTTAATGGCCTTTGCTGCCTCAATGGTGGGGGTCGGTAATTTACCCGCCGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGtt < 1:234232/149‑1 (MQ=255) tggtttttccgggggggcAATTGTGGGCGTGTTAACCAAGCTTTTCCCGGAA‑CTTTTCGTCTTTTTAATTCCCGTTGCTCCCTCAATGGTGTTGGTGGTTAACTTAGCCGACGGGGCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTActc < 2:917679/135‑1 (MQ=255) ggttttttCCCGGGGGGCCTTTGGGGGGCTTGTTATAAGGCCTTCCCCGGAC‑CTTTTCGTACTTTTAATTGCCGTTCCTCCCTAATGGGTGGTGGTGGGTACTTTTCCCGACGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTActc < 2:1171811/145‑1 (MQ=255) tATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTc > 1:115864/1‑150 (MQ=255) ttcccgggcggcCATTGTGGGGCTGTTTAACAAGCTTTCCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATGGCCGTTGCTGCCTAAATGGGGGGGGTGGGTAACTTACCCGACGGTGCGTTAAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAgg < 1:155165/144‑1 (MQ=255) ttACCTGGCGGCGTTTGGGGGGTTGTTTATCAAGCTTTTCCCGGAC‑CCTTTGGTATTGTAAATTGCTGTTGCTGCCTAAAGGGTGGTGGTCGTTACCTTACCGGACGTTGCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAgg < 1:582837/150‑1 (MQ=255) ccgggcggcCTTTGTGGGGCTGGTTATCAAGCTTTCCCCGGAC‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTCCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAATTTACCCGACGGGGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTa < 1:1116233/146‑1 (MQ=255) ccTGGCGCCCTTTTGGGGGCTGTTTAACAAGCTTTTCCGGAAC‑CCTGTCGTCTTGTTAATTGCGTTTGCTGCCCCAATGGTGGTGTTCGGTAATTTACCCGCCGGTGTTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGt < 1:574692/148‑1 (MQ=255) tGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTaccac > 2:882617/1‑151 (MQ=255) ggcggcCTTTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAA‑CCTTTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTAAAGGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTaccac < 1:1048852/150‑1 (MQ=255) gtgGGGCTGGTTATCAAGCTTTCCCCGGAC‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAATTTACCCGACGGTGCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGgt < 1:256230/149‑1 (MQ=255) gtgGGGCTGGTTATAAACCTTTTCCCGGAC‑CCTGTCTTATTTTTATTTGCCTTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTACCTTACCCGACGGTGCTTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGgtgt < 1:996349/151‑1 (MQ=255) tgGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGtt > 2:242876/1‑151 (MQ=255) ggggTTGGTTATCAAGCTTTCCCCGGAA‑CTTGTCTTATTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTAAATGGTGGTGGTCGGTAATTTATCCGACGGTGCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGtt < 1:135459/150‑1 (MQ=255) tGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGACGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtctc > 2:795645/1‑148 (MQ=255) aTCAAGCCTTTCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGttt > 2:399578/1‑150 (MQ=255) atgcttttCCGAGAT‑CCTGTCGTATTGTTAATTACCTTCGCTGCCACAATGGTGGTGGTGGAAATCTTAGCCGTGGGTGCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTAcc < 2:268800/145‑1 (MQ=255) aatccTTTCCCGAAA‑CCGGCCGTTTTTTAAAGCGCCGTTGCGGCCTCATTGGGGTGGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCTTTAAAAC‑CCTCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGttt < 1:117902/144‑1 (MQ=255) ccTTTCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTa > 2:133098/1‑150 (MQ=255) ttccccGGAA‑CCTTTCGTTCTTTAAATTGCCTTTGCTCCCTCAATGGTGGTGGTGGGAAACTTACCCGCCGGTGCTTTAAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCtt < 1:576432/144‑1 (MQ=255) tCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAgcgc > 1:385241/1‑151 (MQ=255) cccGGAC‑CTTGTCGTACTTTTAATTCCCTTTGCTCCCTAAAGGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGGGTTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCtt < 2:219045/144‑1 (MQ=255) cccGGAC‑CCTGTGGTACTTTTATTTGCCTTTGCCGCCTCAAGGGTGGTGGTGGGTATTTTATCGGCCGGTGTTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAgc < 2:1058433/148‑1 (MQ=255) ccGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGcgccg > 2:584112/1‑151 (MQ=255) acccTTTCGTACTGTTATTGGCCTTTGCTGCCACAATGGGGGTGGTCGGTATCTTATCCGAGGGTCTTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCa < 1:539995/147‑1 (MQ=255) cTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtgt > 1:849749/1‑151 (MQ=255) gTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGacc > 1:501278/1‑150 (MQ=255) tACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGaccac > 1:726645/1‑151 (MQ=255) actttaatttGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAATTAACCCGCCGGTGCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGaccac < 1:509861/142‑1 (MQ=255) tGTAAATGGCCGTTGCGCCCTAAAGGGGGGGGTGCGGTAACTTTCCCCACGTTGCTTTAAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGacca < 2:236949/147‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTa > 2:968003/1‑150 (MQ=255) ccGTTGCTGCCTCAAGGGTGGGGGTCGTTAACTTACCCGACGGTGCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGt < 1:290163/149‑1 (MQ=255) ttGCTCCCTCAAGGGGGTTGGTCGGTAATTTATCCGGGGGTGCTTTAAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAAc < 2:583930/150‑1 (MQ=255) tgctgcCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGt > 1:241880/1‑151 (MQ=255) tgcCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTAtt > 1:474396/1‑151 (MQ=255) gcCTAAAGGGGGGTGTTGGTTAACTTATCCGACGGTGCGTTAAAAA‑CCTCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGTCCACCGGTTTAGGTAAAc < 1:627812/145‑1 (MQ=255) ccTAAATGGTGGTGGTGGGTACTTTCTCCGAGGGGGCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTAtt < 2:387393/149‑1 (MQ=255) ctaattggtgggggTGGTTAACTTACCCGAGGGTGCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGt < 1:897521/140‑1 (MQ=255) aaTGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTAt > 2:627420/1‑151 (MQ=255) aaTGGTGGTGGTCGGTAACTTACCCGACGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTa < 1:201588/150‑1 (MQ=255) ggtggtggtCGGTATCTTACCCGACGGTGCGTTAAAAC‑CCGCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATct < 1:882677/150‑1 (MQ=255) gggggtggtCGTTATCTTACCCGACGGTGGTTTAAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctg < 2:1154830/148‑1 (MQ=255) ggttggtttcTTACCCGAGGGTGGTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgc < 2:1105178/137‑1 (MQ=255) gtgggtattttACCCGGCGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTg < 1:584140/142‑1 (MQ=255) cGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGt > 2:862028/1‑151 (MQ=255) aaCTTTCCCGTCGGTGCTTAAAAAC‑CCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGAt < 2:1177818/143‑1 (MQ=255) ttACCCGACGGTGTTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGt < 1:339756/144‑1 (MQ=255) ttacccgcgggtgttttAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATc < 2:209215/136‑1 (MQ=255) acccGACGGTGCGTTAAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCgg < 1:806405/148‑1 (MQ=255) aTCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCgg > 1:114505/1‑150 (MQ=255) ccgacgtgtcGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTa < 2:137733/141‑1 (MQ=255) ccGAGGGTGTTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTaa < 2:1169137/151‑1 (MQ=255) ccGACGGTGCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGt < 2:455227/149‑1 (MQ=255) ccGACGGTGCGTTTAAAA‑CCGCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTa < 2:778510/150‑1 (MQ=255) aCGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAacac > 2:1139694/1‑151 (MQ=255) ggTGCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAAcacca < 2:447237/151‑1 (MQ=255) gctttgaaac‑CCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTaa < 1:793139/137‑1 (MQ=255) gctttAAAACCCTCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACg < 2:1168071/148‑1 (MQ=255) tttAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACg < 2:201313/147‑1 (MQ=255) aaaac‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctgggt < 2:683213/150‑1 (MQ=255) aaaa‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctgggtc > 1:394129/1‑151 (MQ=255) a‑ccaccGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctgggtctgg > 1:1055368/1‑151 (MQ=255) | CTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCCGGAA‑CCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGCTGGGTCTGG > NC_000913/801977‑802268 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |