| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 17,050 | 0 | A | C | 43.1% | 106.0 / 13.9 | 73 | intergenic (‑90/‑439) | mokC/nhaA | regulatory protein for HokC, overlaps CDS of hokC/sodium‑proton antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/11); new base C (0/31); total (30/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.13e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAA > NC_000913/16901‑17195 | cATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCa < 2:136194/150‑1 (MQ=255) tGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCAccc < 2:222099/150‑1 (MQ=255) gCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACccgc > 2:811842/1‑151 (MQ=255) gCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACccgc > 2:965650/1‑151 (MQ=255) gCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACccg < 1:392624/150‑1 (MQ=255) ctctctTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACccgcc > 1:365571/1‑151 (MQ=255) ctctTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGCCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACccgcc < 1:1028547/149‑1 (MQ=255) tctcCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCtatt > 1:34678/1‑151 (MQ=255) ccTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCtattat > 1:572466/1‑150 (MQ=255) cTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTatat > 2:658426/1‑151 (MQ=255) gACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGc > 1:1081735/1‑151 (MQ=255) ccTTCCGGTCAGAAAGAGGCCCTCTACATGTTTTCAGCATATAGGGGGCCTGGGTTTGATGGAAAAATATCACCCGGGTTTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTATTC‑CCTGAAACAGACACCCTCAACCACCCGCCGCTATTATATCGctc < 2:1007976/151‑1 (MQ=255) ggTCATAAAGAGCCACTCTACGTTTTTTCAACATATAGGGGCCCTGGGGTTGATTGAAAAATACCACTCGGGTTTTTTCTCTATCCCCCTTTCACTTAATG‑CTAAGGCCACACCGCCAAAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCttt < 2:114672/150‑1 (MQ=255) ggTCAGTAAGGGCCACTCTAAATGTGTTCAGAATATGGGGGGCCGGGGTTTGATGGAAAAATATCACGCGGGTTTTTTCTCTATCCCCCTTTCATTTAATC‑CCTGAGAAAGAACCCCAAAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCttt < 1:7473/150‑1 (MQ=255) aGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTGGGTTTGATGAAAAAATACCCCTCGGGTTTTTTCTCTTTCTGCCGTCCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACACCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCttt < 2:536165/146‑1 (MQ=255) aagggcccctctACATGTTTTCACCATATAGGGGGCCTGGGTTTGTTGTAAAAATACCCCGCGGGTTTTTTCTCTATCGGCCGTCCAGCAATTC‑CCTGAGAAAAACAGCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCAtt < 2:537417/143‑1 (MQ=255) gagcccctctACATGTGTTAAGAATAGGGGCGGCCTGGGGTTGATGAAAAAATATCCCTCGGGGTTTTTCTCTATCTGCCGTCCAGCTAATG‑CCGGAGACAGACAGCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCAtttt < 2:179798/145‑1 (MQ=255) ggCCCTTTACATGTTTTAAGCATATAGGGGGCCTGGGGTTGATGGAAAAATTTCACTGGGGTTTTTTCTTTATCTGCCTTTCAGATAATC‑CCTGAAACAGACAGCCTAAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTg < 2:770976/150‑1 (MQ=255) ggCACTCTACATTTGTTCAGCATAAAGGAGCCCTGGGGTTGATGAAAAAATACCCCGGGGGGTTTTTCTCTATCTGCCTTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGt < 2:466874/151‑1 (MQ=255) ggCACTCTACATGTTTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGTTTGATGGTAAAATATCCCTCGGGTTTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCAtttt < 2:1111242/149‑1 (MQ=255) cACTCTACATGTTTTCACCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGATAAAATATCACTCGGGGTTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAAACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGttt < 2:486366/151‑1 (MQ=255) tctACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTAt > 1:410834/1‑151 (MQ=255) ctACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATc > 2:357041/1‑151 (MQ=255) aCATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCg > 2:732784/1‑150 (MQ=255) gtgtTCAGCATATAGGTGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCt > 1:503109/1‑151 (MQ=255) tttccAGAATAGAGGGGGCCTGGGGTTAAGGATAAAATACCCCTCGGGCTTTTTCTCTAGCTGCCTTTCAACAAATG‑CCTAAGACAGACACCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTc < 2:1256405/145‑1 (MQ=255) tgtTCAGCATATAGGGGGCCTGGGGTTGATGAAAAAATATCACTGGGGTTTTTTCTCTTTCTCCCTTTCATATATTC‑CCTGAGACAAACCCCCTAAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCt < 1:563451/150‑1 (MQ=255) ttCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAAt > 2:998142/1‑151 (MQ=255) cATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTg > 2:1087304/1‑150 (MQ=255) tataGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGa > 1:346056/1‑149 (MQ=255) aggaggCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACg > 2:970315/1‑151 (MQ=255) ggaggCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGc > 2:193161/1‑151 (MQ=255) gaggCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGACGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGcc > 1:263865/1‑151 (MQ=255) ggtttgtggatAAAATATCCCGCGGGGTTTTTCTCGCTCGGCGGTTCAGCTAAGC‑CCAGAGACAGACCCCCTAAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCAttt < 2:154995/141‑1 (MQ=255) ggtttggtgaaaaaaTATCCCGCGGGCCTTTCCTTTACCTCCCTTTCAGTAAATC‑CCTAAGACAAACCCCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCa < 1:703789/137‑1 (MQ=255) ttGATGAAAAAATATCCCCCGGGTTTTTTCTCTATCTGCCTTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGCCACCCTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCAttttt < 2:597366/150‑1 (MQ=255) aaaaaTATCCTGCGGGCTTTTTCTCTTTCTGCCGTTCAGCTACTG‑CCTGAGCCAGACCGCCTCAACCGCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTa < 2:1237491/150‑1 (MQ=255) aaaaTTTCACGCGGGTTTTTTCTCTGTCTCGCTTCCAGCTAATG‑CGTGAGACAAACACCATCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTtgt < 2:37288/144‑1 (MQ=255) aaaaTATCCCGCGGGTTTTTTCTCTACCCGCCTTTAAGATAATG‑CCTAAGACAGACACCCTCACGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCg < 1:821021/148‑1 (MQ=255) aaaaTACCCCTGGGGTTTTTTCTCTATCCGCCTTTAAGCTAATC‑CCAAAGACAGACGGCCTAAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGc < 2:591921/147‑1 (MQ=255) cccccgggttttttCTCTATCTGCCGTTCAGCTATTG‑CTTGAGACAGACACCCTAAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTCAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAAtttttt < 2:1087617/140‑1 (MQ=255) cACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAAtttttt > 1:333534/1‑150 (MQ=255) aCTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTa > 2:1100220/1‑150 (MQ=255) gggttttttctttttctCCCGTTCAGCAAATG‑CCAGAGACAGACAGCCTAAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGAt < 2:770465/146‑1 (MQ=255) ggggCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGAt > 1:165863/1‑151 (MQ=255) gCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGAttt > 1:388817/1‑150 (MQ=255) ttttCTCTCTCCCCCTTTCAGTTAACC‑CCTGAGAAAGCCACCCACAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGAttt < 1:264727/148‑1 (MQ=255) ttCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAatt < 2:138005/150‑1 (MQ=255) tATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTa > 2:869621/1‑150 (MQ=255) aTCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAAc > 1:1087075/1‑151 (MQ=255) ccgactttacacTAATGCCCTGAACCAAACACCGTCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACt < 1:442225/140‑1 (MQ=255) gccctacagaaaaTG‑CCTGAGACGACCAGCCCCAGCCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTaa < 2:995188/135‑1 (MQ=255) ccttccAGTTATTG‑CCTAAAACAAACACCCTAAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACttt < 1:1067043/144‑1 (MQ=255) ccGTTCATCAATTG‑CGTGAGACACCCACCCCCACCCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACttt < 2:386501/149‑1 (MQ=255) cGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCCCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAattat < 2:313102/140‑1 (MQ=255) ttCAGTTAATG‑CCTAAGACAGCCACCTCCAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAAtt < 1:584533/150‑1 (MQ=255) ttCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACt > 2:442239/1‑144 (MQ=255) tccactaaaTG‑CCTGAGAAAGACACCCCCACGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAAtt < 2:673845/143‑1 (MQ=255) tccAGCTAATG‑ACTAAAACAACCCCCCCCAGGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAAc < 1:1236409/141‑1 (MQ=255) accTAATC‑CCGGAGACAAACACCCACAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTAt < 1:1187296/148‑1 (MQ=255) aGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTAtc > 2:360364/1‑151 (MQ=255) aaTG‑CTGGAAACACACACCCTAAACCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTAt < 2:880811/146‑1 (MQ=255) aaTG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCtt > 1:502279/1‑151 (MQ=255) aaTC‑CCTAAGACAGACACCCCCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATctct < 2:815603/150‑1 (MQ=255) gagaCAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGc > 1:126078/1‑150 (MQ=255) agacagacAGCCACAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCaa < 2:604302/151‑1 (MQ=255) acagacagCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAatt > 2:60769/1‑151 (MQ=255) acaaacacCCTCAACCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAat < 1:607186/150‑1 (MQ=255) cagacagCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAatt > 1:248690/1‑150 (MQ=255) aaacagCCTAAACCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAatta < 1:25875/148‑1 (MQ=255) accgCCTCAACCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAattatt < 1:362359/147‑1 (MQ=255) cacccTCAAGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTg < 1:577907/147‑1 (MQ=255) aaGCCCCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACaa < 2:572484/150‑1 (MQ=255) aaGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACa > 2:1167839/1‑149 (MQ=255) | CATTGCTCTCTTCTCCTTGACCTTACGGTCAGTAAGAGGCACTCTACATGTGTTCAGCATATAGGAGGCCTCGGGTTGATGGTAAAATATCACTCGGGGCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATG‑CCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAA > NC_000913/16901‑17195 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |