| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,744,313 | T→A | V286E (GTG→GAG) | mdtK → | multidrug efflux system transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,744,313 | 0 | T | A | 98.6% | 271.6 / ‑6.3 | 73 | V286E (GTG→GAG) | mdtK | multidrug efflux system transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (36/36); minor base G (1/0); total (37/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
GACTGATTCAACTCGGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAACCCTGACGGCCATTTTCACGGTTT > NC_000913/1744166‑1744459 | gACTGATTCAACTCGGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCt > 2:1190798/1‑151 (MQ=255) gATTCAACTCGGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCa < 1:1072571/151‑1 (MQ=255) ttCAACTCGGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGAAACTGTTTGACGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTGCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTcga < 1:826913/149‑3 (MQ=255) tCAACTCGGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAAt < 1:595076/150‑1 (MQ=255) tCAACTCGGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATg > 2:1176490/1‑151 (MQ=255) tCAACTCGGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATg > 2:1166490/1‑151 (MQ=255) aaCTCGGTTTGCGGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGCATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGTTTCCAATGTc > 1:1102628/1‑151 (MQ=255) aaCTCGGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTc < 1:7581/151‑1 (MQ=255) cGGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGc < 2:481008/149‑1 (MQ=255) cGGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCt < 2:225712/150‑1 (MQ=255) cGGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTCGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTg < 2:691817/151‑1 (MQ=255) gCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTggcggc > 2:1205517/1‑150 (MQ=255) gCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTggcggc < 1:844103/150‑1 (MQ=255) gATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCg > 2:807103/1‑151 (MQ=255) ttGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGt > 2:81637/1‑151 (MQ=255) ttGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGt > 1:754879/1‑151 (MQ=255) tGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGt < 1:1098635/150‑1 (MQ=255) tGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGt > 1:241345/1‑150 (MQ=255) cgcTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAAc < 1:980114/151‑1 (MQ=255) gcTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACt > 2:564685/1‑151 (MQ=255) gcTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACt > 1:982408/1‑151 (MQ=255) ggCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTTGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTAt < 2:1084421/150‑1 (MQ=255) aCTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTAACcgc > 1:479/1‑151 (MQ=255) cTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCcgc < 1:721221/150‑1 (MQ=255) tCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGGTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAg < 1:453913/150‑1 (MQ=255) tttGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGtt > 1:465225/1‑151 (MQ=255) ttGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGt < 2:811637/149‑1 (MQ=255) tGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTa < 1:553514/150‑1 (MQ=255) gAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGGTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGTCACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAACTTCCAATGTCGCTGGCTGCAGCGGTAACTATCCGCGGAGGGTAt > 2:342492/1‑150 (MQ=255) gAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATc < 2:586462/151‑1 (MQ=255) aGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCg > 2:559429/1‑150 (MQ=255) aGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGt < 1:963870/151‑1 (MQ=255) gACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCt < 1:316501/150‑1 (MQ=255) acTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTggg > 1:364478/1‑150 (MQ=255) acTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGt > 2:408901/1‑151 (MQ=255) gTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTc < 1:891191/149‑1 (MQ=255) ttGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAggg > 2:999100/1‑151 (MQ=255) tGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAggg > 1:397681/1‑150 (MQ=255) gCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGc > 1:857251/1‑150 (MQ=255) accGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGc > 1:379782/2‑150 (MQ=255) ggCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGGTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCt < 2:424516/150‑1 (MQ=255) ggCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCt < 1:906415/150‑1 (MQ=255) ggCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTg > 1:369194/1‑151 (MQ=255) ctGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGa > 1:212015/1‑149 (MQ=255) ttAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATgcgc > 2:871392/1‑151 (MQ=255) ccGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCt < 2:228583/150‑1 (MQ=255) cGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGcgcg < 2:181305/150‑1 (MQ=255) cGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACCAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCgg > 1:907715/1‑151 (MQ=255) aTTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGAcc < 2:398472/150‑1 (MQ=255) gttgATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGc < 2:493483/151‑1 (MQ=255) gttgATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGc > 2:867728/1‑151 (MQ=255) cAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATggtggg > 1:1181468/1‑151 (MQ=255) aGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATggtgggt < 2:418117/151‑1 (MQ=255) acacCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATggtgggtggc > 1:58796/1‑149 (MQ=255) acCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTg > 1:487112/1‑151 (MQ=255) ccAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGt < 2:691064/151‑1 (MQ=255) cAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGt > 1:376536/1‑150 (MQ=255) aGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAATCCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTAt < 1:134292/151‑1 (MQ=255) aGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTAt < 2:284985/151‑1 (MQ=255) ttGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGc > 2:481490/1‑151 (MQ=255) tGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGc < 2:659499/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGc > 1:1215670/1‑150 (MQ=255) cccTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAAc < 2:70733/151‑1 (MQ=255) gAACTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAACCCt < 2:58797/150‑1 (MQ=255) aCTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAACCCTGAc > 2:523733/1‑151 (MQ=255) aCTTTAGTTCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAACCCTGAc < 2:966442/151‑1 (MQ=255) tCACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAACCCTGACGGCCAtt < 1:766753/150‑1 (MQ=255) cACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAACCCTGACGGCCAttt < 2:468419/150‑1 (MQ=255) cACTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAACCCTGACGGCCAttt < 1:1022947/150‑1 (MQ=255) cTAATGTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAACCCTGACGGCCATTTTc > 2:257360/1‑150 (MQ=255) aTGTTCGGGTTTCCAATGTCGCTGGCCCCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGATCTCGTATGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCCAACCTCTGCGCCAACCGGGCTTCTGGTTTGGGACTGAATGGCCAGCCTAACGGCCATTTTCACgg > 1:1102028/1‑151 (MQ=255) gTTCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAACCCTGACGGCCATTTTCACGGtt > 1:682799/1‑151 (MQ=255) ttCGAGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAACCCTGACGGCCATTTTCACGGttt > 2:136127/1‑151 (MQ=255) | GACTGATTCAACTCGGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAACCCTGACGGCCATTTTCACGGTTT > NC_000913/1744166‑1744459 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |