Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,924,700 | T→G | intergenic (‑587/+35) | yqcC ← / ← syd | DUF446 family protein/SecY‑interacting protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,924,700 | 0 | T | G | 99.0% | 377.5 / ‑4.4 | 99 | intergenic (‑587/+35) | yqcC/syd | DUF446 family protein/SecY‑interacting protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (64/34); total (65/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.97e-01 |
ACAAGGCGCTTACAGACAATGCCTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGTAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACTTCACCGGAGAGATTACACAC > NC_000913/2924556‑2924845 | aCAAGGCGCTTACAGACAATGCCTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAag > 1:690416/1‑148 (MQ=255) cgcTTACAGACAATGCCTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGAtctctc < 1:1071422/151‑1 (MQ=255) tACAGACAATGCCTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACAGTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTcac < 2:1007639/149‑1 (MQ=255) aCAATGCCTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAAcc > 2:512375/1‑148 (MQ=255) aCAATGCCTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGa < 1:121678/151‑1 (MQ=255) cAATGCCTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACGAGAt < 2:8926/151‑1 (MQ=255) aaTGCCTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATg < 1:1070298/151‑1 (MQ=255) aTGCCTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATgg < 2:847928/151‑1 (MQ=255) gCCTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATgggg > 2:989586/1‑151 (MQ=255) ccTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGt < 1:890963/151‑1 (MQ=255) cTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGt > 1:816139/1‑150 (MQ=255) cTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGt > 2:257920/1‑150 (MQ=255) ttAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTAt > 2:728201/1‑151 (MQ=255) ttAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTAt > 1:683897/1‑151 (MQ=255) aaGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTAttt > 2:415900/1‑151 (MQ=255) aaTTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGAtt > 1:255830/1‑150 (MQ=255) tttCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTCATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTAc > 2:1048942/1‑150 (MQ=255) ttCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTAc > 1:607148/1‑149 (MQ=255) ttCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACa < 1:770078/150‑1 (MQ=255) tCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTAc > 2:155133/1‑148 (MQ=255) tCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATCTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTAc > 1:202718/1‑148 (MQ=255) cATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACaga < 1:898220/150‑1 (MQ=255) cATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACaga > 1:984767/1‑150 (MQ=255) tGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAgg > 1:1034767/1‑151 (MQ=255) tGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAgg > 1:931815/1‑151 (MQ=255) tGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAgg > 1:341301/1‑151 (MQ=255) gTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTaa < 2:455329/151‑1 (MQ=255) tAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGt > 2:541039/1‑151 (MQ=255) aaGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGtt < 2:569291/151‑1 (MQ=255) aaGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGtt > 1:956846/1‑151 (MQ=255) gAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGa < 1:800692/151‑1 (MQ=255) aaTTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGAt > 1:534696/1‑151 (MQ=255) aTTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGAtt > 1:48215/1‑151 (MQ=255) tAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTa < 1:481710/150‑1 (MQ=255) tAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTa > 1:609175/1‑150 (MQ=255) tAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGAATCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTa > 2:672458/1‑150 (MQ=255) aaCAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTaa < 1:482900/150‑1 (MQ=255) aaCAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAg < 1:1054070/151‑1 (MQ=255) aCAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAgg > 2:576276/1‑151 (MQ=255) cAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAgg > 1:83520/1‑150 (MQ=255) aaTCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGaa < 1:504917/151‑1 (MQ=255) aTCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAAt > 1:299282/1‑151 (MQ=255) aCATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCg > 1:1021170/1‑151 (MQ=255) aTTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGc > 1:1169605/1‑150 (MQ=255) aTTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGc > 1:589469/1‑150 (MQ=255) tttGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCaa < 2:896553/150‑1 (MQ=255) tGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCa > 1:940083/1‑147 (MQ=255) tGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGAATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCa > 2:1185075/1‑147 (MQ=255) gATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGAtt < 2:537626/151‑1 (MQ=255) gATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGAtt > 2:699290/1‑151 (MQ=255) tAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAgg > 1:355054/1‑151 (MQ=255) aaaTGAAAATACCGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACCACCAGATGGGGTATTTGGATTATAGAAGAGGCTTAAGTTGACTAAGGCATTACGCAAGATTTg > 2:660377/1‑147 (MQ=255) aaaTGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAgg < 1:1076955/150‑1 (MQ=255) aaaTGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGc > 2:912383/1‑151 (MQ=255) aaTGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCt > 1:1155329/1‑151 (MQ=255) aTGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTa < 1:699181/151‑1 (MQ=255) aaaaTAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAAt < 1:524213/151‑1 (MQ=255) aaaTAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAAt > 1:917636/1‑150 (MQ=255) aaaTAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATg > 1:533373/1‑151 (MQ=255) aTAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCg < 1:379862/151‑1 (MQ=255) atcGATTCTTATCTTTTTAAGAATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCATATGGGGAATTTGGATAACAGAAGAGGCTTAAGTTGATGAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGAGt > 2:854716/3‑150 (MQ=255) aaCGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTc > 1:386175/1‑151 (MQ=255) gATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGt < 1:541064/151‑1 (MQ=255) gATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGt < 1:730823/151‑1 (MQ=255) aTTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGtt > 1:898316/1‑151 (MQ=255) ttCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGttt > 2:1189489/1‑151 (MQ=255) tCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGttt > 2:687150/1‑150 (MQ=255) tCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGttt > 2:526820/1‑150 (MQ=255) tATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTAc < 2:568462/149‑1 (MQ=255) tATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACgt > 2:607862/1‑151 (MQ=255) aTCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACgtg > 1:301890/1‑151 (MQ=255) tCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCTGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACgtgt > 2:352922/1‑151 (MQ=255) ttttAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTcc > 2:976535/1‑151 (MQ=255) ttttAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTc < 2:83965/150‑1 (MQ=255) ttAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTccc < 2:297358/150‑1 (MQ=255) aaGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAg < 1:24063/150‑1 (MQ=255) aaGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGc < 2:876736/151‑1 (MQ=255) aGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCg < 1:368887/151‑1 (MQ=255) aGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCg > 1:153373/1‑151 (MQ=255) ttCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGtctc > 2:215985/1‑151 (MQ=255) ttCGCTTATTTCCTGGCAATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGtctc > 2:459384/1‑151 (MQ=255) tCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGTAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAACTGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTctct > 1:672115/1‑151 (MQ=255) tCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTctct > 1:20356/1‑151 (MQ=255) tCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTctct > 1:987356/1‑151 (MQ=255) cGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCtt > 1:696012/1‑151 (MQ=255) gCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCttt < 1:409366/151‑1 (MQ=255) ttATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTg > 1:1031486/1‑150 (MQ=255) aTTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGcac > 1:394672/1‑151 (MQ=255) ccTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACtt > 1:1185985/1‑151 (MQ=255) ccTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACt < 1:921370/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACTTc > 2:803305/1‑151 (MQ=255) ggCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACTTCa < 1:1035877/150‑1 (MQ=255) gCGATCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTATCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACTTCAcc < 1:672491/151‑1 (MQ=255) aTCTCCTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACTTCACCgg > 2:349460/1‑150 (MQ=255) cTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACTTCACCGgag > 2:640487/1‑147 (MQ=255) cTACAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACTTCACCGgag > 1:939815/1‑147 (MQ=255) aCAGAGTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGCATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACTTCACCGGAGAGAtt > 2:134974/1‑150 (MQ=255) agTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACTTCACCGGAGAGATTacac > 1:686289/1‑150 (MQ=255) gTCTGGAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACTTCACCGGAGAGATTacacac > 2:127244/1‑151 (MQ=255) | ACAAGGCGCTTACAGACAATGCCTTAAGGAAAATTTCATATGAAAGTTAAGAATTAACAATCAACATTTTGATTTTAAATGAAAATAACGATTCTTATCTTTTTAAGTATTCGCTTATTTCCTGGCGATCTCCTACAGAGTCTGTAAGAGATCTCTCACAACCAGATGGGGTATTTGGATTACAGAAGAGGCTTAAGTTGATTAAGGAATTCCGCAAGATTTGAGGCTAAATGCGTCCGTTTACGTGTTCCCAGCGTCTCTTTGCACACTTCACCGGAGAGATTACACAC > NC_000913/2924556‑2924845 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |