| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 826,954 | 0 | A | T | 39.7% | 104.8 / 29.1 | 69 | I100N (ATT→AAT) | ybhS | putative ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/5); new base T (0/27); total (36/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.96e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCCAGATCCCTTCGACATACCCCTGTACAAAGTTAGCGGTATTCGGCTCACTGCCGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATCCCGACCCGCAGCTTG > NC_000913/826814‑827097 | gccagatcCCTTCGACATACCCCTGTACAAAGTTAGCGGTATTCGGCTCACTGCCGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTcc < 1:476073/147‑1 (MQ=255) cTTCGACATACCCCTGTACAAAGTTAGCGGTATTCGGCTCACTGCCGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCAtttt > 1:823946/1‑151 (MQ=255) aCATACCCCTGTACAAAGTTAGCGGTATTCGGCTCACTGCCGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCg > 1:116422/1‑150 (MQ=255) cATACCCCTGTACAAAGTTAGCGGTATTCGGCTCACTGCCGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGAt > 1:554903/1‑151 (MQ=255) aTACCCCTGTACAAAGTTAGCGGTATTCGGCTCACTGCCGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATc > 2:1091641/1‑151 (MQ=255) tcccccTGTAAAAGGTTAGCGGTTTTCGGCTCACTGCGGTGGGTGATCCCCTGAATCGGTGCGGTGGCGTGGGCGCGCTCCATCTTTC‑CCGCAAA‑ACCCCCC‑GGAATACCCACCAGACCGCGATTTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATc < 1:847302/148‑1 (MQ=255) tcccccTGTAAAAAGTATGCGGTTTCCGCCTCACCGCGGTCGTTGACCCCCTAAATCGGTGGGGTGGGGTGGGCGCGCTCCTTTTGTC‑CCGCAAA‑ATCCCCC‑GGAATACCCCCCAGCCCGAAATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGAt < 1:897525/147‑1 (MQ=255) tACCCCTGTACAAAGTTAGCGGTATTCGGCTCACTGCCGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATc > 2:994168/1‑150 (MQ=255) cTGTACAAAGTTAGCGGTATTCGGCTCACTGCCGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTcc > 1:1231397/1‑151 (MQ=255) aaaaaGTTGGGGGTATTCGGCTCCCTCCGGTGGGTGATCCCCTGAATGGGTGGGGTGGCTTGGGCGCCCTCCTTCTGTC‑CCGAAAA‑ACCCCCG‑GAAATACCCACCAGCCCGGGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCt < 1:12679/146‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGGCGGTGTTCGGCTCCCTGGCGGTGATCATCCCCTGAATCGGTGCGGTGGTGTGGGCCCGCTCCATCGGTC‑CCCCAAA‑ACCCCCC‑GCAATACCCTCCAGGCCGCAAGTTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTg < 1:619449/147‑1 (MQ=255) ttAGCGGTATTCGGCTCACTGCCGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTAt > 1:549841/1‑151 (MQ=255) ggTATTCGCCTCTGCCCCGTCGTTGACCCCCTAAACCGGTGGGGGGGCTTGGGCGCCCTCCTTCTTTT‑CCACAAA‑CCCCCCC‑AAAATACCCCCCGGCCCGCTATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGc < 1:628266/149‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCACTGCCGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGAt > 2:317902/1‑151 (MQ=255) cggcccccgcccGGCGGTGACCCCCTGAATCGGGGGGGTGGCGTGGGCGCGCCCCTTCTGTC‑CCAAAAA‑ACCCACG‑GAAATACCCACCAGACCGCGATTTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGAtggtg < 1:776991/141‑1 (MQ=255) cTCACTGCCGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCg > 1:954466/1‑151 (MQ=255) cGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGt > 1:1122734/1‑150 (MQ=255) cGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGt > 2:1174745/1‑150 (MQ=255) gTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGt > 1:256360/1‑149 (MQ=255) gTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGt > 1:1316187/1‑149 (MQ=255) cGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAggg > 1:410720/1‑151 (MQ=255) tGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCATCGATGTAGGGCg > 2:798762/1‑150 (MQ=255) gATCCCCTGAATGGGGGCGGTGGCTTGGGCCCGCT‑CTTTTGTTCCCCCAAA‑ATCCCCG‑GAAATAAACCCCGGGCAGCAAATTTGCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGGTCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGa < 2:688105/150‑1 (MQ=255) gATCCCCGGAATCGGGGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTC‑CCGAAAA‑ACCCCCC‑GAAATAACCCCCAGCCCGCAAATTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGaa < 1:420603/151‑1 (MQ=255) tCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAAcc > 1:1211475/1‑151 (MQ=255) ccccTGATTCGGTGGGTGGGCGTGGCCGCGCTCAATCTGTT‑CCGCAAA‑ACCCCAC‑GGAAAACCCACAAGCCCGGGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGAGCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGc < 2:5938/143‑1 (MQ=255) aCCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCgg > 1:840818/1‑151 (MQ=255) cctaacccggggcggggGGGTGGGCGCCCTCCATCTGTC‑CCGAAAA‑ACCCCCC‑GAAATACCCCCCAGACCGAGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGaa < 2:1231333/139‑1 (MQ=255) tGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTc > 2:1168568/1‑150 (MQ=255) tGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTc > 2:998534/1‑150 (MQ=255) actggttggtggggCGTTGGCGCGCCCCATCTTTC‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATACCCCCCAGACCGCTATTTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAAc < 1:89998/131‑1 (MQ=255) aaggggtggggggGCGTGGGCCCGCTCCATCTGTC‑CCAAAAA‑CCCCCCC‑GGAATACCCCCCAGCCCGAGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGt < 2:1101848/143‑1 (MQ=255) ggggtgggtggggCGCGCTCCTTTTGTC‑CCGCAAA‑TCCCCCC‑GGATAAACCACC‑GCCCCCTGATTTCCCACCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAgggtg < 2:250315/122‑3 (MQ=255) gcggtgGCGTTGGCGCCCTCCATCTTTC‑CCGAAAA‑ACCCCCC‑GAAATACCCCCCAGCCCGCGATTTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGtgtg < 1:395551/149‑1 (MQ=255) ggtggtGTTGGCGCCCTCCATCTGTT‑CCAAAAA‑ACCCACG‑GAAATACCCACCAGCCCGGGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTgg < 1:914265/148‑1 (MQ=255) ggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAGA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTg > 2:1135618/1‑151 (MQ=255) ggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGt > 2:936813/1‑150 (MQ=255) ggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTg > 2:1216255/1‑151 (MQ=255) gTTGGCGCGCTCTATCTGTA‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATc > 2:329466/1‑150 (MQ=255) ggcccccTCCTTCTGTC‑CCAAAAA‑ACCCCCC‑GAAATACCCCCCGGCCCGGAAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATc < 1:360621/141‑1 (MQ=255) ggCGCGCCCCACCTTTC‑CCGCAAA‑CGCCCCC‑GAAATAACCACCCGGCCGCTATTTTTCG‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGGCGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCa < 2:453793/149‑1 (MQ=255) gcctccccccctttGTC‑CCGAAAA‑CCCCCCC‑GAAAAACCCCCCAGACCCCGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAg < 2:903098/137‑1 (MQ=255) cgcTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGcgccg > 2:538180/1‑151 (MQ=255) gcTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGcgccgc > 1:1114343/1‑151 (MQ=255) ccATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTc > 2:808812/1‑151 (MQ=255) cttCTGTC‑CCGAAAA‑ACCCCCG‑GAAATACCCCCCAGCCCGCGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCtt < 1:856325/147‑1 (MQ=255) cATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTc > 1:74747/1‑150 (MQ=255) aTCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGc > 2:1272684/1‑151 (MQ=255) tctttgcGCAAAGATCCCCC‑GTAATAACCACAAGCCGGCGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAgc < 1:284511/134‑1 (MQ=255) aaa‑aTCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTcc > 1:919098/1‑151 (MQ=255) aaa‑aTCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTc > 1:1238418/1‑150 (MQ=255) aa‑aTCCCCCGGGAATACCCACCACCCCGAGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGc < 2:1075575/145‑1 (MQ=255) ccccagaaaaaccccccaGCCCGCGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTaa < 2:325540/136‑1 (MQ=255) cACC‑GAAATAACCCCCAGCCCGCGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTaaa < 2:116418/151‑1 (MQ=255) cc‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAAt > 2:967460/1‑151 (MQ=255) cc‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAAt > 1:908156/1‑151 (MQ=255) gcaaTACCCCCCAGACCGCGATTTTTCT‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATcc < 2:1008556/149‑1 (MQ=255) aaTACCCCCCAGCCCGCATTTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATc < 2:948477/148‑1 (MQ=255) tAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATCCCGAc > 2:956493/1‑151 (MQ=255) cccccaGCCCGGGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATCCCGa < 1:371404/144‑1 (MQ=255) acccGACCGCGAATTTTCC‑CCGCAGGCATTTTTGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGTTAGTGGTGACGATGTAGGTTGAACCGGTCATGGGGTGGGTGATATCCACCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGCAAACTCCCGAACCGc > 2:1107989/1‑150 (MQ=255) accaGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATCCCGACCCGc > 1:333840/1‑150 (MQ=255) aGACCGGGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATCCCGACCCGCa < 1:1237019/148‑1 (MQ=255) gACCGCGATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATCCCGACCCGCAg < 1:1179052/148‑1 (MQ=255) gACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATCCCGACCCGCAGCtt > 2:1061086/1‑151 (MQ=255) ccGCTATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATCCCGACCCGCAGCTTg < 2:1272626/150‑1 (MQ=255) ccGCAATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATCCCGACCCGCa < 2:763210/145‑1 (MQ=255) ccGCAATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATCCCGACCCGCAg < 2:1041259/146‑1 (MQ=255) ccGCAATTTTCCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATCCCGACCCGCAGCtt < 1:70541/149‑1 (MQ=255) | GCCAGATCCCTTCGACATACCCCTGTACAAAGTTAGCGGTATTCGGCTCACTGCCGTCGGTGATCACCTGAATCGGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTT‑CCGCAAA‑ATCCACC‑GGAATAACCACCAGACCGCGAATTTTCC‑CCGCCTGCATTTTGGCGATCAGTTCCTGACGGTTATCGCTGATGGTGGCGTCGATGTAGGGCGAACCGGTCATGGTGTGGGTGAAATCCAGCGCCGCTTCGCTACGCTGTTCCAGTAAAATCCCGACCCGCAGCTTG > NC_000913/826814‑827097 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |