Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,040,032 | T→G | L246R (CTG→CGG) | cbdB → | cytochrome bd‑II oxidase, subunit II |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,040,032 | 0 | T | G | 96.8% | 190.4 / ‑1.8 | 63 | L246R (CTG→CGG) | cbdB | cytochrome bd‑II oxidase, subunit II |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base G (32/28); total (33/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.80e-01 |
CATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATC > NC_000913/1039884‑1040179 | cATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACggg > 1:1180599/1‑151 (MQ=255) cTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACgggtgg > 1:484687/1‑151 (MQ=255) gCGTTCACAGCTTGCGACCAAACCCGCTGCACTCTTCGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGTCTGTGGGTCGGTATTGATGCCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACgggtg < 1:995215/148‑1 (MQ=255) gCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCa < 1:134307/151‑1 (MQ=255) gCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCa < 2:1033054/151‑1 (MQ=255) gTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGt < 1:20995/151‑1 (MQ=255) gTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGGGGCAg > 1:494560/1‑150 (MQ=255) gTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGGTACTGGCCGTGGGGTGGTATTGGTGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGTAACGGGTGGCa > 2:378341/1‑149 (MQ=255) ttCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGGTAATGGCTGTGGGGCGGTATTGGTGGCTTTTTGCTGCTCGCCCAGGGTGGTTACGGGCCCTCCAATCCGTTAATGAAAAAGGGGGCAGTg > 2:736725/1‑151 (MQ=255) tCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTg < 1:953826/150‑1 (MQ=255) aGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGGTACTGGGTGTGGGGCGGGATTGATGGCTTTGTTCTGCTCGGCCAAGATGCTAAAGGTCCTTTCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCCGTg > 1:61187/1‑146 (MQ=255) tGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTCGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGGTGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCCgg > 2:310844/1‑151 (MQ=255) ggCGCCCTAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGTCTGTGTTTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCGATCCGTTAATGAAACGGTTGGCAGTGCTACCTGGt < 2:1160779/151‑1 (MQ=255) ggCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCCGTGGGGCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCCCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAAAGGGTGGCCGGGCTACCTgg > 2:581134/1‑150 (MQ=255) cGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGGATTTATGGCTTTTTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTg > 1:843672/1‑150 (MQ=255) gACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGGCGGTATTGATGGGTTTGTACTGCTCGCCCCGGATGCTTACGGGTCTTCCAAACCGTTAATGAAACGGGGGGCAGTGCTACCTgg > 2:681757/1‑147 (MQ=255) aaaCGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTgg < 1:71581/150‑1 (MQ=255) gcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGaat < 2:1069914/150‑1 (MQ=255) tGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGGGGCAGGGCTACCTGGGGCCTGGGTGaataat > 1:865751/1‑151 (MQ=255) tGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGGATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCCGGGTGCTAACGGTCCTTCCAATCCGGTAATGAAACGGGGGGCAGTGCTACCTGGGGCCTGGATGgataa > 2:662126/1‑150 (MQ=255) gCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAAtt < 1:94049/151‑1 (MQ=255) aCTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGGATTGATGGCTTTGTTCTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGGCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGGGCTACCTGGGGCCTGGGTGAATAAtttt > 2:342817/1‑151 (MQ=255) aCTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGGTACTGGCTGTGGGTCGGGATTGGTGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGGTGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGGAACGGGTGGCAGTGCTACCTTGGGCCTGGGTTAATTAtttt > 2:370117/1‑151 (MQ=255) cTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAAtttt > 1:507539/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGGCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGGTAATGAAACGGGGGGCAGGGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAAtttt > 2:850867/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGATACTGGCTGTGGGTCGGGATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGGGGCAGTGCTACCTTGTGCCTGGATGAATAAtttt > 2:103404/1‑150 (MQ=255) gTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCCGGGTGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGGAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGGGCCTGGATGAATAAtttt > 2:107609/1‑148 (MQ=255) gTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTc < 1:368919/151‑1 (MQ=255) gTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGGATTGATTGCTTTTTACTTCTCGCCCAGGGTGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTTATTAAAAGGGGGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGt > 2:851030/1‑150 (MQ=255) tGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCg < 1:1161875/150‑1 (MQ=255) ggTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGa < 2:139102/150‑1 (MQ=255) tGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGGATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCCGTGGTACCTGGGGCCTTGATGAATAATTTTGt > 2:978021/1‑145 (MQ=255) aTGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCg < 1:974916/150‑1 (MQ=255) aTGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGc < 2:109915/151‑1 (MQ=255) gtgCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCg < 1:572378/149‑1 (MQ=255) ttttGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTtg < 2:1045383/149‑1 (MQ=255) ggCGGGTTACTGGCTGTTGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAATCGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCt < 2:660022/149‑1 (MQ=255) gTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCgct < 2:1054955/151‑1 (MQ=255) tACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCgctg < 2:296500/150‑1 (MQ=255) tACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCgctg < 2:873891/150‑1 (MQ=255) aCTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCgctgct > 1:104878/1‑151 (MQ=255) ggCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGctgctg < 1:492723/149‑1 (MQ=255) cGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTg < 1:1142400/150‑1 (MQ=255) cGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGc < 1:209574/151‑1 (MQ=255) ggTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGcc > 2:149754/1‑151 (MQ=255) ttGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCAtt > 1:270814/1‑151 (MQ=255) gATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTg < 1:636439/150‑1 (MQ=255) tGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGt < 1:239688/150‑1 (MQ=255) tGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTg > 2:469294/1‑151 (MQ=255) gTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGa < 2:527990/151‑1 (MQ=255) tACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGAt > 2:907264/1‑151 (MQ=255) aCTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGAt < 1:423138/150‑1 (MQ=255) cTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGGGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGATTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGGGATGGCg > 1:884843/1‑150 (MQ=255) cGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGAtt > 1:3943/1‑151 (MQ=255) cGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGAt < 2:1166340/150‑1 (MQ=255) aGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCg > 2:753333/1‑151 (MQ=255) ggATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGt > 1:656886/1‑151 (MQ=255) ccAATCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTggg < 1:1143905/150‑1 (MQ=255) aTCCGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGAtt > 1:929503/1‑151 (MQ=255) cGTTAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGAttttt < 1:75915/151‑1 (MQ=255) ttAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGAttttt > 1:400336/1‑149 (MQ=255) tAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGa < 1:378358/150‑1 (MQ=255) tAATGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGAt > 2:1170151/1‑151 (MQ=255) aaTGAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCACGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATg > 1:1140512/1‑151 (MQ=255) gAAACGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGc > 1:322930/1‑150 (MQ=255) aaCGGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGcatc > 1:633612/1‑151 (MQ=255) | CATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATC > NC_000913/1039884‑1040179 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |